75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6951 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2230  hypothetical protein  47.89 
 
 
733 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.114642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6951  NHL repeat containing protein  100 
 
 
727 aa  1466    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0693  hypothetical protein  46.58 
 
 
727 aa  643    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.315793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4260  hypothetical protein  74.27 
 
 
729 aa  1141    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770161  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0755  hypothetical protein  46.6 
 
 
722 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.974049  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1072  hypothetical protein  47.61 
 
 
761 aa  635    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.437108 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2429  hypothetical protein  46.74 
 
 
775 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2290  hypothetical protein  46.6 
 
 
718 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3361  hypothetical protein  46 
 
 
738 aa  633  1e-180  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2113  hypothetical protein  45.73 
 
 
738 aa  632  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.204207 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3865  hypothetical protein  46.27 
 
 
730 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.647421  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3557  hypothetical protein  45.59 
 
 
738 aa  627  1e-178  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.744936  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1968  hypothetical protein  47.55 
 
 
733 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4395  hypothetical protein  45.45 
 
 
738 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3972  hypothetical protein  45.45 
 
 
738 aa  628  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4610  hypothetical protein  45.3 
 
 
738 aa  620  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0530626  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2520  hypothetical protein  45.15 
 
 
808 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.432249  normal  0.0659168 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0544  hypothetical protein  44.19 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1872  hypothetical protein  44.19 
 
 
669 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721544  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1664  hypothetical protein  44.19 
 
 
722 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.789674  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1707  hypothetical protein  44.19 
 
 
669 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.365611  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1140  hypothetical protein  38.11 
 
 
743 aa  467  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.782841  normal  0.0368416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3113  NHL repeat-containing protein  36.54 
 
 
708 aa  446  1.0000000000000001e-124  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3571  hypothetical protein  35.39 
 
 
663 aa  365  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.68126  decreased coverage  0.00704751 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6684  hypothetical protein  28.24 
 
 
660 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182376  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5136  hypothetical protein  27.54 
 
 
640 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4607  hypothetical protein  27.54 
 
 
640 aa  196  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0258623  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4607  hypothetical protein  27.89 
 
 
638 aa  192  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3464  hypothetical protein  27.4 
 
 
640 aa  190  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0905  hypothetical protein  28.18 
 
 
638 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4392  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  28.25 
 
 
644 aa  187  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3085  hypothetical protein  27.94 
 
 
644 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5786  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  27.83 
 
 
644 aa  184  6e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5074  hypothetical protein  28.11 
 
 
644 aa  183  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0407  hypothetical protein  27.55 
 
 
640 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5025  hypothetical protein  27.13 
 
 
641 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.932638  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3120  hypothetical protein  27.13 
 
 
641 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5247  hypothetical protein  27.13 
 
 
641 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6419  hypothetical protein  27.19 
 
 
644 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.612972  normal  0.777893 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0227  hypothetical protein  27.12 
 
 
711 aa  172  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0224  hypothetical protein  26.71 
 
 
713 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1677  hypothetical protein  26.95 
 
 
638 aa  172  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0314  hypothetical protein  26.81 
 
 
638 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2205  hypothetical protein  26.68 
 
 
630 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1229  hypothetical protein  26.68 
 
 
630 aa  171  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1927  hypothetical protein  26.68 
 
 
638 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0942  hypothetical protein  26.68 
 
 
638 aa  171  6e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2169  hypothetical protein  26.15 
 
 
638 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1895  hypothetical protein  26.15 
 
 
638 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1194  hypothetical protein  26.15 
 
 
638 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0906  hypothetical protein  26.15 
 
 
638 aa  171  7e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3206  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.88 
 
 
644 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5062  hypothetical protein  26.88 
 
 
644 aa  168  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828402  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0350  hypothetical protein  25.59 
 
 
638 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0258  hypothetical protein  25.59 
 
 
638 aa  165  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1575  hypothetical protein  26.01 
 
 
650 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.637524  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0087  hypothetical protein  25.87 
 
 
647 aa  164  8.000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0076  hypothetical protein  25.87 
 
 
650 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0837767  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1516  hypothetical protein  25.87 
 
 
641 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1235  hypothetical protein  25.87 
 
 
641 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0091  hypothetical protein  25.87 
 
 
641 aa  162  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1708  hypothetical protein  25.45 
 
 
638 aa  161  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4648  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.02 
 
 
643 aa  154  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.652579 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0111  hypothetical protein  27.96 
 
 
523 aa  151  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.906593  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0077  hypothetical protein  25.97 
 
 
645 aa  148  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.104126  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6571  Ig family protein  26.94 
 
 
1342 aa  64.3  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00409169  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6292  PA14 domain protein  22.04 
 
 
1314 aa  55.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.237878 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6290  Ricin B lectin  25.32 
 
 
1259 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0798248 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4621  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  26.22 
 
 
318 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70566  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  27.47 
 
 
1293 aa  47.8  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0972  hypothetical protein  52.17 
 
 
88 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45329  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  33.92 
 
 
391 aa  46.2  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4139  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  26.22 
 
 
314 aa  44.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526711  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  29.38 
 
 
579 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4507  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  27.44 
 
 
314 aa  44.3  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.70615 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>