27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0098 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  64.86 
 
 		 138 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  57.52 
 
 		 121 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3459  hypothetical protein  43.33 
 
 		 125 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1578  putative signal peptide protein  37.93 
 
 		 134 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1214  putative signal peptide protein  40.54 
 
 		 138 aa  83.2  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.368519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1842  putative signal peptide protein  31.01 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2316  hypothetical protein  33.33 
 
 		 122 aa  70.1  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1968  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1991  hypothetical protein  32.48 
 
 		 129 aa  68.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.505887  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  36.11 
 
 		 116 aa  66.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4778  putative signal peptide protein  34.48 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.221864  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02499  hypothetical protein  35.92 
 
 		 121 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0456  protein of unknown function DUF861 cupin_3  34.91 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1353  TonB-dependent receptor  27.83 
 
 		 125 aa  50.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2991  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 		 125 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  40 
 
 		 172 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  30.19 
 
 		 189 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  27.42 
 
 		 190 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0187  TonB-dependent receptor  30.1 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  31.9 
 
 		 152 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  28.95 
 
 		 203 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1385  protein of unknown function DUF861 cupin_3  38.81 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000336735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  32.26 
 
 		 132 aa  43.5  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0938  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 129 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.278087  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3892  hypothetical protein  35.29 
 
 		 205 aa  42.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0392964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>