20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0958 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  100 
 
 
357 aa  705    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  79.66 
 
 
360 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  35.42 
 
 
649 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  36.14 
 
 
661 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  36.14 
 
 
661 aa  188  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  34.58 
 
 
659 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  34.58 
 
 
659 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  34.97 
 
 
469 aa  160  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  34.31 
 
 
646 aa  158  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  33.73 
 
 
446 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  33.33 
 
 
645 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  33.33 
 
 
645 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000204536 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  33.33 
 
 
645 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000101798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  29.48 
 
 
431 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  33.33 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000692792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  25.62 
 
 
490 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  24.53 
 
 
525 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  23.66 
 
 
437 aa  48.1  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  27.55 
 
 
409 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  27.82 
 
 
279 aa  42.7  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>