More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1371 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1371  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1036  hypothetical protein  83.17 
 
 
246 aa  354  8.999999999999999e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.285404  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2108  hypothetical protein  72.64 
 
 
256 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327419  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3213  hypothetical protein  70.48 
 
 
246 aa  305  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3692  hypothetical protein  69.81 
 
 
227 aa  298  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3355  hypothetical protein  48.36 
 
 
262 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2072  hypothetical protein  46.72 
 
 
263 aa  200  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00109635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4466  hypothetical protein  46.78 
 
 
263 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.354651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3468  hypothetical protein  47.66 
 
 
263 aa  199  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3412  hypothetical protein  46.81 
 
 
268 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0770  hypothetical protein  45.85 
 
 
263 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3801  hypothetical protein  48.86 
 
 
257 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5841  hypothetical protein  48.1 
 
 
261 aa  189  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6267  hypothetical protein  44.1 
 
 
263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0194247  normal  0.315847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0980  class II aldolase/adducin-like  47.11 
 
 
254 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112638  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0321  hypothetical protein  45.76 
 
 
262 aa  180  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_6293  predicted protein  50.52 
 
 
205 aa  176  3e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.000494252 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0534  hypothetical protein  43.08 
 
 
249 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1369  class II aldolase/adducin family protein  37.55 
 
 
247 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2461  hypothetical protein  41.46 
 
 
244 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3023  hypothetical protein  39.91 
 
 
249 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.405547 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  36.71 
 
 
246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  36.59 
 
 
252 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  38.43 
 
 
282 aa  125  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2007  hypothetical protein  35.55 
 
 
242 aa  125  9e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  38.16 
 
 
263 aa  124  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  35.94 
 
 
267 aa  124  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  35.47 
 
 
258 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  35.9 
 
 
258 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  37.98 
 
 
251 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  35.19 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  36.7 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  37.5 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  36.29 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  39.11 
 
 
256 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  29.49 
 
 
251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  36.32 
 
 
259 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  32.48 
 
 
257 aa  119  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0279  hypothetical protein  36.95 
 
 
241 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.400085 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0438  hypothetical protein  36.06 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.433605  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  34.33 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
259 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  35.44 
 
 
258 aa  116  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  32.49 
 
 
259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  35.04 
 
 
258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  35.47 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  35.47 
 
 
257 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  31.65 
 
 
259 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  37.26 
 
 
252 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  35.32 
 
 
258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  32.67 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  35.78 
 
 
256 aa  113  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  35.24 
 
 
264 aa  113  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  32.49 
 
 
260 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  35.02 
 
 
258 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  35.04 
 
 
258 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  33.6 
 
 
265 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  32.31 
 
 
255 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  37.2 
 
 
261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  32.49 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  32.91 
 
 
257 aa  109  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
259 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  33.66 
 
 
255 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  33.49 
 
 
255 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  33.66 
 
 
255 aa  108  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  36.79 
 
 
257 aa  107  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  33.33 
 
 
274 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  31.88 
 
 
255 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3870  hypothetical protein  36.6 
 
 
274 aa  107  2e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.685954  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  34.91 
 
 
259 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  35.34 
 
 
257 aa  106  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  29.11 
 
 
250 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  33.67 
 
 
256 aa  106  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  34.91 
 
 
262 aa  105  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  37.61 
 
 
257 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  35.92 
 
 
277 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  32.92 
 
 
274 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  33.03 
 
 
262 aa  105  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  32.49 
 
 
259 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7790  hypothetical protein  33.33 
 
 
263 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  33.47 
 
 
260 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  33.33 
 
 
256 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  32.33 
 
 
244 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  31.8 
 
 
264 aa  100  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  33.76 
 
 
331 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  33.49 
 
 
261 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  33.18 
 
 
237 aa  101  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  34.18 
 
 
250 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  32.48 
 
 
250 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>