More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0541 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  100 
 
 		 263 aa  548  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  98.86 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  77.27 
 
 		 263 aa  422  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  79.55 
 
 		 262 aa  414  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  77.57 
 
 		 263 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  76.81 
 
 		 263 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  74.52 
 
 		 263 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  71.48 
 
 		 263 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  65.9 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  72.34 
 
 		 262 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.49 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  71.49 
 
 		 262 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  67.07 
 
 		 258 aa  368  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  67.32 
 
 		 263 aa  364  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  70.64 
 
 		 262 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  62.85 
 
 		 259 aa  359  2e-98  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.53 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.53 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.53 
 
 		 263 aa  359  3e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  64.45 
 
 		 263 aa  358  4e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.14 
 
 		 263 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.14 
 
 		 263 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.14 
 
 		 263 aa  357  7e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.36 
 
 		 262 aa  357  8e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  66.14 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  63.39 
 
 		 263 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  69.4 
 
 		 262 aa  355  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  65.4 
 
 		 257 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  64.96 
 
 		 257 aa  352  4e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  63.49 
 
 		 258 aa  346  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  65.13 
 
 		 258 aa  343  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  63.95 
 
 		 258 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  61.07 
 
 		 249 aa  319  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.32 
 
 		 256 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  60.7 
 
 		 255 aa  305  4.0000000000000004e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  58.2 
 
 		 249 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  58.92 
 
 		 259 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  61.14 
 
 		 255 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  56.08 
 
 		 259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  56.72 
 
 		 259 aa  297  9e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  60.28 
 
 		 215 aa  290  1e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  55.7 
 
 		 259 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  60 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  60 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  51.95 
 
 		 261 aa  286  4e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  56.47 
 
 		 260 aa  285  4e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  53.91 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.51 
 
 		 239 aa  277  1e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  51.09 
 
 		 263 aa  265  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  54.59 
 
 		 241 aa  262  4e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  41.13 
 
 		 234 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  38.52 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  36.25 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  35.97 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 		 262 aa  155  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  37.25 
 
 		 262 aa  155  7e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  36.18 
 
 		 256 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  37.6 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.71 
 
 		 249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  38.7 
 
 		 234 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  38.7 
 
 		 234 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  37.39 
 
 		 234 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  36.05 
 
 		 240 aa  148  8e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  35.69 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.13 
 
 		 251 aa  145  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  36.97 
 
 		 234 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.1 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.53 
 
 		 256 aa  134  9.999999999999999e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  34.68 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  34.27 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  34.01 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  30.25 
 
 		 319 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.9 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  41.67 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  40.12 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  40.12 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  26.85 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.57 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  34.38 
 
 		 517 aa  97.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  38.36 
 
 		 495 aa  96.7  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2793  oxidoreductase molybdopterin binding  32.56 
 
 		 206 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7397  oxidoreductase molybdopterin binding  32.47 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.71227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.42 
 
 		 311 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1086  oxidoreductase, molybdopterin binding  30.56 
 
 		 205 aa  89.7  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0584  oxidoreductase molybdopterin binding protein  27.2 
 
 		 501 aa  89  7e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0938  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.77 
 
 		 199 aa  88.2  1e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.378305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2341  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.82 
 
 		 221 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0559328  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  32.14 
 
 		 313 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0362  oxidoreductase, molybdopterin binding  28.66 
 
 		 200 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.659486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3066  oxidoreductase molybdopterin binding protein  33.33 
 
 		 465 aa  85.9  6e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.419919  normal  0.473348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3632  oxidoreductase, molybdopterin binding  32.89 
 
 		 221 aa  85.1  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0663  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.76 
 
 		 229 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000387868  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0428  oxidoreductase, molybdopterin binding  35.95 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0987  putative sulfite oxidase subunit YedY  31.93 
 
 		 331 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2471  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0424  oxidoreductase molybdopterin binding  30.46 
 
 		 233 aa  82.4  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3571  oxidoreductase molybdopterin binding protein  30.56 
 
 		 232 aa  81.6  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1007  putative sulfite oxidase subunit YedY  25.82 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0460692  normal  0.0531219 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0290  oxidoreductase molybdopterin binding  32.92 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2413  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.77 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00411856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>