90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1185 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_1672  hypothetical protein  78.84 
 
 		 397 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.807397 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1185  hypothetical protein  100 
 
 		 397 aa  800    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.291724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3252  hypothetical protein  79.8 
 
 		 406 aa  616  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1918  hypothetical protein  72.82 
 
 		 401 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3850  hypothetical protein  72.82 
 
 		 401 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.17644  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3833  hypothetical protein  72.82 
 
 		 401 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3624  hypothetical protein  76.07 
 
 		 397 aa  596  1e-169  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.212055  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2684  hypothetical protein  72.57 
 
 		 401 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.613809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1252  hypothetical protein  72.07 
 
 		 401 aa  588  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00450705  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1360  ABC transporter permease protein  73.07 
 
 		 401 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2836  hypothetical protein  76.32 
 
 		 397 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1924  protein of unknown function DUF214  75.25 
 
 		 399 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.745521  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0146  hypothetical protein  71.07 
 
 		 401 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1917  protein of unknown function DUF214  71.32 
 
 		 401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2876  ABC-type transport system, putative permease component  70.32 
 
 		 401 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1835  hypothetical protein  71.18 
 
 		 399 aa  565  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.515684  normal  0.328379 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1686  protein of unknown function DUF214  71.68 
 
 		 399 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1047  protein of unknown function DUF214  71.07 
 
 		 401 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.60518  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0870  ABC transporter, permease protein  67.5 
 
 		 400 aa  549  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1327  protein of unknown function DUF214  69 
 
 		 400 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.674334  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1044  hypothetical protein  70.75 
 
 		 400 aa  511  1e-144  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1242  hypothetical protein  69.25 
 
 		 400 aa  509  1e-143  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0230  protein of unknown function DUF214  42.25 
 
 		 400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3407  hypothetical protein  42.25 
 
 		 400 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.246613  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1363  hypothetical protein  41 
 
 		 381 aa  309  4e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.222862  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0829  protein of unknown function DUF214  42.25 
 
 		 400 aa  294  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0948  ABC transporter, permease protein, putative  43.18 
 
 		 399 aa  292  6e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3300  hypothetical protein  42.03 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.21339  normal  0.477373 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3712  hypothetical protein  38.5 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3304  hypothetical protein  41 
 
 		 380 aa  271  2e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.578664  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1280  protein of unknown function DUF214  34.99 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0216848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0381  hypothetical protein  33.59 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10072  glutamine ABC transporter membrane protein  24.38 
 
 		 349 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.929786  normal  0.0856316 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2146  protein of unknown function DUF214  22.62 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1808  ABC-transporter permease protein, putative  25.62 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.218527  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0313  protein of unknown function DUF214  21.61 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12583  glutamine ABC transporter membrane protein  23.68 
 
 		 349 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.658592 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5155  protein of unknown function DUF214  21.7 
 
 		 407 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4023  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.43 
 
 		 375 aa  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2797  hypothetical protein  22.33 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0642464 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3268  ABC transporter, permease protein, putative  22.79 
 
 		 354 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.398205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3274  putative ABC transporter, permease protein  23.53 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.922817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2945  ABC transporter, permease  22.36 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2003  putative ABC transporter, permease protein  22.36 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3244  putative ABC transporter, permease protein  22.36 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3008  ABC transporter, permease  22.79 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2972  hypothetical protein  22.55 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0587122  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0698  protein of unknown function DUF214  22.49 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112552 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3083  hypothetical protein  23.6 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.262583  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0121  permease, putative  30 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1117  protein of unknown function DUF214  28.65 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3023  ABC transporter permease  21.62 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.7303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3256  ABC transporter permease  21.62 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7062  putative ABC transporter, permease protein  23.97 
 
 		 377 aa  55.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.549141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3587  DevC protein  27.22 
 
 		 385 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.694594  normal  0.0264093 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0298  hypothetical protein  21.48 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.485255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3776  hypothetical protein  25.87 
 
 		 380 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.71489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0291  hypothetical protein  21.48 
 
 		 349 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3254  putative ABC transporter, permease protein  20.65 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2585  hypothetical protein  29.79 
 
 		 356 aa  53.9  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.268952  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2250  DevC protein  34.55 
 
 		 385 aa  53.5  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0130513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1952  ABC transporter, permease protein  20 
 
 		 350 aa  53.1  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1630  protein of unknown function DUF214  24.18 
 
 		 382 aa  52.4  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2891  DevC protein  30.91 
 
 		 395 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.822086  normal  0.492179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0999  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.59064  normal  0.175396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2092  DevC protein  32.77 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000758237 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3445  hypothetical protein  22.93 
 
 		 389 aa  50.8  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000235465  normal  0.187048 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1553  hypothetical protein  22.54 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4040  putative lipoprotein-releasing system transmembrane protein (lolC)  28.42 
 
 		 411 aa  49.7  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2730  DevC protein  31.82 
 
 		 397 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.890192 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2430  hypothetical protein  31.15 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.591526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2384  hypothetical protein  31.15 
 
 		 351 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1505  hypothetical protein  22.71 
 
 		 378 aa  47.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.481293  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3777  hypothetical protein  25.13 
 
 		 383 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0091  DevC protein  24.26 
 
 		 384 aa  46.6  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  27.57 
 
 		 852 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4104  DevC protein  22.75 
 
 		 385 aa  45.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.312226  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2646  ABC transporter, permease component  23.58 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0444  ABC transporter, permease protein  23.61 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.147924  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3920  DevC protein  20.1 
 
 		 392 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0811  peptide ABC transporter permease  21.67 
 
 		 348 aa  44.7  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.461832  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4544  protein of unknown function DUF214  27.67 
 
 		 372 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0301435  normal  0.636617 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7011  hypothetical protein  20.84 
 
 		 378 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0792174  normal  0.559457 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0758  lipoprotein releasing system, transmembrane protein, LolC/E family  26.23 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00020569  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1223  DevC protein  25.7 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.933137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0223  protein of unknown function DUF214  41.25 
 
 		 422 aa  43.9  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.350775 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3800  DevC protein  31.82 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2769  ABC transporter, permease protein, putative  21.41 
 
 		 378 aa  43.5  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715584  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3751  DevC protein  31.82 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3639  DevC protein  27.27 
 
 		 388 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.543907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>