55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6933 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6933  formaldehyde-activating enzyme  100 
 
 		 190 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2825  hypothetical protein  91.91 
 
 		 174 aa  329  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2468  formaldehyde-activating protein  62.42 
 
 		 167 aa  217  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1651  formaldehyde-activating enzyme  60 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1542  hypothetical protein  60 
 
 		 167 aa  201  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1721  hypothetical protein  60 
 
 		 167 aa  200  9e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.054067  hitchhiker  0.00446803 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1994  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.09 
 
 		 396 aa  121  5e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2060  formaldehyde-activating enzyme  37.11 
 
 		 178 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.189028  normal  0.41416 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1036  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.62 
 
 		 393 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1285  formaldehyde-activating enzyme  35 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0367  formaldehyde-activating enzyme  35.85 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.203725  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0988  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38 
 
 		 392 aa  104  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0772  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  34.97 
 
 		 393 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.58783 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0996  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  33.33 
 
 		 403 aa  100  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.566431 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1085  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  37.06 
 
 		 393 aa  98.2  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.136979  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0935  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  36.49 
 
 		 392 aa  97.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0033619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2436  formaldehyde-activating protein  34.16 
 
 		 169 aa  97.8  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.397979 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1628  bifunctional formaldehyde-activating enzyme/3-hexulose-6-phosphate synthase  38.46 
 
 		 393 aa  94  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3147  formaldehyde-activating enzyme  35.98 
 
 		 169 aa  93.2  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2390  formaldehyde-activating enzyme  32.3 
 
 		 175 aa  92  5e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3079  formaldehyde-activating enzyme  33.95 
 
 		 170 aa  90.9  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2612  formaldehyde-activating enzyme  29.81 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0416881  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2866  formaldehyde-activating enzyme  31.06 
 
 		 170 aa  89  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0975  formaldehyde-activating enzyme  33.96 
 
 		 167 aa  88.6  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0927434  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6487  formaldehyde-activating enzyme  29.19 
 
 		 169 aa  87  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.302319 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0032  formaldehyde-activating protein  30.43 
 
 		 169 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.848098 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6007  formaldehyde-activating enzyme  28.48 
 
 		 171 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.100814  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5783  formaldehyde-activating enzyme  28.48 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0971644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0533  formaldehyde-activating enzyme  29.75 
 
 		 170 aa  84.7  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1834  formaldehyde-activating enzyme  29.75 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2169  formaldehyde-activating enzyme  29.75 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.783809  normal  0.178175 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1785  formaldehyde-activating enzyme  30.38 
 
 		 170 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1365  formaldehyde-activating protein  28.57 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.745489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2364  putative formaldehyde-activating enzyme  29.73 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000204771  normal  0.719365 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1652  formaldehyde-activating enzyme  28.82 
 
 		 178 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000163018  normal  0.176505 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3519  formaldehyde-activating enzyme  29.68 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2543  formaldehyde-activating enzyme  29.82 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.234356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2524  putative formaldehyde-activating enzyme  28.4 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2016  formaldehyde-activating enzyme  30.14 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.560353  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1627  formaldehyde-activating protein  30.14 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4915  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.090523  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1799  formaldehyde-activating enzyme  32.37 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3063  formaldehyde-activating enzyme  31.88 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3132  formaldehyde-activating enzyme  31.65 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1725  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.393787  normal  0.0143668 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3465  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.5 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.719607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1450  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.485811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4369  formaldehyde-activating enzyme  29.45 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.279882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3143  formaldehyde-activating protein  25.5 
 
 		 182 aa  67.8  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.389753  normal  0.873661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3403  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  26.17 
 
 		 182 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3340  Formaldehyde-activating enzyme (Fae)  25.5 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1445  formaldehyde-activating enzyme  28.77 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.318243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4467  formaldehyde-activating protein  24.83 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.164696 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2627  putative formaldehyde-activating enzyme  30.43 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.212894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5474  formaldehyde-activating enzyme  31.1 
 
 		 177 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0338658  normal  0.0655052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>