More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0101 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 234 aa  470  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  92.31 
 
 		 234 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  87.61 
 
 		 234 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  87.18 
 
 		 234 aa  375  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  83.33 
 
 		 234 aa  352  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  60.87 
 
 		 233 aa  282  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  57.69 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  59.82 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  57.69 
 
 		 234 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  59.36 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  59.36 
 
 		 234 aa  241  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  59.36 
 
 		 234 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  55.46 
 
 		 232 aa  224  6e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.68 
 
 		 235 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  53.65 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  52.79 
 
 		 234 aa  211  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  52.79 
 
 		 332 aa  205  6e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  48.86 
 
 		 235 aa  198  5e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 227 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.36 
 
 		 241 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  52.29 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46 
 
 		 276 aa  185  5e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.77 
 
 		 258 aa  183  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.68 
 
 		 233 aa  182  4.0000000000000006e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.39 
 
 		 242 aa  179  4e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  48.23 
 
 		 228 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 		 243 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  47.79 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  44.14 
 
 		 256 aa  175  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  47.09 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  49.33 
 
 		 241 aa  169  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  38.94 
 
 		 237 aa  168  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.01 
 
 		 245 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  42.22 
 
 		 244 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.74 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  41.7 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  43.84 
 
 		 235 aa  152  5e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.26 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  42.08 
 
 		 238 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  42.49 
 
 		 239 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.94 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 		 243 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  33.48 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.43 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.98 
 
 		 239 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  34.27 
 
 		 244 aa  115  7.999999999999999e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  37.05 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  37.7 
 
 		 244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6205  short chain dehydrogenase  31.96 
 
 		 274 aa  99.8  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3439  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.16 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.349709 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2279  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 272 aa  95.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 		 418 aa  94.4  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.64 
 
 		 314 aa  94.7  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  36.02 
 
 		 304 aa  93.6  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.43 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2965  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.04 
 
 		 293 aa  93.2  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.57 
 
 		 270 aa  92.8  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.2 
 
 		 245 aa  92.8  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.55 
 
 		 317 aa  92.4  5e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 271 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.318083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.06 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.479047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  34.74 
 
 		 286 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0106  short chain dehydrogenase  31.47 
 
 		 284 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.417565  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  31.58 
 
 		 272 aa  90.1  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1778  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.92 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.809428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2675  hypothetical protein  30.88 
 
 		 417 aa  90.1  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  33.89 
 
 		 283 aa  89.7  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 250 aa  89.4  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.06 
 
 		 338 aa  89.4  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4153  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.24 
 
 		 273 aa  88.6  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  33.89 
 
 		 283 aa  88.6  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.93 
 
 		 268 aa  89  7e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  36.18 
 
 		 279 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4962  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.07 
 
 		 290 aa  88.2  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000187582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.76 
 
 		 244 aa  87.8  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.91 
 
 		 247 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1505  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  33.5 
 
 		 244 aa  87  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0160485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5083  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.35 
 
 		 250 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0604  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.22 
 
 		 268 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710903  normal  0.301955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0228  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 306 aa  86.3  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1996  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.52 
 
 		 279 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000141613  normal  0.0207226 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2916  oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family  31.15 
 
 		 250 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.167673  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1497  protein of unknown function DUF35  29.82 
 
 		 417 aa  85.9  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.84 
 
 		 251 aa  85.5  7e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 284 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.42 
 
 		 256 aa  85.5  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 284 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.98 
 
 		 284 aa  85.1  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3972  short chain dehydrogenase  36.13 
 
 		 441 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>