88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6606 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6606  hypothetical protein  100 
 
 
638 aa  1258    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213555  normal  0.251214 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2587  hypothetical protein  85.13 
 
 
638 aa  1029    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.121215 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5662  hypothetical protein  46.41 
 
 
671 aa  399  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.946498 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4642  membrane protein-like protein  46.22 
 
 
671 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3726  membrane protein-like  46.22 
 
 
671 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2162  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.6 
 
 
679 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0547772  normal  0.0766716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1951  conserved hypothetical conserved membrane protein  33.33 
 
 
677 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126596  normal  0.313547 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1518  hypothetical protein  26.85 
 
 
666 aa  118  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4189  hypothetical protein  30.72 
 
 
487 aa  69.3  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.154141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1472  integral membrane protein, YccS/YhfK family protein  30.77 
 
 
733 aa  61.6  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.872698 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.23 
 
 
702 aa  58.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4720  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.4 
 
 
746 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0171257  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.7 
 
 
704 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  30.11 
 
 
670 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0154  hypothetical protein  24.53 
 
 
374 aa  54.7  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0657  hypothetical protein  24.57 
 
 
725 aa  54.3  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0141  hypothetical protein  24.06 
 
 
372 aa  52  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4934  fusaric acid resistance protein region  28.85 
 
 
687 aa  52.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2853  hypothetical protein  28.22 
 
 
758 aa  51.6  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229586  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0141  hypothetical protein  24.06 
 
 
372 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0146  hypothetical protein  24.06 
 
 
372 aa  52  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0683  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1383  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1387  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0469  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.646757  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1187  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.775183  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1772  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0697846  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1518  hypothetical protein  29.08 
 
 
758 aa  50.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2531  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  20.65 
 
 
740 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1213  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.79 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139359  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0733  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  29.79 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525617  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1186  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  29.79 
 
 
764 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.310514  normal  0.518709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.74 
 
 
679 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4321  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  27.78 
 
 
763 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2090  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.78 
 
 
763 aa  48.9  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338513  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1096  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  28.37 
 
 
763 aa  48.5  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0524683  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1096  protein of unknown function DUF893, YccS/YhfK  28.37 
 
 
763 aa  48.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  28.8 
 
 
653 aa  48.5  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0144  hypothetical protein  23.11 
 
 
371 aa  48.1  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000321  membrane protein  21.14 
 
 
717 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  38.64 
 
 
700 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0595  fusaric acid resistance protein region  27.94 
 
 
633 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0534  fusaric acid resistance domain-containing protein  27.94 
 
 
633 aa  47.8  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0146  hypothetical protein  24.07 
 
 
389 aa  47.8  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4212  hypothetical protein  24.07 
 
 
389 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1796  fusaric acid resistance protein region  28.71 
 
 
625 aa  47.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00451003  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4389  hypothetical protein  29.76 
 
 
361 aa  47.4  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0147  hypothetical protein  24.07 
 
 
380 aa  47.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.311964 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2032  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1057  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47.4  0.0008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  33.13 
 
 
688 aa  47.4  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0143  hypothetical protein  24.07 
 
 
388 aa  47.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3662  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.76 
 
 
655 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.250155  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0764  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.567063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0100  membrane protein-like protein  34.03 
 
 
715 aa  47.4  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.514267 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  30 
 
 
680 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  38.64 
 
 
700 aa  47  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4048  hypothetical protein  29.92 
 
 
358 aa  47.4  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2060  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1773  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1227  hypothetical protein  24.37 
 
 
534 aa  46.6  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0684  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0775  hypothetical protein  25.63 
 
 
357 aa  47  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.65486  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1750  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.47 
 
 
806 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0916755  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4696  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  31.32 
 
 
745 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.427482 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06123  hypothetical protein  26.03 
 
 
717 aa  46.2  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2840  AraE family aromatic acid exporter  26.95 
 
 
883 aa  46.2  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33409  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2406  fusaric acid resistance protein region  31.72 
 
 
690 aa  46.2  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.700972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.7 
 
 
697 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3627  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.76 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.35242  normal  0.2133 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  31.29 
 
 
679 aa  45.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3556  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.76 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.374606  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3555  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.76 
 
 
655 aa  45.4  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3724  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.76 
 
 
655 aa  45.8  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.269228 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4083  fusaric acid resistance protein region  26.54 
 
 
682 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2166  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  21.28 
 
 
719 aa  45.1  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0513514  normal  0.798484 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1612  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  27.66 
 
 
851 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.719802  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  38.1 
 
 
718 aa  44.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2703  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  25.22 
 
 
708 aa  44.3  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000297127  normal  0.375768 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1670  protein of unknown function DUF893 YccS/YhfK  24.31 
 
 
730 aa  44.3  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1913  hypothetical protein  28.57 
 
 
357 aa  44.7  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0201  fusaric acid resistance protein region  36.78 
 
 
695 aa  44.3  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3429  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.88 
 
 
655 aa  43.9  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3170  fusaric acid resistance protein region  29.68 
 
 
716 aa  44.3  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.841968 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5820  membrane protein-like protein  27.65 
 
 
659 aa  43.9  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202056  normal  0.271534 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  27.48 
 
 
681 aa  43.9  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0197  fusaric acid resistance protein region  36.78 
 
 
695 aa  43.9  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0487942  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4557  p-hydroxybenzoic acid efflux subunit AaeB  24.88 
 
 
655 aa  43.9  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>