15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0004 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_0056  hypothetical protein  57.73 
 
 
660 aa  786  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00640513  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3690  hypothetical protein  60.37 
 
 
657 aa  825  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  2.60745e-06  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0004  hypothetical protein  100 
 
 
660 aa  1355  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0778574  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0298  hypothetical protein  46.73 
 
 
652 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  5.64529e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1858  hypothetical protein  47.89 
 
 
660 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153141  normal  0.576375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0338  hypothetical protein  48.1 
 
 
651 aa  607  1e-172  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.73528e-05  normal  0.110861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3802  hypothetical protein  46.97 
 
 
651 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000317632  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3623  hypothetical protein  47.34 
 
 
651 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3491  hypothetical protein  46.5 
 
 
651 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000969843  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1178  hypothetical protein  37.22 
 
 
673 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  36.15 
 
 
662 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  6.29904e-06  normal  0.50337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2943  hypothetical protein  38.29 
 
 
659 aa  344  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  32.95 
 
 
634 aa  260  5e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  2.01568e-06  normal  0.805939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1296  hypothetical protein  41.18 
 
 
74 aa  55.5  3e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  21.71 
 
 
793 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.604428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>