22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0087 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0087  hypothetical protein  100 
 
 
276 aa  560  1e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2925  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  78.99 
 
 
276 aa  447  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2421  semialdehyde dehydrogenase NAD - binding  77.9 
 
 
276 aa  444  1e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4653  hypothetical protein  73.36 
 
 
275 aa  414  1e-115  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.315155 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3771  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  71.9 
 
 
274 aa  408  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.303895  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4760  hypothetical protein  72.26 
 
 
275 aa  408  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.342665  normal  0.621929 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3065  hypothetical protein  70.07 
 
 
275 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3119  hypothetical protein  64.98 
 
 
278 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000757637 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1069  hypothetical protein  59.64 
 
 
279 aa  324  8e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.270038  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3066  hypothetical protein  43.13 
 
 
285 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0930986 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2651  NADP oxidoreductase coenzyme F420-dependent  41.03 
 
 
284 aa  197  2e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.26 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.26 
 
 
272 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0992  cyclohexadienyl dehydrogenase  33.06 
 
 
312 aa  45.8  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.04 
 
 
272 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2212  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.62 
 
 
311 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.45 
 
 
272 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2100  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.47 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1408  cyclohexadienyl dehydrogenase  43.04 
 
 
311 aa  43.9  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.19218  normal  0.384152 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2549  cyclohexadienyl dehydrogenase  34.56 
 
 
308 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.554787  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  30.61 
 
 
276 aa  43.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2945  cyclohexadienyl dehydrogenase  36.96 
 
 
313 aa  42.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0241407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>