53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1542 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  980    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  50.1 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  45.4 
 
 		 520 aa  413  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  47.59 
 
 		 514 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  45.69 
 
 		 503 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  29.31 
 
 		 345 aa  144  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  28.18 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  27.97 
 
 		 344 aa  143  8e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  27.97 
 
 		 344 aa  142  9e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  28.33 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  28.15 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  29.66 
 
 		 345 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  28.15 
 
 		 345 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  30.37 
 
 		 424 aa  127  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  27.44 
 
 		 349 aa  120  7e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  25.11 
 
 		 347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  27.12 
 
 		 371 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  27.88 
 
 		 420 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  33.33 
 
 		 566 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  31.2 
 
 		 344 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  27.97 
 
 		 406 aa  102  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  31.8 
 
 		 345 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  35.21 
 
 		 523 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  30.28 
 
 		 595 aa  93.2  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  31.3 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.94 
 
 		 432 aa  90.1  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.52 
 
 		 831 aa  89  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.06 
 
 		 721 aa  85.1  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  30.59 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  32.55 
 
 		 337 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  32.55 
 
 		 337 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  29.83 
 
 		 396 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  27.8 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  29.05 
 
 		 407 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  30.45 
 
 		 530 aa  79.7  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  29.36 
 
 		 349 aa  77  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  29.49 
 
 		 416 aa  77  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.22 
 
 		 456 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  29.09 
 
 		 367 aa  70.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  33.97 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  28.3 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.472406 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  25.12 
 
 		 632 aa  70.1  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  32.1 
 
 		 514 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  28.37 
 
 		 393 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  28.37 
 
 		 777 aa  68.6  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  32.33 
 
 		 411 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  28.97 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  33.12 
 
 		 383 aa  64.3  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  30.82 
 
 		 364 aa  63.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  27.34 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  37.17 
 
 		 746 aa  57.8  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  25.29 
 
 		 336 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  25.2 
 
 		 334 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>