15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0004 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3690  hypothetical protein  60.37 
 
 		 657 aa  825    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000260745  normal  0.0669321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0004  hypothetical protein  100 
 
 		 660 aa  1355    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0778574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0056  hypothetical protein  57.73 
 
 		 660 aa  786    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00640513  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0298  hypothetical protein  46.73 
 
 		 652 aa  622  1e-177  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000564529  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1858  hypothetical protein  47.89 
 
 		 660 aa  617  1e-175  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.153141  normal  0.576375 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0338  hypothetical protein  48.1 
 
 		 651 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000473528  normal  0.110861 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3802  hypothetical protein  46.97 
 
 		 651 aa  600  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000317632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3623  hypothetical protein  47.34 
 
 		 651 aa  596  1e-169  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3491  hypothetical protein  46.5 
 
 		 651 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000969843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1178  hypothetical protein  37.22 
 
 		 673 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.238689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0802  hypothetical protein  36.15 
 
 		 662 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000629904  normal  0.50337 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2943  hypothetical protein  38.29 
 
 		 659 aa  344  4e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0351  hypothetical protein  32.95 
 
 		 634 aa  260  5.0000000000000005e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00000201568  normal  0.805939 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1296  hypothetical protein  41.18 
 
 		 74 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1124  AAA ATPase  21.71 
 
 		 793 aa  48.9  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604428 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>