More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7083 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7083  cytochrome B561  100 
 
 		 199 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.280542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0201  putative cytochrome b-561 protein  96.98 
 
 		 222 aa  390  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0583  cytochrome B561  57.3 
 
 		 191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  45.7 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  45.41 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  45.41 
 
 		 186 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  46.15 
 
 		 186 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  42.27 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  45.6 
 
 		 186 aa  142  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  42.7 
 
 		 186 aa  140  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  42.7 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  41.62 
 
 		 186 aa  134  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  40.82 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  40.72 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  42.86 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  42.41 
 
 		 184 aa  126  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  41.36 
 
 		 184 aa  125  6e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  39 
 
 		 441 aa  124  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  40.62 
 
 		 190 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  39.38 
 
 		 203 aa  123  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2322  cytochrome B561  40.54 
 
 		 203 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  41.53 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3478  cytochrome B561  40.45 
 
 		 180 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.579466  hitchhiker  0.000371098 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  40.2 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2532  cytochrome B561  42.86 
 
 		 206 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  37.23 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2380  cytochrome b561, putative  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0295  putative cytochrome b561  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3336  cytochrome B561  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3370  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3379  cytochrome B561  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1157  putative cytochrome b561  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1271  cytochrome b561, putative  45.36 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2565  putative cytochrome b561  45.11 
 
 		 187 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1738  hypothetical protein  35.52 
 
 		 186 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0392514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.81 
 
 		 193 aa  111  9e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.11 
 
 		 197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  34.62 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.85 
 
 		 188 aa  105  4e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.56 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1538  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  34.81 
 
 		 182 aa  105  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1445  hypothetical protein  34.78 
 
 		 182 aa  104  8e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0295  cytochrome b561  38.78 
 
 		 416 aa  104  8e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0256942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  33.52 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  34.92 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  41.21 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  36.63 
 
 		 193 aa  101  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1020  cytochrome B561  32.42 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000282036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  39.38 
 
 		 190 aa  100  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  35.52 
 
 		 188 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  35.64 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0833  cytochrome B561  31.66 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.383328  hitchhiker  0.00227976 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  36.61 
 
 		 184 aa  97.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3506  putative cytochrome b-561 membrane protein  40.21 
 
 		 186 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.456908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  35.68 
 
 		 191 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0483  cytochrome B561  35.83 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  36.26 
 
 		 195 aa  96.7  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2073  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  35.38 
 
 		 213 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636056  normal  0.331643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4401  cytochrome B561  40.76 
 
 		 201 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.425577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  34.59 
 
 		 180 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01053  predicted cytochrome b561  37.23 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.580116  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2589  cytochrome B561  37.23 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2543  cytochrome B561  37.23 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.210551  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2271  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  37.23 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1180  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  37.23 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1436  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  37.23 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.887549  normal  0.160518 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01061  hypothetical protein  37.23 
 
 		 188 aa  95.5  4e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1179  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  37.23 
 
 		 188 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3202  cytochrome B561  37.89 
 
 		 197 aa  94.7  7e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.30143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4855  cytochrome B561  35.29 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.745808  normal  0.0891705 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  33.83 
 
 		 188 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4982  cytochrome B561  35.29 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5031  cytochrome B561  35.83 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.416621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  38.92 
 
 		 421 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1322  cytochrome B561  34.62 
 
 		 183 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00114864  normal  0.0249294 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3042  cytochrome B561  34.62 
 
 		 183 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000618987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2791  cytochrome B561  35.91 
 
 		 182 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  31.35 
 
 		 178 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.98 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.15 
 
 		 175 aa  92.4  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  33.15 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  33.15 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  34.55 
 
 		 176 aa  91.7  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3199  cytochrome B561  34.62 
 
 		 183 aa  91.7  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000519809  normal  0.560519 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1571  cytochrome B561  33.7 
 
 		 192 aa  91.3  8e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.896883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0967  cytochrome B561  34.62 
 
 		 181 aa  91.3  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2517  cytochrome B561  32.26 
 
 		 184 aa  90.9  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  33.7 
 
 		 175 aa  90.9  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1711  YceI  34.78 
 
 		 420 aa  90.9  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811721  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2303  cytochrome B561  33.16 
 
 		 187 aa  90.9  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469268  normal  0.0531302 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1225  YceJ  34.43 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.307715  normal  0.414708 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1554  cytochrome B561  33.51 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  37.21 
 
 		 190 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2703  cytochrome B561  34.07 
 
 		 183 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100012  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  32.6 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1617  hypothetical protein  35.71 
 
 		 176 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1178  cytochrome B561  32.79 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000103692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1177  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  90.5  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000321845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1248  cytochrome B561  33.33 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00191634  normal  0.790409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>