More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0416 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0416  histone deacetylase superfamily protein  100 
 
 		 342 aa  701    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5227  Histone deacetylase  88.01 
 
 		 342 aa  622  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.994871  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1654  histone deacetylase superfamily protein  62.76 
 
 		 341 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6484  acetylpolyamine aminohydrolase  61.54 
 
 		 341 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0674  histone deacetylase superfamily protein  62.06 
 
 		 346 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1504  histone deacetylase superfamily  60.06 
 
 		 341 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.170648  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2856  histone deacetylase superfamily protein  56.14 
 
 		 342 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2066  histone deacetylase superfamily protein  53.35 
 
 		 342 aa  344  1e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.229511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1621  histone deacetylase superfamily protein  47.31 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3648  histone deacetylase superfamily protein  43.53 
 
 		 337 aa  293  3e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1145  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.391107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2035  histone deacetylase superfamily protein  45.59 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0773  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493705  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1254  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 340 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.910745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4392  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1226  histone deacetylase superfamily protein  46.47 
 
 		 340 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.300327 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3834  histone deacetylase superfamily protein  44.74 
 
 		 361 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1133  histone deacetylase superfamily protein  47.06 
 
 		 340 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46230  acetylpolyamine aminohydrolase  44.83 
 
 		 346 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.352014  normal  0.0157531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3930  acetylpolyamine aminohydrolase  45.11 
 
 		 346 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0420  histone deacetylase superfamily protein  45.56 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0250  acetylpolyamine aminohydrolase  48.08 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.730977  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3895  histone deacetylase superfamily protein  45.02 
 
 		 341 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1679  putative acetylpolyamine aminohydrolase  48.08 
 
 		 340 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1768  deacetylase  47.79 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.895977  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1098  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.79 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0943175  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1265  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.79 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.739183  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0328  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.79 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.249659  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0096  putative acetylpolyamine aminohydrolase  47.79 
 
 		 340 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.271818  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0414  acetylpolyamine aminohydrolase  42.27 
 
 		 344 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5631  histone deacetylase superfamily protein  43.24 
 
 		 341 aa  265  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576277  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0123  histone deacetylase superfamily protein  42.69 
 
 		 342 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1157  acetylpolyamine aminohydrolase  47.95 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.470234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1309  acetylpolyamine aminohydrolase  47.95 
 
 		 341 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1148  deacetylases  47.95 
 
 		 341 aa  263  2e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1164  acetylpolyamine aminohydrolase  47.31 
 
 		 340 aa  263  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.027109  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04190  acetylpolyamine aminohydrolase  41.4 
 
 		 344 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2062  histone deacetylase superfamily protein  47.2 
 
 		 340 aa  261  1e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5340  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.863251  hitchhiker  0.000438214 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2219  acetylpolyamine aminohydrolase  47.95 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0703  acetylpolyamine aminohydrolase  47.95 
 
 		 340 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0133  histone deacetylase superfamily protein  42.35 
 
 		 347 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.758877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5249  histone deacetylase superfamily protein  41.18 
 
 		 347 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.122072  normal  0.307512 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2199  histone deacetylase superfamily protein  43.4 
 
 		 343 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2537  acetylpolyamine aminohydrolase  49.55 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2077  acetylpolyamine aminohydrolase  49.55 
 
 		 340 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0145419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5389  histone deacetylase superfamily protein  41.18 
 
 		 347 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.382979  normal  0.0522002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1020  histone deacetylase superfamily protein  41.59 
 
 		 368 aa  253  5.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.283226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4260  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 		 341 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3527  acetylpolyamine aminohydrolase  42.23 
 
 		 344 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2947  histone deacetylase superfamily protein  43.8 
 
 		 345 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1176  histone deacetylase superfamily protein  43.53 
 
 		 342 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3254  histone deacetylase superfamily protein  44.09 
 
 		 345 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.936877  normal  0.964119 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0946  acetylpolyamine aminohydrolase  47.43 
 
 		 340 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0414216  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5104  histone deacetylase superfamily protein  44.67 
 
 		 345 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00214422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1612  histone deacetylase superfamily protein  45.02 
 
 		 341 aa  236  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.992447  hitchhiker  0.000235913 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2137  histone deacetylase superfamily protein  42.36 
 
 		 358 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00662532 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3171  histone deacetylase superfamily protein  42.52 
 
 		 344 aa  231  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1645  histone deacetylase superfamily  42.11 
 
 		 345 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4525  histone deacetylase superfamily  41.47 
 
 		 341 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0601361 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2841  histone deacetylase superfamily protein  43.11 
 
 		 344 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.540777 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2450  histone deacetylase superfamily protein  42.65 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2707  histone deacetylase superfamily protein  40.69 
 
 		 359 aa  229  6e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0331733  normal  0.0625802 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0475  histone deacetylase superfamily  38.12 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3112  Histone deacetylase  41.64 
 
 		 343 aa  228  1e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.919523  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4692  Histone deacetylase  42.86 
 
 		 353 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.173382  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0375  histone deacetylase superfamily  41.18 
 
 		 354 aa  219  7e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3805  histone deacetylase superfamily protein  42.57 
 
 		 346 aa  218  8.999999999999998e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1078  histone deacetylase superfamily protein  42.86 
 
 		 346 aa  216  7e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3178  histone deacetylase superfamily protein  38.19 
 
 		 578 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1145  histone deacetylase superfamily  41.07 
 
 		 582 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1813  histone deacetylase superfamily protein  38.85 
 
 		 577 aa  186  4e-46  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1181  histone deacetylase superfamily protein  39.23 
 
 		 315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.298276  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0789  histone deacetylase superfamily protein  31.09 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43919  predicted protein  34.77 
 
 		 407 aa  156  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  50.24 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  46.86 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  42.79 
 
 		 370 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  41.85 
 
 		 334 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  44.14 
 
 		 380 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 		 369 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  44.39 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  44.39 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  43.95 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  41.74 
 
 		 344 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  39.35 
 
 		 379 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  42.92 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  44.39 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  40.35 
 
 		 340 aa  147  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  43.87 
 
 		 371 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  41.02 
 
 		 379 aa  146  5e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  35.92 
 
 		 335 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  43.18 
 
 		 373 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  40.93 
 
 		 346 aa  139  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  46.7 
 
 		 340 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  40.59 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  46.7 
 
 		 369 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  46.15 
 
 		 373 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  45.99 
 
 		 336 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  47.59 
 
 		 340 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>