More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0075 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0075  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 
208 aa  405  1e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0065  lysine exporter protein LysE/YggA  84.13 
 
 
208 aa  330  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.969114 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  73.76 
 
 
204 aa  306  1e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.743196  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0028  lysine exporter protein LysE/YggA  73.76 
 
 
204 aa  306  1e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.214928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0053  lysine exporter protein LysE/YggA  71.78 
 
 
204 aa  302  3e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1065  lysine exporter protein LysE/YggA  74.26 
 
 
204 aa  301  6e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.180582  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0048  lysine exporter protein LysE/YggA  75.25 
 
 
204 aa  296  2e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1303  amino acid transporter LysE  71.14 
 
 
201 aa  292  2e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.520276  normal  0.253886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0047  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  77.72 
 
 
204 aa  288  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4143  lysine exporter protein LysE/YggA  66.67 
 
 
205 aa  278  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218888  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4604  lysine exporter protein LysE/YggA  66.83 
 
 
203 aa  275  4e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  64.71 
 
 
205 aa  269  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.476992 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1248  amino acid transporter LysE  63.59 
 
 
255 aa  268  3e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.483142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4198  lysine exporter protein LysE/YggA  57.29 
 
 
203 aa  229  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4028  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  46.6 
 
 
209 aa  181  5e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.180103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3399  lysine exporter protein LysE/YggA  41.95 
 
 
221 aa  142  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1168  leucine export protein LeuE  35 
 
 
223 aa  121  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.950564  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2059  LysE family amino acid efflux protein  31.31 
 
 
217 aa  121  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.513091  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1845  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.29 
 
 
212 aa  120  2e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1291  leucine export protein LeuE  34.72 
 
 
219 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1886  leucine export protein LeuE  35.29 
 
 
212 aa  120  2e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0810  leucine export protein LeuE  34.72 
 
 
219 aa  120  2e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1835  leucine export protein LeuE  35.29 
 
 
212 aa  120  2e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2383  lysine exporter protein LysE/YggA  31.31 
 
 
217 aa  120  2e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.77882  normal  0.612853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1390  leucine export protein LeuE  34.8 
 
 
212 aa  117  9e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547214  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2024  leucine export protein LeuE  34.8 
 
 
212 aa  117  9e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.74933e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01756  hypothetical protein  34.31 
 
 
212 aa  117  1e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01768  neutral amino-acid efflux system  34.31 
 
 
212 aa  117  1e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1262  leucine export protein LeuE  34.26 
 
 
219 aa  117  1e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00908947  normal  0.254179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4433  leucine export protein LeuE  34.56 
 
 
219 aa  117  2e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0518339  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2524  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  116  2e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2194  leucine export protein LeuE  32.71 
 
 
223 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250499  normal  0.121922 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1442  lysine exporter protein LysE/YggA  29.91 
 
 
217 aa  113  2e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.754857 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1359  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  112  4e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0105441  normal  0.312431 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2029  leucine export protein LeuE  34.86 
 
 
219 aa  112  4e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1375  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000252722  hitchhiker  7.30997e-05 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1391  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.036985  normal  0.343779 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1911  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  8.08789e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2092  leucine export protein LeuE  34.31 
 
 
212 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0133634  hitchhiker  1.59654e-06 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2918  leucine export protein LeuE  30.19 
 
 
211 aa  111  7e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.438377 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1727  leucine export protein LeuE  33.49 
 
 
224 aa  111  7e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.859689 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2035  leucine export protein LeuE  33.49 
 
 
224 aa  111  7e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2176  leucine export protein LeuE  31.63 
 
 
227 aa  109  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.902588  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1180  leucine export protein LeuE  31.88 
 
 
223 aa  108  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1017  lysine exporter protein LysE/YggA  30.48 
 
 
218 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.0336e-06  hitchhiker  0.001054 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1324  leucine export protein LeuE  33.5 
 
 
222 aa  106  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0341072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2782  leucine export protein LeuE  32.47 
 
 
219 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.207314  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0771  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.398532  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1609  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62920  leucine export protein LeuE  31.9 
 
 
216 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0586  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.117669  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0565  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1506  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.619764  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1282  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1476  leucine export protein LeuE  32.31 
 
 
220 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5477  leucine export protein LeuE  31.43 
 
 
216 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1914  leucine export protein LeuE  33.18 
 
 
216 aa  105  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250271  normal  0.498691 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1018  lysine exporter protein  33.8 
 
 
218 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  0.285378 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0073  transporter transmembrane protein  32.38 
 
 
215 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163554  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1412  leucine export protein LeuE  30.45 
 
 
222 aa  102  5e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.250602 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.31 
 
 
208 aa  101  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0277  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30 
 
 
208 aa  101  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.15 
 
 
211 aa  101  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3114  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.03 
 
 
224 aa  100  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.683402  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0986  leucine export protein LeuE  32.86 
 
 
225 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1371  leucine export protein LeuE  30.32 
 
 
222 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0655348  hitchhiker  0.00242186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2005  leucine export protein LeuE  30.94 
 
 
226 aa  100  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214703  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2925  amino acid transporter LysE  28.78 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0920317  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3865  lysine exporter protein LysE/YggA  27.18 
 
 
210 aa  99.4  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.149729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  35.96 
 
 
205 aa  99  4e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2900  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.88 
 
 
209 aa  99  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.48366  normal  0.297506 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2293  leucine export protein LeuE  35.12 
 
 
211 aa  97.8  9e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.993752  normal  0.789702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1520  leucine export protein LeuE  32.08 
 
 
220 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.73556  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3676  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.78 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  35.71 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.84 
 
 
211 aa  96.7  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5030  lysine exporter protein LysE/YggA  33.16 
 
 
242 aa  96.7  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0778866  normal  0.678911 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0300  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.36 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  37.07 
 
 
204 aa  95.9  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3353  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  31.6 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4520  lysine exporter protein LysE/YggA  33.18 
 
 
211 aa  95.9  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.286419  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2243  amino acid efflux pump, RhtB family protein  31.66 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.810397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0273  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.32 
 
 
205 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3817  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
208 aa  95.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0893485  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3704  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
208 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.326067  normal  0.173855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3105  lysine exporter protein LysE/YggA  32.51 
 
 
207 aa  94  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4659  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
208 aa  94  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.80151  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29500  putative threonine efflux protein  31.71 
 
 
207 aa  93.2  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.585854  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2355  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2277  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0348  homoserine/homoserine lactone efflux protein  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.47 
 
 
204 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0144  homoserine/threonine efflux protein, putative  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2803  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.31 
 
 
205 aa  93.2  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0162  LysE family translocator protein  28.99 
 
 
211 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2405  lysine exporter protein LysE/YggA  32.8 
 
 
208 aa  92.8  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6008  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.54 
 
 
208 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435355 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  31.1 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3434  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.05 
 
 
218 aa  92  5e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>