More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6876 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  81.44 
 
 
638 aa  1030  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  66.93 
 
 
563 aa  830  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  100 
 
 
634 aa  1288  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  50.97 
 
 
589 aa  592  1e-168  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  50.41 
 
 
572 aa  590  1e-167  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  49.29 
 
 
594 aa  571  1e-161  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  66.27 
 
 
569 aa  571  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2309  FHA domain containing protein  63.46 
 
 
568 aa  540  1e-152  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  47.02 
 
 
639 aa  528  1e-148  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  58.49 
 
 
474 aa  505  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  56.49 
 
 
463 aa  465  1e-130  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  55.9 
 
 
444 aa  463  1e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  54.37 
 
 
463 aa  465  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  56.07 
 
 
465 aa  465  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  55.67 
 
 
677 aa  450  1e-125  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  56.51 
 
 
467 aa  450  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  59.72 
 
 
441 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  65.01 
 
 
457 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  58.6 
 
 
468 aa  439  1e-122  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  59.18 
 
 
513 aa  433  1e-120  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  59.37 
 
 
624 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  50 
 
 
442 aa  430  1e-119  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1206  type II secretion system protein E  53.24 
 
 
742 aa  432  1e-119  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00140506  hitchhiker  1.53533e-12 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  57.58 
 
 
487 aa  431  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  52.76 
 
 
491 aa  429  1e-119  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  54.15 
 
 
465 aa  429  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  52.8 
 
 
442 aa  432  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  52.57 
 
 
472 aa  430  1e-119  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  52.08 
 
 
491 aa  427  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  58.5 
 
 
477 aa  428  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  52.03 
 
 
498 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  57.93 
 
 
478 aa  425  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  53.76 
 
 
471 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  50.12 
 
 
455 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
455 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  48.73 
 
 
455 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
454 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  49.4 
 
 
464 aa  417  1e-115  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
454 aa  416  1e-115  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
454 aa  417  1e-115  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  49.63 
 
 
455 aa  418  1e-115  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
462 aa  416  1e-115  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  55 
 
 
452 aa  417  1e-115  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  49.88 
 
 
455 aa  416  1e-115  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.03 
 
 
459 aa  418  1e-115  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.67 
 
 
451 aa  417  1e-115  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  49.88 
 
 
455 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  49.88 
 
 
455 aa  415  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  54.09 
 
 
470 aa  413  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  49.39 
 
 
454 aa  415  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  57.14 
 
 
560 aa  414  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  53.75 
 
 
452 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  50.12 
 
 
460 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  50.37 
 
 
457 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  52.63 
 
 
450 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  55.39 
 
 
495 aa  412  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  46.71 
 
 
463 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  49.02 
 
 
456 aa  407  1e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  48.88 
 
 
476 aa  408  1e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  48.11 
 
 
454 aa  409  1e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  55.33 
 
 
468 aa  403  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  48.56 
 
 
469 aa  400  1e-110  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  47.93 
 
 
453 aa  400  1e-110  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  57.75 
 
 
608 aa  402  1e-110  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  50.24 
 
 
472 aa  398  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  46.03 
 
 
479 aa  395  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  44.78 
 
 
467 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  49.49 
 
 
484 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002649  type II/IV secretion system ATP hydrolase TadA/VirB11/CpaF TadA subfamily  49.05 
 
 
458 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  50.88 
 
 
449 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
508 aa  394  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  57.94 
 
 
471 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  49.87 
 
 
483 aa  394  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  48.99 
 
 
467 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  48.48 
 
 
482 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  50.61 
 
 
437 aa  393  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  48.99 
 
 
490 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  48.99 
 
 
433 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  57.94 
 
 
471 aa  394  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  56.01 
 
 
523 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  56.01 
 
 
520 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  56.01 
 
 
521 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  56.01 
 
 
520 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  56.01 
 
 
520 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  46.81 
 
 
482 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  48.23 
 
 
480 aa  390  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  54.47 
 
 
485 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  50 
 
 
437 aa  392  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  48.74 
 
 
488 aa  390  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  56.01 
 
 
523 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  49.13 
 
 
477 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  46.56 
 
 
482 aa  391  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  53.82 
 
 
452 aa  392  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  48.74 
 
 
489 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1815  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
449 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.15146  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  53.51 
 
 
455 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  49.13 
 
 
437 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  49.14 
 
 
445 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  48.74 
 
 
485 aa  387  1e-106  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  56.18 
 
 
474 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>