40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0532 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  6e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  44.59 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  33.75 
 
 		 118 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  27.91 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  30.23 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  37.14 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  37.14 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  37.14 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  37.5 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  37.5 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  31.17 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  25.58 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  37.5 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  30.16 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  27.06 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  28.77 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  33.33 
 
 		 102 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  34.78 
 
 		 102 aa  44.7  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  29.87 
 
 		 126 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  32.47 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  26.25 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  28.95 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  29.87 
 
 		 126 aa  43.5  0.0009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  31.58 
 
 		 119 aa  43.5  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  32.14 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  26.39 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  31.33 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  29.55 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  28.17 
 
 		 138 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  28.17 
 
 		 116 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  26.74 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>