More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1608 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1864  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  75.43 
 
 
411 aa  635    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.800927  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2682  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  73.72 
 
 
407 aa  640    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1608  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  100 
 
 
411 aa  848    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1093  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  74.45 
 
 
404 aa  642    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.560821 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3758  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  75.06 
 
 
406 aa  632  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00999725  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1689  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  75.69 
 
 
413 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.79324 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  71.25 
 
 
452 aa  595  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0722667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2150  cystathionine gamma-synthase  77.36 
 
 
414 aa  595  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2735  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  71.01 
 
 
404 aa  594  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.484206  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2225  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  70.76 
 
 
404 aa  593  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.833274  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4382  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.89 
 
 
394 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.258823  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3055  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  61.88 
 
 
394 aa  507  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0877  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.9 
 
 
393 aa  498  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0710283 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1907  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.56 
 
 
389 aa  497  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2873  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.6 
 
 
396 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6834  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.373794  normal  0.455704 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1905  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.75 
 
 
395 aa  485  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1691  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.23 
 
 
392 aa  487  1e-136  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.557417 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3966  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0704678  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0687  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
405 aa  482  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160219  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4401  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2437  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
423 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.391584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1713  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.292156  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  60.55 
 
 
401 aa  480  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1721  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.4 
 
 
404 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.274842 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0761  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
405 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.203208  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2063  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.4 
 
 
404 aa  481  1e-134  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.154855  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2117  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.86 
 
 
396 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.175356 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2299  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
423 aa  481  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.21935  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1866  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
423 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1657  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.85 
 
 
396 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0537  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.42 
 
 
423 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3861  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.02 
 
 
410 aa  475  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4614  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.86 
 
 
396 aa  476  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.162026  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0779  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.62 
 
 
402 aa  473  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000704939  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2459  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.01 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00148709  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3356  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.53 
 
 
410 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1042  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.51 
 
 
402 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.37384 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0809  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.76 
 
 
397 aa  467  9.999999999999999e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.7 
 
 
393 aa  468  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2710  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.34 
 
 
403 aa  464  1e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.531318  normal  0.420206 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2026  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.5 
 
 
403 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0235918  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1669  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.75 
 
 
403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.813893  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1268  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.57 
 
 
402 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.373712  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1929  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.36 
 
 
396 aa  443  1e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34140  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.75 
 
 
403 aa  443  1e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2488  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  58.57 
 
 
383 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23930  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  59.25 
 
 
403 aa  440  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2071  dihydrolipoamide dehydrogenase  56.46 
 
 
397 aa  436  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.667467  normal  0.823205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2001  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.86 
 
 
403 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3810  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.5 
 
 
403 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3760  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.61 
 
 
403 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.192892  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  54.75 
 
 
403 aa  431  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1151  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  57.14 
 
 
399 aa  431  1e-119  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1797  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.18 
 
 
397 aa  429  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.697099  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1535  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.25 
 
 
403 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.47488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1562  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  55.75 
 
 
403 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.272758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1243  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  53.33 
 
 
406 aa  426  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1551  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  56.75 
 
 
407 aa  407  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.75247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2049  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.27 
 
 
391 aa  405  1e-111  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1730  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  50 
 
 
434 aa  403  1e-111  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000563319  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0409  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.57 
 
 
396 aa  382  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.384656  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0798  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  48.74 
 
 
422 aa  379  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.40297  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3645  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  46.17 
 
 
402 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1511  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  51.02 
 
 
396 aa  377  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00343011  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0792  cystathionine gamma-synthase  48.26 
 
 
424 aa  378  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.145563  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3860  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.66 
 
 
402 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0688  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.16 
 
 
411 aa  370  1e-101  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.175139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1942  cystathionine gamma-synthase  48.6 
 
 
396 aa  368  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00385575  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2947  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.42 
 
 
419 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0219  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.61 
 
 
407 aa  363  4e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.897628  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0513  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.97 
 
 
410 aa  360  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.047245  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35030  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.61 
 
 
417 aa  358  9.999999999999999e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1496  cystathionine gamma-lyase  43.83 
 
 
390 aa  357  1.9999999999999998e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10395  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.89 
 
 
406 aa  355  7.999999999999999e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00173886  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5251  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 
403 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.903252  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0516  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.75 
 
 
412 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0538  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.75 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0985823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0526  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.75 
 
 
412 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0768  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.23 
 
 
402 aa  350  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00770297  hitchhiker  0.00215966 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2665  cystathionine gamma-synthase  44.05 
 
 
402 aa  351  2e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.6869  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0903  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.78 
 
 
408 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1236  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.24 
 
 
400 aa  350  3e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.43898  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3103  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.25 
 
 
394 aa  350  4e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2639  cystathionine beta-lyase/cystathionine gamma-synthase  42.86 
 
 
391 aa  348  9e-95  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1425  Methionine gamma-lyase  43.15 
 
 
388 aa  348  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1854  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  45.29 
 
 
397 aa  348  1e-94  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.58476  decreased coverage  0.00243487 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1938  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.42 
 
 
395 aa  348  1e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.168999 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0139  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.48 
 
 
397 aa  347  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0791  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.28 
 
 
408 aa  347  3e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1198  cystathionine gamma-synthase  45.06 
 
 
414 aa  346  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2410  trans-sulfuration enzyme family protein  45.13 
 
 
392 aa  345  1e-93  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1661  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  42.61 
 
 
394 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.224768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1016  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.18 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00284664 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4298  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  43.22 
 
 
398 aa  343  2.9999999999999997e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_004310  BR0305  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.33 
 
 
398 aa  341  1e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.226958  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0318  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  44.33 
 
 
401 aa  342  1e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4034  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  41.34 
 
 
404 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1998  O-succinylhomoserine sulfhydrylase  47.58 
 
 
409 aa  342  1e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.469724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>