More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1249 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1249  cytochrome c oxidase, subunit III  100 
 
 		 293 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0882  cytochrome c oxidase, subunit III  89.08 
 
 		 293 aa  527  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4387  Cytochrome-c oxidase  83.96 
 
 		 293 aa  494  1e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3532  cytochrome c oxidase, subunit III  81.57 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.671052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2855  cytochrome c oxidase subunit III  81.23 
 
 		 293 aa  489  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.205261  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3177  putative cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  80.89 
 
 		 293 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00203621  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3903  cytochrome c oxidase, subunit III  81.63 
 
 		 294 aa  486  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0637958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1383  cytochrome c oxidase, subunit III  79.52 
 
 		 293 aa  474  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0679531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1684  cytochrome c oxidase, subunit III  79.18 
 
 		 293 aa  477  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.115065  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1679  cytochrome c oxidase subunit III  79.52 
 
 		 293 aa  473  1e-132  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3823  cytochrome c oxidase subunit III  73.38 
 
 		 293 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.267917 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0367  cytochrome C oxidase subunit III transmembrane protein  63.23 
 
 		 286 aa  350  2e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0242  cytochrome c oxidase subunit III  61.86 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0155178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0223  cytochrome c oxidase subunit III  61.86 
 
 		 286 aa  346  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0281  cytochrome c oxidase subunit III  62.11 
 
 		 285 aa  345  6e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0318  cytochrome c oxidase, subunit III  62.54 
 
 		 286 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0265  cytochrome c oxidase subunit III  62.2 
 
 		 286 aa  341  7e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0677  cytochrome c oxidase subunit III  59.65 
 
 		 285 aa  332  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.397658  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0430  cytochrome c oxidase subunit III  59.65 
 
 		 285 aa  332  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0549  cytochrome c oxidase subunit III  60.35 
 
 		 285 aa  330  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.69876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4167  putative cytochrome c oxidase, subunit III  60.35 
 
 		 285 aa  331  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.437515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1427  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3193  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2854  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0494  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817705  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0512  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0165  cytochrome c oxidase, subunit III  59.3 
 
 		 285 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1641  cytochrome c oxidase subunit III  58.95 
 
 		 284 aa  328  6e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0942479  normal  0.989825 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2228  cytochrome c oxidase, subunit III  62.11 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2853  cytochrome c oxidase subunit III  62.11 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2842  cytochrome c oxidase, subunit III  62.11 
 
 		 285 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.20129  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2898  cytochrome c oxidase, subunit III  62.11 
 
 		 285 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.937469  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6172  cytochrome c oxidase, subunit III  61.75 
 
 		 285 aa  321  7e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2759  cytochrome c oxidase subunit III  61.4 
 
 		 285 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.599225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0461  cytochrome c oxidase subunit III  60.35 
 
 		 285 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.201021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0187  cytochrome c oxidase, subunit III  55.71 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1936  cytochrome c oxidase, subunit III  58.6 
 
 		 284 aa  306  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.140644  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1775  cytochrome c oxidase, subunit III  56.89 
 
 		 283 aa  293  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.474644  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04023  cytochrome C oxidase subunit III  53.33 
 
 		 291 aa  285  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3007  cytochrome c oxidase, subunit III  49.33 
 
 		 291 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.719434  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0076  cytochrome c oxidase, subunit III  49.33 
 
 		 295 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0314  cytochrome c oxidase subunit III  51.23 
 
 		 291 aa  256  4e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0965369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0296  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0195  cytochrome c oxidase, subunit III  48.64 
 
 		 291 aa  253  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0175  cytochrome c oxidase subunit III  47.46 
 
 		 291 aa  251  7e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  48.12 
 
 		 291 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3044  cytochrome c oxidase, subunit III  48.26 
 
 		 288 aa  251  1e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00173082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0125  cytochrome c oxidase subunit III  48.15 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2959  cytochrome c oxidase, subunit III  49.65 
 
 		 289 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04010  Cytochrome c oxidase subunit III  46.78 
 
 		 297 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2808  cytochrome c oxidase, subunit III  49.65 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0106  cytochrome c oxidase, subunit III  48.15 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753759  normal  0.456213 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0065  cytochrome c oxidase, subunit III  48.63 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0122  cytochrome c oxidase, subunit III  48.15 
 
 		 295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0120  cytochrome c oxidase, subunit III  47.81 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.532779  normal  0.0155575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0330  cytochrome c oxidase, subunit III  50 
 
 		 288 aa  244  9.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.625024  normal  0.0114384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0183  cytochrome c oxidase subunit III  48.81 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01320  cytochrome c oxidase, subunit III  48.81 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0233  cytochrome c oxidase subunit III  47.33 
 
 		 294 aa  242  3.9999999999999997e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.496819  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1041  Cytochrome-c oxidase  49.51 
 
 		 294 aa  241  7e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2714  cytochrome c oxidase, subunit III  48.01 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.183769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0883  cytochrome c oxidase, subunit III  44.6 
 
 		 288 aa  236  3e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4002  cytochrome c oxidase subunit III  48.14 
 
 		 293 aa  236  4e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1467  cytochrome c oxidase, subunit III  50.17 
 
 		 290 aa  235  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.791815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4115  cytochrome c oxidase subunit III  49.15 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4314  cytochrome c oxidase subunit III  49.15 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0039  cytochrome c oxidase, subunit III  45.03 
 
 		 304 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.061642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4183  cytochrome c oxidase subunit III  49.15 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0151  cytochrome c oxidase subunit III  48.81 
 
 		 291 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0145  cytochrome c oxidase, subunit III  45.67 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3520  cytochrome c oxidase, subunit III  47.3 
 
 		 291 aa  229  4e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4243  cytochrome c oxidase, subunit III  47.62 
 
 		 293 aa  229  6e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.373816  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00990  Cytochrome C Oxidase, Subunit III  45.7 
 
 		 296 aa  228  9e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3486  cytochrome c oxidase subunit III  46.78 
 
 		 291 aa  227  2e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.1204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3794  cytochrome c oxidase, subunit III  48.8 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3867  cytochrome c oxidase, subunit III  48.45 
 
 		 291 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4609  cytochrome c oxidase subunit III  48.45 
 
 		 291 aa  225  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3994  cytochrome c oxidase, subunit III  48.45 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3785  cytochrome c oxidase, subunit III  48.45 
 
 		 291 aa  223  4e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0255  cytochrome c oxidase, subunit III  49.32 
 
 		 291 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06269  cytochrome c oxidase, subunit III  45.58 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001448  cytochrome c oxidase polypeptide III  46.28 
 
 		 295 aa  192  6e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0607  Cytochrome-c oxidase  38.74 
 
 		 292 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.620012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0647  Cytochrome-c oxidase  38.74 
 
 		 292 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209964 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0673  cytochrome c oxidase subunit III  40.21 
 
 		 279 aa  178  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.562387 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0618  cytochrome c oxidase, subunit III  41.87 
 
 		 266 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.42287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4317  cytochrome c oxidase, subunit III  38.57 
 
 		 274 aa  172  7.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0523  cytochrome c oxidase subunit III  40 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.523755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0746  cytochrome c oxidase, subunit III  39.46 
 
 		 293 aa  167  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0126142  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  40.97 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1829  cytochrome c oxidase, aa3-type, subunit III  40.97 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.346117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4583  cytochrome c oxidase, subunit III  42.27 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4643  cytochrome c oxidase subunit III  41.52 
 
 		 277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.162674  normal  0.0685685 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1401  cytochrome c oxidase, subunit III  40.54 
 
 		 291 aa  166  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.129461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0478  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 		 439 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.152736  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0472  cytochrome c oxidase, subunit III  38 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0918  cytochrome c oxidase, subunit III  40.21 
 
 		 273 aa  164  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.163295  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0586  cytochrome c oxidase subunit III  38 
 
 		 292 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0904  cytochrome c oxidase subunit III  40.55 
 
 		 284 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.199365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1045  cytochrome c oxidase subunit III  37.33 
 
 		 292 aa  160  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>