93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0118 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0118  hypothetical protein  100 
 
 
294 aa  592  1e-168  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0064  hypothetical protein  62.63 
 
 
305 aa  317  2e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3200  hypothetical protein  37.18 
 
 
320 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.437465  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3295  hypothetical protein  36.82 
 
 
320 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.104823  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3920  hypothetical protein  40.47 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4371  hypothetical protein  38.86 
 
 
343 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.287602  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1019  hypothetical protein  39.05 
 
 
326 aa  115  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.237359  normal  0.123447 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0071  hypothetical protein  34.26 
 
 
308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.603187  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2566  hypothetical protein  36.67 
 
 
295 aa  112  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  0.0363066 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2741  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  27.65 
 
 
288 aa  104  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.127946  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5084  hypothetical protein  35.05 
 
 
302 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12443  hypothetical protein  26.97 
 
 
288 aa  98.2  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.134258  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3100  hypothetical protein  37.85 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00381116  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2954  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  32.04 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3537  hydrolase  28.16 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.297749  normal  0.0703626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1880  hydrolase, putative  32.06 
 
 
277 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000946  predicted hydrolase or acyltransferase  29.44 
 
 
285 aa  89.4  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1979  hydrolase, putative  32.06 
 
 
293 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.708266  normal  0.0224758 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06957  hypothetical protein  27.34 
 
 
284 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3781  hypothetical protein  32.54 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.447414 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0089  alpha/beta hydrolase fold protein  33.65 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1510  hydrolase  32.99 
 
 
277 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0758387  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2228  hypothetical protein  30.3 
 
 
301 aa  85.5  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1542  hydrolase  32.06 
 
 
277 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.884296  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0078  hypothetical protein  29.72 
 
 
363 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.682762  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1578  hypothetical protein  28.51 
 
 
305 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.289717  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0093  hypothetical protein  30.55 
 
 
333 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1230  hypothetical protein  26.71 
 
 
295 aa  82  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1908  hypothetical protein  30.84 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.714341  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0273  hypothetical protein  31.1 
 
 
277 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2243  hypothetical protein  28.97 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.641786 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2000  putative hydrolase  32.49 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445681  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2731  hypothetical protein  31 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0719  hypothetical protein  26.3 
 
 
283 aa  77  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0235  alpha/beta fold family hydrolase/acetyltransferase-like protein  22.82 
 
 
287 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23610  putative hydrolase  31.98 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0107656 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2857  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  30.95 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0961  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26.39 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6287  Protein of unknown function DUF829  24.91 
 
 
308 aa  70.1  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000137217  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2021  hypothetical protein  28.62 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1528  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
295 aa  57.4  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.109222  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02180  hypothetical protein  26.15 
 
 
285 aa  55.8  0.0000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431162  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4246  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  26.7 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02220  hypothetical protein  29.58 
 
 
151 aa  50.8  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0766  protein of unknown function UPF0227  27.52 
 
 
213 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0182616  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2720  hypothetical protein  26.2 
 
 
288 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0497  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  34.71 
 
 
326 aa  49.3  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.702531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0773  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.225043  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2593  hypothetical protein  26.09 
 
 
288 aa  49.3  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0766  protein of unknown function UPF0227  28.39 
 
 
213 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.166666  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0536  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  36.04 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.13712  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0600  alpha/beta hydrolase fold protein  31.13 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  29.44 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3693  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249037  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0729  hypothetical protein  29.11 
 
 
213 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.151283  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0033  alpha/beta hydrolase fold  25.29 
 
 
245 aa  46.6  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0204897  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3067  alpha/beta hydrolase fold protein  34.62 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0317  alpha/beta hydrolase fold protein  29.03 
 
 
270 aa  45.8  0.0007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3012  alpha/beta hydrolase fold protein  26.71 
 
 
257 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5071  alpha/beta hydrolase fold protein  26.58 
 
 
258 aa  45.8  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.1456  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6038  alpha/beta hydrolase fold  37.5 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3047  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  24.17 
 
 
322 aa  44.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0033788  normal  0.0365868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4171  Alpha/beta hydrolase  31.3 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.753522 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2861  hypothetical protein  30.25 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.759766  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2823  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like protein  28.65 
 
 
298 aa  44.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.628077  hitchhiker  0.0000422692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0016  hypothetical protein  26.02 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0652616  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3537  hydroxymuconic semialdehyde hydrolase  32.76 
 
 
364 aa  45.1  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0692853  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0402  alpha/beta hydrolase  34.86 
 
 
279 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3296  lipase class 2  37.89 
 
 
269 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0433  alpha/beta hydrolase fold protein  26.59 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0369165 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3187  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2963  alpha/beta fold family hydrolase  28.17 
 
 
294 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0480024  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3194  hydrolase, alpha/beta fold family  30.69 
 
 
294 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2524  alpha/beta hydrolase fold  28.7 
 
 
298 aa  43.9  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.29675  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1140  alpha/beta hydrolase fold  33.61 
 
 
320 aa  43.5  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.64719  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  29.89 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  29.89 
 
 
257 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2371  alpha/beta hydrolase  48.84 
 
 
307 aa  43.9  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1664  biotin biosynthesis protein  26.45 
 
 
266 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000138969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5411  alpha/beta hydrolase fold  38.32 
 
 
328 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.173049  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1017  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3298  hypothetical protein  31.47 
 
 
258 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.24994 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3471  hypothetical protein  27.43 
 
 
346 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00814708  normal  0.0128329 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3638  alpha/beta hydrolase fold  30.83 
 
 
290 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.475063  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  27.94 
 
 
259 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3712  alpha/beta hydrolase fold protein  30.83 
 
 
290 aa  42.7  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1303  alpha/beta hydrolase fold protein  37.7 
 
 
299 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.427571  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0906  PGAP1-like protein  27.48 
 
 
344 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  24.37 
 
 
282 aa  42.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2246  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0099  putative lipoprotein  28.46 
 
 
390 aa  42.4  0.01  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3504  magnesium-chelatase 30 kDa subunit  29.84 
 
 
302 aa  42.4  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.477882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>