More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1369 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  100 
 
 		 509 aa  967    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  58.46 
 
 		 562 aa  542  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  58.52 
 
 		 517 aa  495  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  53.32 
 
 		 514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  56.11 
 
 		 575 aa  456  1e-127  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  52.98 
 
 		 501 aa  446  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  51.49 
 
 		 524 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 529 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  52.32 
 
 		 584 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  54.29 
 
 		 521 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  51.99 
 
 		 526 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  52.37 
 
 		 528 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  56.26 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  52.23 
 
 		 513 aa  435  1e-120  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  52.51 
 
 		 536 aa  422  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  51.98 
 
 		 558 aa  415  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  54.56 
 
 		 496 aa  414  1e-114  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  47.77 
 
 		 518 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 601 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  48.41 
 
 		 528 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  52.61 
 
 		 540 aa  405  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  47.7 
 
 		 541 aa  400  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  48.7 
 
 		 553 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  50.94 
 
 		 506 aa  395  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  51.48 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  44.56 
 
 		 509 aa  394  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  52.04 
 
 		 502 aa  385  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  45.58 
 
 		 509 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 588 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  51.39 
 
 		 539 aa  382  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  46.87 
 
 		 535 aa  376  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  47.8 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  46.08 
 
 		 533 aa  369  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  45.02 
 
 		 508 aa  372  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  45.62 
 
 		 509 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  52.35 
 
 		 477 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  44.25 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 513 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  45.33 
 
 		 554 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  52.03 
 
 		 528 aa  360  4e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  49.37 
 
 		 513 aa  359  6e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 525 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  45.34 
 
 		 525 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 525 aa  356  6.999999999999999e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8664  major facilitator superfamily MFS_1  45.81 
 
 		 514 aa  353  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.854062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  43.69 
 
 		 537 aa  353  4e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  46.46 
 
 		 497 aa  349  7e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  43.03 
 
 		 519 aa  347  4e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  49.01 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  45.4 
 
 		 505 aa  342  1e-92  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  46.75 
 
 		 524 aa  341  2e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  46.81 
 
 		 535 aa  340  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  46.09 
 
 		 555 aa  333  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  42.17 
 
 		 490 aa  323  6e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  43.51 
 
 		 503 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  46.25 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 517 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  40.44 
 
 		 516 aa  289  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  41.15 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  40.83 
 
 		 517 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  44.78 
 
 		 511 aa  276  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1002  permease, MFS  41.99 
 
 		 516 aa  266  5.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  36.84 
 
 		 500 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  37.58 
 
 		 516 aa  263  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 538 aa  262  8.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35770  Major Facilitator Superfamily transporter  40.4 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.255098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 		 511 aa  261  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  37.62 
 
 		 503 aa  260  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 520 aa  259  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  35.14 
 
 		 500 aa  258  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  38.1 
 
 		 514 aa  253  8.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  39.84 
 
 		 513 aa  250  4e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.51 
 
 		 534 aa  248  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 500 aa  246  6.999999999999999e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1370  major facilitator superfamily MFS_1  40.75 
 
 		 506 aa  246  8e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.03 
 
 		 510 aa  246  9e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.23 
 
 		 525 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3997  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.69 
 
 		 626 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00240753  normal  0.239181 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  35.93 
 
 		 495 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  35.93 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  35.93 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  35.93 
 
 		 495 aa  236  5.0000000000000005e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  35.93 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.38 
 
 		 522 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  37.83 
 
 		 523 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 		 496 aa  233  6e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 504 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  35.4 
 
 		 503 aa  229  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  35.98 
 
 		 494 aa  227  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  33.53 
 
 		 532 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.06 
 
 		 607 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  36.93 
 
 		 510 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  32.8 
 
 		 495 aa  223  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3408  major facilitator superfamily MFS_1  37.86 
 
 		 524 aa  221  1.9999999999999999e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4342  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.06 
 
 		 520 aa  219  8.999999999999998e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.39 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  38.86 
 
 		 501 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>