More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0270 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0270  putative transmembrane protein  100 
 
 
174 aa  359  9e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0217  redoxin domain-containing protein  80.7 
 
 
171 aa  280  7.000000000000001e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.219465 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4901  Redoxin domain protein  85.11 
 
 
165 aa  261  4.999999999999999e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.273187  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0292  redoxin domain-containing protein  79.43 
 
 
167 aa  250  7e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102715 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0287  Redoxin domain protein  79.43 
 
 
167 aa  250  7e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.610229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0350  redoxin domain-containing protein  78.17 
 
 
168 aa  249  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00112402 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0405  redoxin domain-containing protein  77.3 
 
 
203 aa  246  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1278  redoxin domain-containing protein  71.63 
 
 
167 aa  230  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0318  hypothetical protein  65.96 
 
 
166 aa  213  9e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0164115  normal  0.0202423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0233  thioredoxin-like protein  56.44 
 
 
179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0333  putative transmembrane protein  58.18 
 
 
213 aa  197  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.847937  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0521  Redoxin domain protein  64.03 
 
 
176 aa  194  7e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.037804  normal  0.85402 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0228  redoxin domain-containing protein  57.42 
 
 
174 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454071  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4194  putative thiol-disulfide isomerase and thioredoxins  63.31 
 
 
176 aa  193  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.462178 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0190  Redoxin domain protein  60.28 
 
 
186 aa  192  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.968687  normal  0.596413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0196  Redoxin domain protein  55.21 
 
 
185 aa  191  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0104775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0402  hypothetical protein  62.14 
 
 
178 aa  189  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4046  redoxin domain-containing protein  54.19 
 
 
166 aa  187  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3225  hypothetical protein  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0643  resA domain-containing protein  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.826532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1393  hypothetical protein  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0459  putative thiol-disulfide oxidoreductase  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0200  hypothetical protein  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2819  hypothetical protein  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0479  putative thiol-disulfide oxidoreductase  61.43 
 
 
178 aa  187  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6212  Thiol-disulfide isomerase/thioredoxin-like  60.14 
 
 
194 aa  185  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0433  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
179 aa  184  5e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2925  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
178 aa  184  7e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0284  putative transmembrane protein  58.16 
 
 
178 aa  183  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2787  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
178 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.787444  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2881  redoxin domain-containing protein  60.71 
 
 
178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2256  redoxin  60 
 
 
178 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.087584  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2870  redoxin domain-containing protein  60 
 
 
178 aa  181  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0218082  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2431  putative thioredoxin  55.15 
 
 
164 aa  170  7.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0247  Redoxin domain protein  48.53 
 
 
165 aa  152  2e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.549118  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0475  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  44.1 
 
 
173 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0399  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  34.5 
 
 
171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.689513  normal  0.928423 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0206  Redoxin domain protein  38.93 
 
 
167 aa  128  3e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2412  Redoxin domain protein  34.13 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1257  resA domain-containing protein  38.36 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0861  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  36.69 
 
 
189 aa  100  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.155376  hitchhiker  0.00638708 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2145  Redoxin domain protein  34.81 
 
 
172 aa  100  1e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.765284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0432  redoxin domain-containing protein  31.62 
 
 
169 aa  97.8  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0116447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1569  putative thioredoxin  38.39 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000853418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3927  thioredoxin-like  32.85 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.298512  normal  0.186192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0325  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.81 
 
 
189 aa  90.9  8e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0365546 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0181  alkyl hydroperoxide reductase  28.4 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0243778  normal  0.461108 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1634  thiol-disulfide oxidoreductase  29.38 
 
 
173 aa  84.3  8e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1598  thiol-disulfide oxidoreductase  28.9 
 
 
173 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.966744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2903  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.81 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1356  thiol-disulfide oxidoreductase  32.59 
 
 
173 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1396  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0272  thioredoxin family protein  33.73 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.900103 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6172  Redoxin domain protein  32.76 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3817  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  80.5  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000518727 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4497  Redoxin domain protein  33.82 
 
 
691 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1383  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1494  thiol-disulfide oxidoreductase  30.06 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1533  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.16 
 
 
193 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1197  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  79.7  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1566  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.62392e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1528  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  78.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1355  thiol-disulfide oxidoreductase  29.48 
 
 
173 aa  77.8  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5686  redoxin domain-containing protein  32.89 
 
 
186 aa  77.8  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.131775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2908  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like  33.53 
 
 
199 aa  77.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.629655  normal  0.543638 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2939  redoxin domain-containing protein  31.79 
 
 
179 aa  77  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.670984  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2222  thiol-disulfide oxidoreductase  32.84 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000493791  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2276  Redoxin domain protein  30.72 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0240  Redoxin domain protein  31.39 
 
 
188 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0816  putative transmembrane protein  32.35 
 
 
622 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.420472 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2010  redoxin domain-containing protein  31.11 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3290  redoxin domain-containing protein  29.24 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680402  normal  0.588727 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0539  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.62 
 
 
435 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2408  hypothetical protein  31.01 
 
 
160 aa  74.7  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.908805  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3951  Thiol-disulfide isomerase and thioredoxins-like protein  28.57 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.337329 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1959  redoxin domain-containing protein  28.78 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0329542  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1358  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  35.25 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000315647  hitchhiker  0.00000356135 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1890  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.38 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.326681  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2803  putative thioredoxin  30.15 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.482325  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0868  Redoxin domain protein  31.06 
 
 
469 aa  73.6  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1911  redoxin domain-containing protein  29.09 
 
 
184 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.58722  normal  0.231287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2405  redoxin domain protein  30.29 
 
 
178 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  26.21 
 
 
168 aa  72.8  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1661  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.39 
 
 
192 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1843  thioredoxin-like  32.34 
 
 
164 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5008  Redoxin domain protein  29.5 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437471  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0399  thiol-disulfide oxidoreductase  34.21 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3317  AhpC/TSA family protein  28.19 
 
 
191 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0047  hypothetical protein  23.81 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.147207  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0468  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  28.35 
 
 
589 aa  72.4  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00332396  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5033  redoxin domain-containing protein  32.21 
 
 
581 aa  72  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.807705  normal  0.724504 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3405  ahpC/TSA family protein  28.19 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3367  AhpC/TSA family protein  28.19 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0144546  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0048  Redoxin domain protein  23.81 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0534182  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2095  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.89 
 
 
288 aa  72  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3674  ahpC/TSA family protein  28.19 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.309572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3623  ahpC/TSA family protein  28.19 
 
 
191 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131744 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3911  hypothetical protein  30.17 
 
 
189 aa  71.6  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2023  redoxin domain-containing protein  29.13 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.388068 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6264  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.33 
 
 
173 aa  70.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>