184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0038 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0038  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
353 aa  707  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0020  glycine oxidase ThiO  81.2 
 
 
355 aa  574  1e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.504997 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0147  FAD dependent oxidoreductase  44.25 
 
 
350 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1748  glycine oxidase  40.82 
 
 
340 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0438  glycine oxidase ThiO  40.82 
 
 
340 aa  287  2e-76  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.017801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0163  FAD dependent oxidoreductase  47.03 
 
 
410 aa  265  7e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0452  FAD-dependent oxidoreductase  37.65 
 
 
354 aa  262  8e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0206  FAD dependent oxidoreductase  45.08 
 
 
402 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1932  FAD dependent oxidoreductase  38.44 
 
 
410 aa  256  5e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0112  putative D-amino acid oxidase flavoprotein oxidoreductase  45.16 
 
 
379 aa  255  8e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.333695  normal  0.56231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1456  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.64 
 
 
394 aa  254  1e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.712312  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4314  FAD dependent oxidoreductase  46.86 
 
 
378 aa  253  4e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.274376  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1936  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 
374 aa  250  3e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.969419  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2697  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 
378 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1786  FAD dependent oxidoreductase  43.82 
 
 
374 aa  249  4e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0563944  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0410  FAD dependent oxidoreductase  46.2 
 
 
378 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.533271  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0570  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 
353 aa  248  1e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3643  FAD dependent oxidoreductase  44.78 
 
 
381 aa  247  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1460  hypothetical protein  39.02 
 
 
356 aa  247  3e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0328  FAD dependent oxidoreductase  46.65 
 
 
378 aa  245  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3319  FAD dependent oxidoreductase  44.48 
 
 
381 aa  246  6e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0389  FAD dependent oxidoreductase  45.95 
 
 
378 aa  245  7e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3008  oxidoreductase, FAD-binding  44.64 
 
 
377 aa  245  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0313  FAD dependent oxidoreductase  46.82 
 
 
378 aa  244  1e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235316  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0337  FAD dependent oxidoreductase  46.36 
 
 
378 aa  244  1e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.832252  normal  0.324335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3575  FAD dependent oxidoreductase  43.71 
 
 
376 aa  244  1e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.747856  hitchhiker  2.18413e-06 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3508  FAD dependent oxidoreductase  45.16 
 
 
378 aa  244  2e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.544782  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3739  glycine oxidase ThiO  45.19 
 
 
377 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3681  glycine oxidase ThiO  45.19 
 
 
377 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1523  hypothetical protein  39.41 
 
 
356 aa  241  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2431  FAD dependent oxidoreductase  44.86 
 
 
367 aa  239  6e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.779457 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2730  oxidoreductase, FAD-binding  44.9 
 
 
377 aa  239  6e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3224  glycine oxidase ThiO  44.9 
 
 
377 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3710  oxidoreductase, FAD-binding  44.9 
 
 
377 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2780  glycine oxidase ThiO  44.9 
 
 
377 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1773  glycine oxidase ThiO  44.9 
 
 
377 aa  238  8e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3068  FAD dependent oxidoreductase  43.42 
 
 
372 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0186757  normal  0.325054 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0383  putative D-amino acid oxidase flavoprotein  43.3 
 
 
376 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2398  FAD dependent oxidoreductase  44 
 
 
363 aa  234  2e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2774  FAD dependent oxidoreductase  41.71 
 
 
386 aa  234  2e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.300759  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2464  FAD dependent oxidoreductase  45.06 
 
 
358 aa  234  2e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.112989  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3293  FAD dependent oxidoreductase  41.52 
 
 
398 aa  229  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.204133 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0251  oxidoreductase, FAD-dependent  34.96 
 
 
393 aa  224  2e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0947  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 
374 aa  222  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2166  glycine oxidase ThiO  38.94 
 
 
346 aa  221  1e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.402403 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0895  FAD dependent oxidoreductase  38.59 
 
 
365 aa  219  4e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321446  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1609  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO, putative  43.8 
 
 
360 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1958  glycine oxidase ThiO  38.82 
 
 
338 aa  214  2e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0655991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3428  glycine oxidase ThiO  38.24 
 
 
369 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2464  FAD dependent oxidoreductase  38.78 
 
 
338 aa  210  3e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.750874  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4092  FAD dependent oxidoreductase  38.01 
 
 
368 aa  206  6e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0346042  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6222  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  39.64 
 
 
338 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.787474  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2891  glycine oxidase ThiO  37.39 
 
 
338 aa  203  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.894969  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1414  glycine oxidase ThiO  37.24 
 
 
339 aa  202  1e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2166  glycine oxidase ThiO  36.31 
 
 
337 aa  196  6e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.232699  normal  0.765835 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0445  thiamine biosynthesis oxidoreductase  33.72 
 
 
316 aa  195  9e-49  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0284  glycine oxidase ThiO  35.22 
 
 
334 aa  194  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0217  D-amino acid oxidase family protein  35.93 
 
 
334 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0208  glycine oxidase ThiO  35.93 
 
 
334 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0009  glycine oxidase ThiO  37.95 
 
 
338 aa  193  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.363265 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2562  glycine oxidase ThiO  35.82 
 
 
331 aa  189  5e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.185136  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3650  glycine oxidase ThiO  36.34 
 
 
324 aa  185  1e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0914  glycine oxidase ThiO  36.34 
 
 
325 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173839  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6396  glycine oxidase ThiO  36.76 
 
 
316 aa  179  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0041  FAD dependent oxidoreductase  34.97 
 
 
325 aa  172  6e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.161257  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5918  glycine oxidase ThiO  32.56 
 
 
330 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.669561  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4173  glycine oxidase ThiO  36.8 
 
 
334 aa  166  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.269428 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2099  glycine oxidase ThiO  29.32 
 
 
374 aa  115  8e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.119028  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34650  glycine oxidase  32.01 
 
 
375 aa  115  1e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.048332  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1152  glycine oxidase ThiO  30.79 
 
 
360 aa  102  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0708  glycine oxidase ThiO  31.34 
 
 
338 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.740866  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3405  glycine oxidase ThiO  29.77 
 
 
371 aa  97.8  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.289575  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3033  glycine oxidase ThiO  26.82 
 
 
382 aa  97.8  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000572882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3888  glycine oxidase ThiO  30.31 
 
 
385 aa  96.3  8e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0989  glycine oxidase ThiO  29.33 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.136129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2783  glycine oxidase ThiO  29.55 
 
 
372 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.256999  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2223  glycine oxidase ThiO  29.16 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.210224 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2170  aromatic-ring hydroxylase  29.58 
 
 
371 aa  90.9  3e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1044  thiamine biosynthesis oxidoreductase ThiO  28.69 
 
 
391 aa  89.4  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4279  glycine oxidase ThiO  29.71 
 
 
398 aa  89  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.196313  hitchhiker  0.00513964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4390  glycine oxidase ThiO  27.64 
 
 
361 aa  87  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0408  glycine oxidase ThiO  26.8 
 
 
335 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0882665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0773  glycine oxidase ThiO  29.87 
 
 
392 aa  86.7  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.194429 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10420  thiamine biosynthesis oxidoreductase thiO  28.93 
 
 
340 aa  85.1  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.219353  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5997  glycine oxidase ThiO  27.75 
 
 
388 aa  84.3  3e-15  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.217156 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1340  glycine oxidase ThiO  27.43 
 
 
375 aa  83.6  5e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.55181  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0605  glycine oxidase ThiO  26.23 
 
 
440 aa  82.4  1e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.14254  normal  0.0463062 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2723  FAD dependent oxidoreductase  28.11 
 
 
378 aa  81.6  2e-14  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4885  glycine oxidase ThiO  27.87 
 
 
384 aa  79  1e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1286  glycine oxidase ThiO  28.7 
 
 
356 aa  79  1e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0197  glycine oxidase ThiO  30.2 
 
 
342 aa  76.3  9e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0577  glycine oxidase ThiO  25.82 
 
 
405 aa  75.5  1e-12  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0616  glycine oxidase ThiO  25.68 
 
 
411 aa  74.7  2e-12  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.121955 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1380  glycine/D-amino acid oxidase family protein  25 
 
 
367 aa  73.9  4e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0143  glycine oxidase ThiO  28.29 
 
 
375 aa  73.9  4e-12  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.23525 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00611  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  25.29 
 
 
367 aa  73.9  4e-12  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.741936  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3116  glycine oxidase ThiO  26.61 
 
 
393 aa  73.9  4e-12  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.248059  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0964  glycine oxidase ThiO  28.03 
 
 
373 aa  72.8  7e-12  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0284  glycine oxidase ThiO  23.46 
 
 
367 aa  73.2  7e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00610276 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00541  putative thiamine biosynthesis oxidoreductase  26.36 
 
 
386 aa  72  1e-11  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>