More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0417 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0417  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5228  transcriptional regulator, GntR family  76.86 
 
 		 262 aa  387  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.860524  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0673  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 233 aa  151  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.990367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1505  transcriptional regulator, GntR family  40.39 
 
 		 243 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.160619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1653  GntR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 238 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1752  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2372  transcriptional regulator, GntR family  33.94 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000612735  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 219 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3350  transcriptional regulator, GntR family  32.35 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.398966  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  36.2 
 
 		 244 aa  104  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5875  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1871  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 265 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283642  normal  0.395033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6216  transcriptional regulator, GntR family  33.49 
 
 		 249 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0278  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 265 aa  101  9e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.31602  normal  0.331745 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.7 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 233 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 219 aa  98.6  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4101  GntR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  32.31 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  29.8 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0405  transcriptional regulator, GntR family  32.55 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1713  transcriptional regulator, GntR family  34.27 
 
 		 219 aa  96.7  3e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.725183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 230 aa  96.3  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 240 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  28.9 
 
 		 266 aa  96.3  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  30.91 
 
 		 238 aa  95.5  8e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0568  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 396 aa  95.5  8e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.66 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 225 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  31.06 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  31.09 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  32.66 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 234 aa  92.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3959  GntR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 219 aa  92.4  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.426708  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1174  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 241 aa  92.4  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 243 aa  92  8e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 262 aa  92  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 202 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 222 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  31.7 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0498  GntR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 231 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 238 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  32.37 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 255 aa  90.9  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4590  GntR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 258 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 255 aa  90.5  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 240 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5069  GntR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.046054  normal  0.249885 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  32.99 
 
 		 231 aa  89.4  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5826  GntR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 254 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000644703 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4693  GntR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 267 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0394  transcriptional regulator, GntR family  32.41 
 
 		 250 aa  89  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.143272  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0982  GntR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.84517 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  32.06 
 
 		 237 aa  88.6  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  30.63 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 235 aa  87.8  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  30.2 
 
 		 229 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5168  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 234 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  33.54 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.78 
 
 		 231 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 233 aa  87.8  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1405  GntR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 222 aa  87.4  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0359865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 212 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3719  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  87  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329499  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.5 
 
 		 216 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  34.44 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1614  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 217 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 229 aa  87  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.18 
 
 		 239 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30150  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 233 aa  86.3  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.132781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 263 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1095  GntR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 253 aa  86.7  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.103754 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  86.3  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>