76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0998 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0998  putative phage repressor  100 
 
 		 284 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891083  hitchhiker  0.000269405 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4115  putative phage repressor  47.83 
 
 		 248 aa  222  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.396113  hitchhiker  0.00000211881 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2481  putative phage repressor  36.61 
 
 		 230 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2959  prophage MuMc02, S24 family peptidase  38.29 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0370  putative transcriptional regulator  31.91 
 
 		 210 aa  89  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.128546  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0710  putative phage repressor  26.34 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0335  putative phage repressor  33.57 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3365  putative phage repressor  27.48 
 
 		 215 aa  73.2  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2178  putative phage repressor  36.23 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0386181  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0272  putative phage repressor  34.78 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2371  putative phage repressor  32.95 
 
 		 233 aa  68.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0789  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000234402  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0648  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 245 aa  67  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.19  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1158  transcriptional regulator, putative  30.28 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2652  prophage MuSo2, Cro/CI family transcriptional regulator  25.11 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3495  putative phage repressor  26.85 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000058003  unclonable  0.00000889639 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2020  putative phage repressor  27.46 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0868068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0189  putative phage repressor  28.06 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0767  putative phage repressor  26.86 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.420477  normal  0.277646 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0768  putative phage repressor  25.51 
 
 		 240 aa  60.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.194498  hitchhiker  0.000185751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3371  putative phage repressor  26.39 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000119805  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3616  putative phage repressor  26.86 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0874136  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0740  putative phage repressor  26.12 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1261  putative phage repressor  23.14 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000205761 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1065  putative phage repressor  25.69 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.518416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1094  putative phage repressor  28 
 
 		 249 aa  58.9  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.189719 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2067  putative phage repressor  28.97 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000502138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2114  putative phage repressor  28.97 
 
 		 247 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00404649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4824  putative phage repressor  38.85 
 
 		 216 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.852274  normal  0.393285 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0726  putative phage repressor  25.32 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.255707  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1980  transcriptional regulator, putative  25.35 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00751555  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3268  transciptional regulator  27.15 
 
 		 229 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000953974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1413  putative phage repressor  28.43 
 
 		 216 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0602324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0819  putative phage repressor  29.73 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0352  putative phage repressor  32.24 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00411274 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0617  putative phage repressor  25.56 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1643  repressor protein, putative  24.22 
 
 		 289 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.102671  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1326  putative phage repressor  28.78 
 
 		 204 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3076  transcriptional regulator  26.75 
 
 		 219 aa  53.9  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.0011023  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1965  putative phage repressor  26.48 
 
 		 263 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.526038  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2775  putative phage repressor  24.79 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2924  putative phage repressor  24.79 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0889  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  30.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0641  prophage MuSo1, Cro/CI family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 240 aa  52.4  0.000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0232  putative phage repressor  35.25 
 
 		 222 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.407354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0780  putative phage repressor  29.35 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00131571  decreased coverage  0.000230988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52530  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000132202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4606  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 237 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1619  putative phage repressor  29.59 
 
 		 237 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0134521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  23.18 
 
 		 270 aa  50.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0248  hypothetical protein  34.09 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3964  putative phage repressor  31.65 
 
 		 259 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.072898  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13403  hypothetical protein  28.44 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0817  putative phage repressor  22.47 
 
 		 205 aa  49.7  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1365  putative phage repressor  25.45 
 
 		 227 aa  49.7  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07960  transcriptional regulator PrtR  24.48 
 
 		 256 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0101148  hitchhiker  0.000834984 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2563  putative phage repressor  30.65 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0755  transcriptional regulator PrtR  24.07 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.011984  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1648  putative phage repressor  35.63 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00656681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  27.4 
 
 		 248 aa  47.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2128  putative phage repressor  26.42 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5381  prophage MuMc02, S24 family peptidase  51.06 
 
 		 51 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.381026 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2704  putative phage repressor  24.27 
 
 		 269 aa  47  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1272  putative phage repressor  26.48 
 
 		 263 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.343387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2330  putative phage repressor  35 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.965048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1510  putative phage repressor  25.64 
 
 		 212 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.432994  normal  0.193235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  31.82 
 
 		 264 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2283  putative phage repressor  31.19 
 
 		 292 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00298807  unclonable  0.0000000000471179 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1188  putative phage repressor  31.75 
 
 		 234 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000267835  normal  0.264486 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2990  prophage LambdaSo, Cro/CI family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 272 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3262  putative phage repressor  22.67 
 
 		 241 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2335  putative phage repressor  33.7 
 
 		 245 aa  43.5  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00049871  unclonable  0.0000000160936 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1866  putative phage repressor  22.75 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2034  putative phage repressor  27.48 
 
 		 214 aa  42.7  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00109753  normal  0.0598759 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4997  transcriptional regulator  28.87 
 
 		 246 aa  42.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.357527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>