More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0747 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0747  porin  100 
 
 		 386 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00334345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  39.9 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  36.05 
 
 		 344 aa  189  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  34.99 
 
 		 335 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  33.08 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  33.5 
 
 		 352 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  34.04 
 
 		 360 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.2 
 
 		 338 aa  136  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  30.7 
 
 		 396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.25 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.25 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.25 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.25 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.25 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.25 
 
 		 386 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.17 
 
 		 436 aa  126  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.07 
 
 		 385 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.8 
 
 		 385 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  31.13 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  33.42 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  32.02 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  28.89 
 
 		 397 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  30.21 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  33.42 
 
 		 380 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  28.57 
 
 		 397 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  28.89 
 
 		 397 aa  122  8e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  32.92 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.04 
 
 		 335 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  31.13 
 
 		 347 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  30.84 
 
 		 386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  30.91 
 
 		 383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  33.16 
 
 		 380 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  30.99 
 
 		 386 aa  119  7e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  33.16 
 
 		 380 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  34.32 
 
 		 389 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.52 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.52 
 
 		 392 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.37 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  32.65 
 
 		 380 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  30.84 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  28.39 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  28.14 
 
 		 397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  30.66 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.93 
 
 		 389 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  30.66 
 
 		 383 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  32.22 
 
 		 379 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  31.97 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  28.14 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  28.14 
 
 		 421 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  32.13 
 
 		 380 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  32.23 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  31.06 
 
 		 387 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.69 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  30.09 
 
 		 383 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.11 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  31.13 
 
 		 385 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  29.92 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  36 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  32.81 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  29.86 
 
 		 383 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  30.52 
 
 		 383 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  37.93 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  29.36 
 
 		 374 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  32.46 
 
 		 389 aa  110  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  30.23 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6216  porin  34.26 
 
 		 407 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  29.23 
 
 		 364 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  34.98 
 
 		 379 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  30.48 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.44 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  30.21 
 
 		 391 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  34.09 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  31.76 
 
 		 372 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  31.09 
 
 		 383 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  31.54 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  30.32 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  35.66 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  31.62 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  35.22 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32 
 
 		 364 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  29.98 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  30.32 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  30.32 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  28.77 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  30.99 
 
 		 363 aa  107  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  35.22 
 
 		 400 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  31.11 
 
 		 430 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  30.32 
 
 		 379 aa  107  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  31.17 
 
 		 376 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  32.28 
 
 		 357 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  29.9 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  31.11 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  31.11 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  35.86 
 
 		 395 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  30.32 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  29.01 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  28.4 
 
 		 379 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  29.58 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.71 
 
 		 362 aa  107  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1817  putative outer membrane porin  27.63 
 
 		 399 aa  107  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.356492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>