More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7203 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  100 
 
 		 386 aa  775    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  89.38 
 
 		 386 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  94.82 
 
 		 386 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  54.34 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  54.59 
 
 		 383 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  54.2 
 
 		 384 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  51.15 
 
 		 375 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  50.64 
 
 		 375 aa  368  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  50.38 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  51.87 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  50.38 
 
 		 375 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  52.41 
 
 		 381 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  51.28 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  51.9 
 
 		 381 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  50.76 
 
 		 381 aa  353  4e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  50.88 
 
 		 383 aa  349  5e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  50.63 
 
 		 383 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  51.27 
 
 		 381 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  50.13 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  50.13 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  50.13 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  50.13 
 
 		 379 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  49.87 
 
 		 379 aa  340  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  50.78 
 
 		 374 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  49.87 
 
 		 379 aa  335  7e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  51.02 
 
 		 380 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  50.25 
 
 		 379 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  50.77 
 
 		 380 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  46.73 
 
 		 471 aa  316  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  45.96 
 
 		 403 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  47.55 
 
 		 376 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  47.31 
 
 		 379 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  45.48 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  45.23 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  45.23 
 
 		 403 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  46.48 
 
 		 419 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  45.97 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  45.97 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  45.97 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  45.97 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  45.97 
 
 		 407 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  45.97 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  46.93 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  45.71 
 
 		 419 aa  300  4e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  44.14 
 
 		 391 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  44.14 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  44.14 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  45.29 
 
 		 383 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  45.57 
 
 		 384 aa  294  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  45.82 
 
 		 414 aa  293  2e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  46.19 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  46.19 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  43.56 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  46.19 
 
 		 384 aa  293  3e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3460  OmpC family outer membrane porin  45.81 
 
 		 383 aa  291  9e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.460184 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  45.95 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  45.95 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  45.71 
 
 		 384 aa  291  1e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  43.39 
 
 		 418 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  45.7 
 
 		 384 aa  290  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  43.77 
 
 		 383 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  44.85 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  45.2 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  45.2 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  45.2 
 
 		 384 aa  286  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  44.06 
 
 		 380 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  44.06 
 
 		 380 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  47.01 
 
 		 383 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  46.62 
 
 		 391 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  44.44 
 
 		 384 aa  278  8e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  44.97 
 
 		 377 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  43.58 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  43.73 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  45.48 
 
 		 377 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  45.72 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  44.19 
 
 		 384 aa  276  6e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  44.12 
 
 		 383 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  44.02 
 
 		 377 aa  275  7e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.67 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  43.07 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.56 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  44.77 
 
 		 385 aa  272  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  43.32 
 
 		 385 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  45.04 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  43.07 
 
 		 385 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  43.8 
 
 		 384 aa  269  5.9999999999999995e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  43.28 
 
 		 389 aa  269  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.08 
 
 		 380 aa  269  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.08 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  46.56 
 
 		 361 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  43.01 
 
 		 411 aa  265  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1254  OmpC family outer membrane porin  44.76 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.393041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  45.32 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  45.32 
 
 		 362 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>