More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7157 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7157  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 277 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0261  AraC family transcriptional regulator  95.29 
 
 		 281 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6275  AraC family transcriptional regulator  60.22 
 
 		 279 aa  340  1e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2797  transcription activator effector binding  53.76 
 
 		 279 aa  314  9.999999999999999e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338998 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2938  AraC family transcriptional regulator  55.8 
 
 		 279 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4077  transcription activator effector binding  76.27 
 
 		 178 aa  298  5e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4053  AraC family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 277 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3715  transcriptional regulator, AraC family  52.52 
 
 		 279 aa  294  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.424878 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3417  transcriptional regulator, AraC family  51.8 
 
 		 279 aa  289  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.27768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1952  AraC family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1271  transcriptional regulator, AraC family  31.85 
 
 		 300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 300 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1014  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.210728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1036  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139629  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1114  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  143  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1194  transcriptional regulator, AraC family  31.51 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.926126 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1013  AraC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 300 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 300 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4332  transcription activator, effector binding  39.13 
 
 		 164 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3983  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 291 aa  126  5e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  27.36 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 298 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4973  transcriptional regulator, AraC family  25.26 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4724  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440387  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5086  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4566  AraC family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4947  transcriptional regulator, AraC family  24.66 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003322  hypothetical protein  27.36 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.757084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  29.75 
 
 		 294 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4986  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 290 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4582  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.763033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 288 aa  99.8  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5265  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 281 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0011  transcriptional regulator, AraC family  27.3 
 
 		 285 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871788  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4672  AraC family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0009  helix-turn-helix domain-containing protein  27 
 
 		 306 aa  95.9  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000070115 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1784  AraC family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 280 aa  95.5  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000275244  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0205  transcriptional activator, AraC family  29.07 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000524418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2678  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 284 aa  94.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0424  transcriptional regulator, AraC family  26.26 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0278  transcriptional regulator, AraC family  23.97 
 
 		 290 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2107  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0990  AraC family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 281 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4957  transcriptional regulator, AraC family  23.63 
 
 		 290 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0223  transcriptional activator, AraC family  28.62 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000178737 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0529  transcriptional regulator, AraC family  29.95 
 
 		 288 aa  90.5  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1790  transcriptional regulator, AraC family  26.19 
 
 		 282 aa  89.7  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.191731  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  37.7 
 
 		 308 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3174  AraC family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 280 aa  89  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.626893  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0019  transcriptional regulator, AraC family  28.03 
 
 		 314 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3138  AraC family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 281 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0679  AraC family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 289 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0014238  normal  0.551474 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3867  transcriptional regulator, AraC family  32.87 
 
 		 295 aa  86.7  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000535009  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1224  AraC family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 288 aa  87  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0494811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 299 aa  87  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1472  AraC family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 294 aa  86.7  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.102681  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1127  transcriptional regulator, AraC family  26.95 
 
 		 288 aa  86.7  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3264  transcriptional regulator, AraC family  24.39 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  28.99 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3609  AraC family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3481  right origin-binding protein  26.57 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0814  right origin-binding protein  26.57 
 
 		 288 aa  84.3  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2251  transcriptional regulator, AraC family  24.83 
 
 		 287 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3161  AraC family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0910  HTH-type transcription regulator, AraC-family  24.23 
 
 		 298 aa  83.6  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.576456  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0568  transcriptional regulator, AraC family  25.38 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.117041  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2929  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0126  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 293 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.436666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3673  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0140  AraC family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 293 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.877598  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1922  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.890213  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4946  right origin-binding protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.96055 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3660  AraC family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04272  DNA-binding transcriptional activator  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3601  transcriptional regulator, AraC family  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4632  right origin-binding protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7295  AraC family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 277 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158014  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4943  right origin-binding protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5910  right origin-binding protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04237  hypothetical protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4994  right origin-binding protein  23.6 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4910  right origin-binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4944  right origin-binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3142  AraC family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4837  right origin-binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1523  AraC family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00364512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4996  right origin-binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4998  right origin-binding protein  23.97 
 
 		 289 aa  80.1  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0853  transcriptional regulator, AraC family  25.66 
 
 		 284 aa  79.3  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2759  AraC family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>