156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0334 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0334  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like  100 
 
 
387 aa  777    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.234977 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0261  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  67.18 
 
 
339 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1305  hypothetical protein  56.51 
 
 
379 aa  386  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.528071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0318  alpha/beta hydrolase fold  70.57 
 
 
334 aa  362  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0313  alpha/beta hydrolase fold protein  70.19 
 
 
334 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3321  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0383  alpha/beta hydrolase fold  65.93 
 
 
354 aa  350  2e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3544  hypothetical protein  69.92 
 
 
338 aa  349  6e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4836  alpha/beta hydrolase fold protein  71.21 
 
 
352 aa  333  4e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.374024  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0749  hypothetical protein  63.36 
 
 
341 aa  330  3e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0772  hypothetical protein  60.61 
 
 
326 aa  329  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0426  alpha/beta hydrolase fold  49.87 
 
 
328 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0648  hypothetical protein  61.98 
 
 
323 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2939  hypothetical protein  63.36 
 
 
348 aa  319  7e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0682  putative hydrolase of the alpha/beta- hydrolase fold  45.45 
 
 
384 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.311173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3284  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  45.14 
 
 
372 aa  305  6e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5966  Alpha/beta hydrolase  46.24 
 
 
345 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0543  Alpha/beta hydrolase fold  56.23 
 
 
355 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2664  alpha/beta hydrolase fold  56.4 
 
 
345 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0489  alpha/beta hydrolase fold  55.07 
 
 
345 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.662997 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2024  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.778752  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2635  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
345 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3298  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.77 
 
 
318 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0471  alpha/beta hydrolase fold protein  55.93 
 
 
358 aa  278  1e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0663  alpha/beta hydrolase fold  57.2 
 
 
346 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.699336  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0484  alpha/beta hydrolase fold  56.02 
 
 
358 aa  275  9e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2555  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
345 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2682  alpha/beta hydrolase fold  56 
 
 
345 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2730  Alpha/beta hydrolase fold  51.47 
 
 
342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.995448  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0656  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.937901  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0563  hypothetical protein  53.45 
 
 
371 aa  273  3e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0289  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0987  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.666477  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0584  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.935631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2417  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0826  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0830  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0030  alpha/beta fold family hydrolase  54.09 
 
 
344 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0137228  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0452  putative hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold  52.31 
 
 
337 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.15665  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2137  esterase/lipase/thioesterase family protein  52.61 
 
 
325 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0872  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
321 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.785883  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0724  hydrolase, alpha/beta hydrolase fold family  40.59 
 
 
321 aa  197  3e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2520  alpha/beta hydrolase fold protein  36.49 
 
 
329 aa  186  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2433  alpha/beta hydrolase fold  36.22 
 
 
332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1075  alpha/beta hydrolase fold protein  32.33 
 
 
360 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.395097 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1867  alpha/beta hydrolase  44.76 
 
 
342 aa  176  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.104467  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0872  Alpha/beta hydrolase fold  39.39 
 
 
332 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3186  alpha/beta hydrolase fold  38.65 
 
 
323 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00697206  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1531  hypothetical protein  39.24 
 
 
326 aa  172  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.923129  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0880  hypothetical protein  37.75 
 
 
327 aa  169  8e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0029  hypothetical protein  31.75 
 
 
350 aa  166  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00048077  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4689  alpha/beta hydrolase fold protein  35.08 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.149964  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3398  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 
327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0670  alpha/beta hydrolase fold  37.4 
 
 
323 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740122  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1008  alpha/beta hydrolase fold  40.59 
 
 
325 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.823968  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3767  putative hydrolase  39.03 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.436536 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3659  putative hydrolase  38.32 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.620605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3733  putative hydrolase  39.03 
 
 
340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.805854  normal  0.0665077 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3830  putative hydrolase  38.32 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0736  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 
327 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3286  alpha/beta hydrolase fold  36.95 
 
 
327 aa  163  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0855  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
347 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2403  alpha/beta hydrolase fold  40.4 
 
 
356 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5341  Alpha/beta hydrolase fold  41.5 
 
 
332 aa  162  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3484  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
347 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0890  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
347 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3658  putative hydrolase  37.96 
 
 
319 aa  161  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3122  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
342 aa  161  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.966432  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0034  hydrolase of the alpha/beta-hydrolase fold-like protein  37.08 
 
 
386 aa  161  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000016789  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3728  putative hydrolase  39.09 
 
 
340 aa  160  3e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03204  predicted hydrolase  38.71 
 
 
340 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.134482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0359  alpha/beta hydrolase fold protein  38.71 
 
 
340 aa  160  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03156  hypothetical protein  38.71 
 
 
340 aa  160  4e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.122638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4663  putative hydrolase  38.71 
 
 
340 aa  160  4e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0421817  normal  0.05896 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03978  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
344 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3823  putative hydrolase  38.71 
 
 
340 aa  160  4e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0448783  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0022  hypothetical protein  32.97 
 
 
350 aa  160  5e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.380051  normal  0.0500502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3550  putative hydrolase  39.51 
 
 
340 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.9263  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0359  putative hydrolase  39.09 
 
 
340 aa  159  6e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4755  alpha/beta fold family hydrolase  38.61 
 
 
344 aa  159  7e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0445386 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0878  alpha/beta hydrolase fold protein  36.33 
 
 
347 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00072  putative hydrolase  37.6 
 
 
335 aa  159  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1008  alpha/beta hydrolase fold protein  38.37 
 
 
321 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00606809  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3635  putative hydrolase  39.09 
 
 
340 aa  158  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.617226  hitchhiker  0.0000831591 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3000  hypothetical protein  37.7 
 
 
325 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0589  alpha/beta hydrolase fold  36.73 
 
 
327 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.532297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4180  alpha/beta hydrolase fold  39.72 
 
 
327 aa  157  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0134  alpha/beta hydrolase fold  38.21 
 
 
353 aa  156  7e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  36.58 
 
 
330 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0230064 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3505  alpha/beta hydrolase fold  35.1 
 
 
326 aa  156  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700909  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04840  hypothetical protein  38.63 
 
 
332 aa  155  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0421  hydrolase, alpha/beta fold family  35.94 
 
 
337 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0463  hypothetical protein  38.27 
 
 
332 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.307827  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0488  alpha/beta hydrolase fold  39.26 
 
 
321 aa  155  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5117  alpha/beta fold family hydrolase  39.38 
 
 
330 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1043  hypothetical protein  36.44 
 
 
326 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3780  putative hydrolase  37.65 
 
 
340 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0186907  normal  0.0139387 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3288  alpha/beta hydrolase fold  36.84 
 
 
338 aa  153  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.897046  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1399  hypothetical protein  35.66 
 
 
327 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1427  Alpha/beta hydrolase fold-1  42.74 
 
 
334 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0296  putative hydrolase  36.4 
 
 
322 aa  151  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>