165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1379 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1379  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 385 aa  785    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.366472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3222  transcriptional regulator, LuxR family  70.63 
 
 		 385 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.566804  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4474  LuxR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 398 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5178  transcriptional regulator, LuxR family  32.65 
 
 		 411 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3777  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 377 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0201784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2794  LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 378 aa  150  5e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2379  transcriptional regulator, LuxR family  25.56 
 
 		 377 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207918  decreased coverage  0.00252302 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1619  LuxR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 405 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00646137  normal  0.376229 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0385  regulatory protein LuxR  27.54 
 
 		 378 aa  87.8  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5497  LuxR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5960  LuxR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.37192  normal  0.013612 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3041  transcriptional regulator, LuxR family  26.6 
 
 		 405 aa  86.3  8e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.514708  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0601  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0424848  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0614  LuxR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 362 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3622  LuxR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 381 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.75825 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6838  LuxR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 379 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1539  LuxR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.183723  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1529  LuxR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 383 aa  82.8  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.824388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0592  LuxR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 362 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3356  regulatory protein, LuxR  29.58 
 
 		 373 aa  80.9  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.734282 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0561  hypothetical protein  26.68 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930212  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6379  LuxR family transcriptional regulator  28 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1993  LuxR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.389797  normal  0.0150442 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2405  LuxR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 402 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1555  regulatory protein, LuxR  25.72 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2412  hypothetical protein  27.76 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.390021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0560  regulatory protein, LuxR  23.18 
 
 		 369 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1991  LuxR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2135  LuxR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0576  transcriptional regulator, LuxR family  23.59 
 
 		 367 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1407  LuxR family transcriptional regulator  25.09 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5209  LuxR family regulatory protein  26.6 
 
 		 378 aa  72  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0906  regulatory protein LuxR  22.45 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6093  LuxR family transcriptional regulator  25.07 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0040  transcriptional regulator, LuxR family  25.07 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.864605  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1883  response regulator receiver protein  19.19 
 
 		 374 aa  68.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.648739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3089  LuxR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 416 aa  67.4  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1992  LuxR family transcriptional regulator  23.1 
 
 		 377 aa  66.6  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0260195 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3054  LuxR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.811435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3288  transcriptional regulator, LuxR family  25.26 
 
 		 375 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.272841 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3595  LuxR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 381 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.351896  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7444  LuxR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4636  LuxR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 378 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.780635  normal  0.0614511 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5666  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.547238  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6030  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.795046  normal  0.297975 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0782  response regulator receiver protein  19.79 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.650923  normal  0.69982 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6520  LuxR family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 363 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.514397 
 
 
-
 
NC_003296  RS02602  putative transcription regulator protein  29.03 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.125932  normal  0.252722 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1493  transcriptional regulator, LuxR family  39.67 
 
 		 370 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4240  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4350  transcriptional regulator, LuxR family  27.52 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.626304 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3545  LuxR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0027  LuxR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3539  transcriptional regulator, LuxR family  29.07 
 
 		 229 aa  55.8  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.184303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7854  hypothetical protein  25.94 
 
 		 392 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.265912 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5486  LuxR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 367 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.82971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3562  regulatory protein, LuxR  25.56 
 
 		 393 aa  53.1  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4220  LuxR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 222 aa  52.8  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.848445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3333  putative GAF sensor protein  26.09 
 
 		 337 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000024047  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03074  putative transcription regulator protein  28.68 
 
 		 380 aa  52.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3415  transcriptional regulator, LuxR family  23.36 
 
 		 394 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.127954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0499  LuxR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.621356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3907  putative transcriptional regulator  25.22 
 
 		 392 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.488237 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2272  transcriptional regulator, LuxR family  25.21 
 
 		 388 aa  52  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5990  LuxR family transcriptional regulator  22.85 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0414123 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3095  regulatory protein LuxR  23.36 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1758  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 374 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1687  transcriptional regulator, LuxR family  46.88 
 
 		 376 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3324  LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 314 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3311  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 321 aa  50.8  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.479786 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4049  response regulator receiver protein  45.9 
 
 		 275 aa  50.8  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00251355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1995  regulatory protein LuxR  25.48 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3845  LuxR family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 372 aa  50.1  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.115586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0500  regulatory protein, LuxR  21.07 
 
 		 350 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3188  LuxR family transcriptional regulator  25 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0110301  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5414  LuxR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 191 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5477  regulatory protein, LuxR  23.81 
 
 		 378 aa  48.9  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1052  regulatory protein, LuxR  27.4 
 
 		 325 aa  49.3  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.7 
 
 		 228 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1027  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 222 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3555  response regulator receiver protein  38.36 
 
 		 176 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0548987 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2418  LuxR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 191 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02650  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  35.82 
 
 		 505 aa  48.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2035  alpha/beta hydrolase fold  38.1 
 
 		 586 aa  48.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0602  nitrate/nitrite response regulator  40 
 
 		 219 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.790372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0035  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 187 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0538241 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11180  putative transcriptional regulator  37.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0312289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0408  regulatory protein, LuxR  27.75 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3340  regulatory protein, LuxR  26.59 
 
 		 364 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.212677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3314  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.92 
 
 		 222 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00833126  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2317  LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 201 aa  47  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000209491  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13460  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  38.98 
 
 		 472 aa  47  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3046  LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.343471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2073  regulatory protein, LuxR  25 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04789  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 232 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.814651  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1746  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.59096  normal  0.157721 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 213 aa  46.6  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0541  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.73 
 
 		 221 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.318618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1533  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 137 aa  46.2  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.717435  normal  0.7082 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3096  regulatory protein, LuxR  35.94 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.735562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>