29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7359 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7359  phage integrase  100 
 
 
579 aa  1187    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88342  normal  0.88087 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6253  phage integrase  36.49 
 
 
552 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0098  hypothetical protein  33.12 
 
 
538 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3610  hypothetical protein  30.26 
 
 
559 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1211  hypothetical protein  29.63 
 
 
548 aa  216  5.9999999999999996e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.643556  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3443  hypothetical protein  29.54 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3482  hypothetical protein  29.54 
 
 
545 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4321  hypothetical protein  33.53 
 
 
330 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6273  hypothetical protein  27.63 
 
 
633 aa  126  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751843  normal  0.444824 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6754  hypothetical protein  26.44 
 
 
633 aa  110  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5715  hypothetical protein  27.36 
 
 
324 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.386341  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0167  hypothetical protein  25.36 
 
 
629 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4985  hypothetical protein  26.41 
 
 
595 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0529  hypothetical protein  26.41 
 
 
595 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130758  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3036  hypothetical protein  26.41 
 
 
595 aa  60.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.815959 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3163  hypothetical protein  25.11 
 
 
602 aa  58.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.738774  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7314  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528529  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7405  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7707  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26795  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1470  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0264078  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3329  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0267  hypothetical protein  22.6 
 
 
603 aa  57.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7365  hypothetical protein  25.87 
 
 
599 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3930  hypothetical protein  26.32 
 
 
595 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5719  hypothetical protein  28.99 
 
 
323 aa  53.9  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.623713  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2254  hypothetical protein  31 
 
 
606 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.706828  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4143  hypothetical protein  26.77 
 
 
594 aa  47  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0190  phage integrase family protein  21.47 
 
 
698 aa  47  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00182049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0804  hypothetical protein  23.5 
 
 
613 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.665979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>