186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1269 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1269  MmgE/PrpD  100 
 
 		 463 aa  947    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0407  MmgE/PrpD family protein  71.09 
 
 		 456 aa  662    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.544537 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0482  MmgE/PrpD family protein  69.41 
 
 		 457 aa  686    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1268  MmgE/PrpD family protein  53.19 
 
 		 455 aa  472  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2141  MmgE/PrpD family protein  52.91 
 
 		 488 aa  462  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.628932 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1360  MmgE/PrpD family protein  51.17 
 
 		 483 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.737608  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0883  MmgE/PrpD family protein  51.64 
 
 		 481 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.585439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2745  hypothetical protein  49.22 
 
 		 482 aa  437  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.183054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4091  hypothetical protein  43.76 
 
 		 451 aa  311  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.42622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6206  MmgE/PrpD family protein  44 
 
 		 451 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0971  hypothetical protein  37.85 
 
 		 471 aa  281  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5792  MmgE/PrpD family protein  39.55 
 
 		 461 aa  280  6e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.205473  normal  0.299026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1910  hypothetical protein  37.67 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3581  MmgE/PrpD family protein  33.33 
 
 		 453 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.604157  normal  0.0576732 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3583  MmgE/PrpD family protein  35.32 
 
 		 462 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0329422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0172  MmgE/PrpD family protein  30.97 
 
 		 451 aa  185  1.0000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3985  MmgE/PrpD family protein  31.1 
 
 		 450 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1004  putative MmgE/Prp family protein  31.44 
 
 		 458 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0284  putative MmgE/Prp family protein  33.18 
 
 		 500 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1585  MmgE/PrpD family protein  33.7 
 
 		 482 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0449825  hitchhiker  0.00338638 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1226  hypothetical protein  32.55 
 
 		 490 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3582  MmgE/PrpD family protein  33.59 
 
 		 451 aa  179  9e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0594439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4176  MmgE/PrpD family protein  32.66 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2225  MmgE/PrpD family protein  33.76 
 
 		 503 aa  176  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3457  MmgE/PrpD family protein  32.11 
 
 		 462 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0718329  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5368  hypothetical protein  29.72 
 
 		 451 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.775637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1260  putative MmgE/Prp family protein  32.91 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3028  MmgE/PrpD family protein  32.91 
 
 		 503 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0206  MmgE/PrpD family protein  29.38 
 
 		 449 aa  166  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6148  MmgE/PrpD family protein  31.52 
 
 		 442 aa  165  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1760  MmgE/PrpD family protein  32.15 
 
 		 445 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4067  MmgE/PrpD family protein  34.32 
 
 		 468 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.530176  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1882  MmgE/PrpD family protein  30.42 
 
 		 443 aa  164  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0496  MmgE/PrpD family protein  30.4 
 
 		 461 aa  164  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6636  MmgE/PrpD family protein  32.38 
 
 		 457 aa  163  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.29162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4633  hypothetical protein  31.13 
 
 		 450 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4177  MmgE/PrpD family protein  30.45 
 
 		 441 aa  159  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3608  MmgE/PrpD family protein  30.56 
 
 		 468 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.351268  normal  0.839729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52880  hypothetical protein  30.91 
 
 		 450 aa  159  8e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21260  MmgE/PrpD family protein  32.5 
 
 		 456 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0705  MmgE/PrpD  31.05 
 
 		 458 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0146  MmgE/PrpD  30.7 
 
 		 457 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0564  MmgE/PrpD family protein  30.32 
 
 		 454 aa  158  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0016  hypothetical protein  30.59 
 
 		 456 aa  157  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18590  uncharacterized protein involved in propionate catabolism  33.33 
 
 		 465 aa  157  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3986  MmgE/PrpD family protein  29.7 
 
 		 441 aa  155  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6170  MmgE/PrpD family protein  31.88 
 
 		 458 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3107  MmgE/PrpD family protein  32.48 
 
 		 447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.367847  normal  0.515928 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3540  MmgE/PrpD  33.41 
 
 		 457 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10861  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01619  conserved hypothetical protein  29.76 
 
 		 501 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.17235 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1168  MmgE/PrpD family protein  27.59 
 
 		 456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3094  MmgE/PrpD family protein  33.04 
 
 		 453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6463  MmgE/PrpD family protein  31.59 
 
 		 458 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.672209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4085  MmgE/PrpD family protein  31.7 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3318  MmgE/PrpD family protein  29.52 
 
 		 477 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.501682  normal  0.16502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3898  hypothetical protein  34.19 
 
 		 459 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.125384  normal  0.388647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3047  MmgE/PrpD family protein  31.69 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.110565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0367  MmgE/PrpD  31.13 
 
 		 455 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1583  MmgE/PrpD family protein  26.9 
 
 		 446 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7303  MmgE/PrpD  27.92 
 
 		 474 aa  144  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4513  MmgE/PrpD family protein  28.8 
 
 		 463 aa  144  4e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0200  MmgE/PrpD family protein  33.98 
 
 		 454 aa  142  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0368  MmgE/PrpD  31.91 
 
 		 472 aa  142  9e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.500426  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6625  MmgE/PrpD family protein  33.15 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.977782 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1327  MmgE/PrpD family protein  63.64 
 
 		 102 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.683901  hitchhiker  0.0000000000000530685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2858  MmgE/PrpD  29.89 
 
 		 450 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428685 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1394  MmgE/PrpD family protein  26.19 
 
 		 446 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0615722  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5175  hypothetical protein  30.14 
 
 		 453 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1510  MmgE/PrpD  27.06 
 
 		 449 aa  139  1e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1347  MmgE/PrpD family protein  32.97 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4102  hypothetical protein  31.45 
 
 		 461 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2966  MmgE/PrpD  26.03 
 
 		 469 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0113  MmgE/PrpD family protein  31.37 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1311  MmgE/PrpD family protein  31.44 
 
 		 454 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3512  MmgE/PrpD family protein  29.86 
 
 		 453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.208219  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6217  MmgE/PrpD family protein  32.22 
 
 		 461 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0281  MmgE/PrpD family protein  25.11 
 
 		 446 aa  134  5e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6631  MmgE/PrpD family protein  33.62 
 
 		 468 aa  133  6e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0359328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0581  MmgE/PrpD  33.8 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4086  hypothetical protein  31.11 
 
 		 470 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0040  MmgE/PrpD family protein  26.87 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2140  MmgE/PrpD family protein  33.7 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607749 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0134  MmgE/PrpD family protein  33.09 
 
 		 454 aa  131  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.99136  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4802  MmgE/PrpD family protein  33.49 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.157439 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1228  MmgE/PrpD family protein  28.29 
 
 		 485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0614  MmgE/PrpD family protein  30.85 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.708965  normal  0.0263157 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0286  putative MmgE/PrpD family protein  26.91 
 
 		 481 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.522372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2736  MmgE/PrpD  32.79 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4189  MmgE/PrpD  28.36 
 
 		 481 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127966  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5808  MmgE/PrpD  34.67 
 
 		 463 aa  126  9e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2365  MmgE/PrpD family protein  29.98 
 
 		 439 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6172  MmgE/PrpD family protein  34.67 
 
 		 464 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.661576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1511  MmgE/PrpD  27.06 
 
 		 472 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0625  2-methylcitrate dehydratase  27.59 
 
 		 453 aa  125  2e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4268  MmgE/PrpD family protein  34.62 
 
 		 454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4983  MmgE/PrpD family protein  31.68 
 
 		 486 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.33687  normal  0.0207357 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0108  propionate catabolism protein  25.06 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0638  MmgE/PrpD family protein  30.67 
 
 		 443 aa  119  7.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4892  MmgE/PrpD family protein  30.05 
 
 		 441 aa  117  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6849  MmgE/PrpD family protein  27.85 
 
 		 460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>