More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1186 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  100 
 
 		 241 aa  485  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  81.7 
 
 		 245 aa  388  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  82.46 
 
 		 234 aa  384  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  80.95 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  80.6 
 
 		 236 aa  380  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  78.02 
 
 		 236 aa  378  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  76.72 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  77.59 
 
 		 236 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  77.59 
 
 		 236 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  77.59 
 
 		 236 aa  374  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  78.6 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  77.16 
 
 		 236 aa  372  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  77.39 
 
 		 244 aa  374  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  76.72 
 
 		 236 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  74.89 
 
 		 234 aa  361  5.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  75 
 
 		 244 aa  360  8e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  75.55 
 
 		 243 aa  358  3e-98  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  79.65 
 
 		 235 aa  358  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  80.35 
 
 		 244 aa  358  5e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  75.43 
 
 		 236 aa  358  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  75.43 
 
 		 236 aa  358  6e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  74.79 
 
 		 235 aa  347  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  45.69 
 
 		 237 aa  233  3e-60  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  48.25 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  53.88 
 
 		 230 aa  227  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  49.55 
 
 		 228 aa  226  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  49.55 
 
 		 240 aa  224  7e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.77 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  51.14 
 
 		 235 aa  214  7e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  49.12 
 
 		 234 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  51.14 
 
 		 254 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  45.21 
 
 		 228 aa  192  4e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  76.27 
 
 		 122 aa  186  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  43.61 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  45.61 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  44.84 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  42.67 
 
 		 242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  182  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  181  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  39.82 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  39.38 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1179  ABC transporter related  42.29 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  40.36 
 
 		 227 aa  178  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001466  ABC transporter ATP-binding protein  42.27 
 
 		 238 aa  177  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  39.38 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  43.42 
 
 		 229 aa  177  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  44.13 
 
 		 231 aa  176  3e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3893  ABC transporter related  40.72 
 
 		 242 aa  176  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 		 233 aa  175  4e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  42.22 
 
 		 642 aa  175  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  41.05 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.05 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0724  hypothetical protein  43.75 
 
 		 687 aa  175  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798634  normal  0.150655 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  41.05 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  175  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0035  ABC transporter related  41.85 
 
 		 225 aa  175  7e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000173721  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  40.62 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  40.62 
 
 		 233 aa  174  8e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.52 
 
 		 233 aa  174  9.999999999999999e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  43.05 
 
 		 654 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.84 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  41.74 
 
 		 230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3414  ABC transporter related  42.67 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  43.3 
 
 		 681 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0305255 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.78 
 
 		 649 aa  173  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4954  ABC transporter related  43.3 
 
 		 681 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0415826  normal  0.0801144 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0918  ABC transporter, ATP-binding protein  39.32 
 
 		 643 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  41.78 
 
 		 649 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  42.01 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  42.53 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  42.01 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  43.75 
 
 		 225 aa  172  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.18 
 
 		 227 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1063  macrolide-specific efflux protein macB  43.72 
 
 		 641 aa  171  6.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00606621  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  41.74 
 
 		 236 aa  171  7.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  41.81 
 
 		 255 aa  171  9e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  39.91 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40.17 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  40.62 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  42.29 
 
 		 230 aa  171  1e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 227 aa  171  1e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1085  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.89 
 
 		 642 aa  170  1e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  41.7 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05403  ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 237 aa  170  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  43.05 
 
 		 246 aa  170  2e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  42.22 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0636  macrolide-specific efflux protein macB  43.26 
 
 		 641 aa  170  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00901082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>