More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1425 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1425  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3926  transcriptional regulator, GntR family  86.88 
 
 		 224 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173644  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1112  GntR family transcriptional regulator  80.09 
 
 		 221 aa  355  3.9999999999999996e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2111  GntR family transcriptional regulator  79.19 
 
 		 225 aa  350  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.277645  normal  0.0294068 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1118  GntR family transcriptional regulator  80.09 
 
 		 225 aa  330  8e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.232597  normal  0.166977 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1038  transcriptional regulator, GntR family  80.09 
 
 		 225 aa  330  8e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1101  GntR family transcriptional regulator  59.81 
 
 		 259 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.178895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0778  GntR family transcriptional regulator  57.53 
 
 		 253 aa  221  7e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3445  GntR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3280  GntR family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 230 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3147  transcriptional regulator, GntR family  45.41 
 
 		 246 aa  179  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3474  transcriptional regulator, GntR family  44.93 
 
 		 246 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3276  transcription regulator protein  45.81 
 
 		 229 aa  177  9e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.693233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0428  transcriptional regulator, GntR family  41.78 
 
 		 255 aa  164  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.65094  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3937  transcriptional regulator, GntR family  38.36 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0563072  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0549  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 255 aa  162  4.0000000000000004e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1052  GntR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 248 aa  157  8e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0904043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1096  GntR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 277 aa  157  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2064  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  156  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1511  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2536  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2435  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303116  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3300  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2010  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1282  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.932176  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2392  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 231 aa  155  3e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4283  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0169615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1990  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.964349 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1281  GntR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6111  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1966  GntR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 234 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 254 aa  154  8e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3847  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458014 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3609  GntR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.376641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5281  GntR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0412197 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0334  GntR family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 228 aa  152  5e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.389251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2660  transcriptional regulator, GntR family  40.49 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.182279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4275  transcriptional regulator, GntR family  39.91 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.616941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1296  transcriptional regulator, GntR family  40.48 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.032312  normal  0.299541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  37.73 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1304  GntR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 234 aa  149  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0497792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  38.5 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2332  transcriptional regulator, GntR family  40.1 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.738063 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5787  GntR family transcriptional regulator  41.62 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00572916 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3471  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 259 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0680  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.231512  normal  0.107075 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1922  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.430018 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1881  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 234 aa  145  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.249163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1303  GntR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 238 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3813  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.12567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3949  transcriptional regulator, GntR family  40.91 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  37.27 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5540  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.347877 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1099  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 231 aa  143  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1954  GntR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1007  GntR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.511541  hitchhiker  0.00101659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2921  transcriptional regulator, GntR family  39 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.277929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0236  GntR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 228 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1419  GntR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.17694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3609  GntR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 246 aa  134  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1364  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 244 aa  134  9e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0686539 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5254  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 250 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.506774 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3638  hypothetical protein  39.9 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.513406  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0459  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3664  transcriptional regulator, GntR family  38.03 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0399  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3272  GntR family transcriptional regulator  38.28 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2161  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 231 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111337  normal  0.915655 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4065  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3339  GntR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2079  GntR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.420159  normal  0.766393 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3666  transcriptional regulator, GntR family  36.87 
 
 		 260 aa  131  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.216999  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0069  GntR family transcriptional regulator  37 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6280  transcriptional regulator GntR family  39 
 
 		 236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3833  GntR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 242 aa  129  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.644681  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0403  GntR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 238 aa  129  3e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000148823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4418  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 236 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.494465  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0737  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.268562  normal  0.925546 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5379  transcriptional regulator, GntR family  38.42 
 
 		 252 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2469  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  126  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0205  GntR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 268 aa  125  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134484 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7611  transcriptional regulator GntR family  38.42 
 
 		 250 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5905  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3301  GntR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0494  GntR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 245 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.708073 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5617  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.222304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3189  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3930  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 237 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.709239  normal  0.547681 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4006  GntR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 259 aa  116  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.477565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5125  transcriptional regulator, GntR family  37.11 
 
 		 243 aa  115  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2253  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218359  normal  0.132912 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2117  transcription regulator protein  38.05 
 
 		 250 aa  115  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.930818 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1964  transcriptional regulator, GntR family  39.47 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3443  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 235 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0659534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5667  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1934  transcriptional regulator, GntR family  37.43 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0424955 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3485  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122835  normal  0.855003 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0884  GntR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 247 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.216104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3141  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167888  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>