More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0638 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0638  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 330 aa  670    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  67.58 
 
 		 332 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  57.88 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1449  twin-arginine translocation pathway signal  56.67 
 
 		 331 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0404058  normal  0.58438 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3927  extra-cytoplasmic solute receptor  61.11 
 
 		 329 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000102175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  58.79 
 
 		 339 aa  387  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3797  twin-arginine translocation pathway signal  58.51 
 
 		 329 aa  382  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.800124  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3331  hypothetical protein  58.04 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1578  hypothetical protein  55.93 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3271  hypothetical protein  59.8 
 
 		 338 aa  366  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448127 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3801  hypothetical protein  56.13 
 
 		 335 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.694709  normal  0.119002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  47.11 
 
 		 336 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  46.27 
 
 		 344 aa  298  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  46.34 
 
 		 339 aa  297  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  46.58 
 
 		 345 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  46.58 
 
 		 345 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  45.93 
 
 		 360 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.71 
 
 		 344 aa  285  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  45.13 
 
 		 339 aa  280  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2753  hypothetical protein  41.57 
 
 		 327 aa  267  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0378897 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  42.64 
 
 		 332 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  43.65 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  43.95 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  40.73 
 
 		 327 aa  262  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  42.76 
 
 		 330 aa  262  4.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  44.48 
 
 		 333 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  40.68 
 
 		 327 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  42.62 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  42.52 
 
 		 325 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  40.54 
 
 		 331 aa  261  8e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  39.38 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  42.86 
 
 		 326 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  43.43 
 
 		 322 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  42.9 
 
 		 334 aa  259  4e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4511  hypothetical protein  41.04 
 
 		 337 aa  259  4e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  42.14 
 
 		 330 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4286  extra-cytoplasmatic solute receptor  41.34 
 
 		 353 aa  258  8e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.25 
 
 		 328 aa  258  9e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4610  hypothetical protein  42.41 
 
 		 322 aa  258  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0432088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  41.23 
 
 		 325 aa  258  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  40.31 
 
 		 334 aa  256  3e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.34 
 
 		 330 aa  255  8e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  44.26 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3657  hypothetical protein  40.99 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.111701  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  43.94 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0994  hypothetical protein  42.52 
 
 		 341 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1078  hypothetical protein  42.52 
 
 		 344 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.058258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5891  hypothetical protein  41.64 
 
 		 327 aa  253  5.000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.580231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  40.8 
 
 		 339 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  43.23 
 
 		 333 aa  252  7e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0080  hypothetical protein  40.84 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.141434 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  42.86 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.88 
 
 		 339 aa  250  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  42.68 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1325  hypothetical protein  38.79 
 
 		 330 aa  249  5e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  39.63 
 
 		 332 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  39.08 
 
 		 336 aa  248  7e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  40.43 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2092  twin-arginine translocation pathway signal  40.5 
 
 		 331 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.061194  normal  0.4929 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  41.61 
 
 		 328 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  41.33 
 
 		 323 aa  248  1e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4229  twin-arginine translocation pathway signal  41.43 
 
 		 335 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.467764  normal  0.364318 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  40.88 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.96 
 
 		 325 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  40.47 
 
 		 328 aa  246  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4334  twin-arginine translocation pathway signal  40.68 
 
 		 335 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464074 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2997  hypothetical protein  39.47 
 
 		 343 aa  245  6e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0266851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  41.14 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1513  hypothetical protein  41.95 
 
 		 337 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.283946  normal  0.153712 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4513  hypothetical protein  42.28 
 
 		 338 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0122346  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  39.26 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1197  hypothetical protein  43.51 
 
 		 324 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.81 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3614  hypothetical protein  40.53 
 
 		 355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.380289  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  39.63 
 
 		 328 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5370  extra-cytoplasmic solute receptor  41.27 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  42.41 
 
 		 327 aa  243  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3588  hypothetical protein  40.8 
 
 		 326 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.117868  normal  0.0136594 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0835  hypothetical protein  38.61 
 
 		 351 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0180096  normal  0.0225936 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  43.28 
 
 		 333 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5584  hypothetical protein  39.8 
 
 		 337 aa  243  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0384253  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4213  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 326 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  42.16 
 
 		 331 aa  242  6e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4931  extra-cytoplasmic solute receptor  39.33 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2898  hypothetical protein  41.35 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000220815  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6217  hypothetical protein  40.56 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0641942  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5105  hypothetical protein  40.92 
 
 		 329 aa  242  7e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  40.27 
 
 		 326 aa  241  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  40.6 
 
 		 322 aa  241  9e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  41.53 
 
 		 327 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2127  hypothetical protein  40.8 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00713348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  38.27 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  40 
 
 		 348 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1233  hypothetical protein  42.03 
 
 		 326 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.305229  normal  0.989225 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1270  hypothetical protein  40 
 
 		 323 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1083  hypothetical protein  37.58 
 
 		 337 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.371432  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  39.38 
 
 		 332 aa  241  2e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4537  hypothetical protein  40.88 
 
 		 319 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000308592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  42.33 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  38.6 
 
 		 324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>