163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1192 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1192  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
197 aa  400  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0793  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  76.14 
 
 
197 aa  313  9e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.408316  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1387  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  70.05 
 
 
196 aa  264  7e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1574  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  59.59 
 
 
194 aa  224  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.133884  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6105  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  54.59 
 
 
193 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0844  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  50.26 
 
 
192 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.275008  normal  0.86473 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2227  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  49.49 
 
 
194 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4343  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  55.21 
 
 
193 aa  149  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10655  normal  0.634853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4565  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  46.35 
 
 
192 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1013  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.24 
 
 
193 aa  143  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00015307  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0714  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
191 aa  139  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1733  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.49 
 
 
195 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.130205  normal  0.727599 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.97 
 
 
507 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1807  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  39.69 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.308138  normal  0.0910397 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  42.11 
 
 
507 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1688  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.45 
 
 
205 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.468133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2789  oxidoreductase, putative  37.89 
 
 
201 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.287976  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2966  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.89 
 
 
192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6041  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  41.53 
 
 
216 aa  129  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0083  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.13 
 
 
192 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0086  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0087  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.6 
 
 
192 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6649  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.75 
 
 
195 aa  122  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4532  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.44 
 
 
192 aa  119  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3662  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.05 
 
 
204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0914759  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1730  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  34.38 
 
 
204 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0396  quinone family oxidoreductase/NAD(P)H dehydrogenase  31.68 
 
 
192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030635  normal  0.183286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0006  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.83 
 
 
197 aa  111  6e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0938548  normal  0.382985 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4666  oxidoreductase  34.9 
 
 
207 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.243756  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2640  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  35.26 
 
 
192 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.236166  normal  0.823408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53230  oxidoreductase  33.68 
 
 
207 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.605908  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2525  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.02 
 
 
191 aa  100  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280985  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1799  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.18 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.2438  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2732  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.9 
 
 
189 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1123  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.49 
 
 
218 aa  77.8  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000199345 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1921  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.57 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3310  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  27.03 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0066019  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2263  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.53 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.193896  normal  0.343868 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0139  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  25.63 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.277932  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3002  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  26.49 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0168994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3331  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.49 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3099  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.49 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.426933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3330  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  26.49 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3035  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.41 
 
 
191 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.700131  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3317  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.95 
 
 
191 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4826  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.19 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4683  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.19 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000925813  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.19 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.174213  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3112  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.95 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.460138  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3358  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  25.95 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5100  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  29.25 
 
 
193 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.203676  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5095  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  24.62 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.160737  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5061  hypothetical protein  30.19 
 
 
193 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4666  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.25 
 
 
193 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0657  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.87 
 
 
196 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5101  NAD(P)H dehydrogenase, quinone family  28.3 
 
 
193 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3453  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.06 
 
 
192 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000456035  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1308  putative NAD(P)H oxidoreductase(quinone)  26.28 
 
 
213 aa  59.7  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.274882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4778  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3074  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.29 
 
 
197 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1893  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.58124  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1711  quinone reductase  30.32 
 
 
290 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1917  NAD(P)H dehydrogenase quinone family protein  28.89 
 
 
198 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048206  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3642  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  35.56 
 
 
261 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.750916  normal  0.729686 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0903  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.354298  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1191  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.693608  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0353  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0261  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.254456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2166  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  30.32 
 
 
258 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.7083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0894  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.75 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.280002  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0096  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.46 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000110916  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20800  NAD(P)H quinone oxidoreductase  27.74 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689455  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2068  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
198 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3342  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  37.08 
 
 
230 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.241608  normal  0.325854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17880  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  30.43 
 
 
264 aa  55.1  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.615091  normal  0.443705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3119  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.66 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.415856  normal  0.0316012 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4963  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.33 
 
 
259 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0573  quinone family NAD(P)H dehydrogenase  23.98 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5496  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  32.58 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.993327 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0608  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  24.7 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4047  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.96 
 
 
256 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.984998  hitchhiker  0.00915897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4755  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.45 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.192202  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0029  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  31.03 
 
 
199 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3756  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0470076  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0823  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.94 
 
 
266 aa  52.4  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35820  Oxidoreductase  27.22 
 
 
266 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0727  putative NADPH-quinone reductase (modulator of drug activity B)  23.3 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2460  ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  34.83 
 
 
258 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2110  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.03 
 
 
292 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4550  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  26.06 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.617173  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3280  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30 
 
 
194 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4596  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
259 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3767  hypothetical protein  33.71 
 
 
259 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.241129  normal  0.203175 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4021  Ribosyldihydronicotinamide dehydrogenase (quinone)  33.71 
 
 
261 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0199607  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2320  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  25.39 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304506  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3142  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  33.56 
 
 
196 aa  51.2  0.000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.2125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0122  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  29.07 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2332  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  36.49 
 
 
262 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7957  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.71 
 
 
195 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.507514  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3275  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>