18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7350 on replicon NC_010679
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010679  Bphyt_7350  Type IV secretory pathway component VirB8 protein-like protein  100 
 
 		 299 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.160326 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5081  VirB8 family protein  27.59 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0251  Type IV secretory pathway AvhB8 protein  32.09 
 
 		 223 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4341  VirB8  33.08 
 
 		 223 aa  57  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0342732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5819  VirB8 family protein  27.85 
 
 		 240 aa  57  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0682  VirB8 family protein  25.33 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765146  n/a   
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4372  VirB8 family protein  25.93 
 
 		 228 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.929771 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5004  VirB8 family protein  28.89 
 
 		 229 aa  50.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.04145  normal  0.518843 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6400  VirB8 family protein  23.18 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4440  VirB8  24.67 
 
 		 238 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1681  type IV secretory pathway, VirB8 component  21.8 
 
 		 215 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.944292  normal  0.516044 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9815  Type IV secretory pathway component VirB8  23.29 
 
 		 230 aa  47.4  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5023  VirB8 family protein  23.32 
 
 		 238 aa  47  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00032583  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08208  conjugal transfer protein TraG  28.99 
 
 		 251 aa  44.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a016  conjugal transfer protein TraJ/VirB8  23.29 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4173  VirB8  19.53 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.717202  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4558  VirB8 family protein  23.89 
 
 		 231 aa  43.9  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837968  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1482  VirB8 family protein  25 
 
 		 227 aa  42.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.96706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>