84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6476 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_60070  hypothetical protein  47.5 
 
 		 807 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000312719  hitchhiker  0.0000000420342 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0294  ATP-dependent endonuclease, OLD family  49.67 
 
 		 773 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0724498 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6476  ATP-dependent endonuclease, OLD family  100 
 
 		 762 aa  1548    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3655  ATP-dependent OLD family endonuclease  42.59 
 
 		 793 aa  657    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.523201  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4219  ATP-dependent endonuclease, OLD family  44.75 
 
 		 780 aa  650    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1800  ATP-dependent endonuclease  65.42 
 
 		 782 aa  964    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.163523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3887  hypothetical protein  59.96 
 
 		 546 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.333396  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5469  hypothetical protein  32.22 
 
 		 763 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2720  hypothetical protein  32.42 
 
 		 784 aa  332  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2417  hypothetical protein  29.15 
 
 		 748 aa  322  9.999999999999999e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.295746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1439  hypothetical protein  30.88 
 
 		 744 aa  317  4e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0880018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4970  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.51 
 
 		 677 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00358529 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2791  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.51 
 
 		 677 aa  293  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0639956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6911  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.73 
 
 		 669 aa  263  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0857845  hitchhiker  0.000559752 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2848  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.59 
 
 		 674 aa  258  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351188  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0206  ATP-dependent OLD family endonuclease  30.49 
 
 		 689 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4907  hypothetical protein  28.31 
 
 		 769 aa  250  8e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.50635  normal  0.10457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3807  hypothetical protein  30.53 
 
 		 691 aa  241  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0465768  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3277  hypothetical protein  24.97 
 
 		 728 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0296184  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0001  hypothetical protein  25.42 
 
 		 707 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.426286  unclonable  0.0000000168459 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003289  pathogenesis related protein  24.63 
 
 		 714 aa  182  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.31747  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0681  overcoming lysogenization defect protein  24.34 
 
 		 696 aa  164  5.0000000000000005e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0597  hypothetical protein  23.42 
 
 		 773 aa  126  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3543  SMC protein-like  31.25 
 
 		 695 aa  88.6  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5488  putative nucleoside triphosphate hydrolase domain-containing protein  31.88 
 
 		 598 aa  83.6  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3408  hypothetical protein  29.05 
 
 		 594 aa  83.2  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.043782  normal  0.188523 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1644  hypothetical protein  30.29 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.595797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0038  hypothetical protein  31.65 
 
 		 594 aa  80.1  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.19507  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3144  SMC (structural maintenance of chromosomes) family protein  28.7 
 
 		 682 aa  77  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872592  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1874  hypothetical protein  20.85 
 
 		 703 aa  75.5  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.75491  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2666  hypothetical protein  32.09 
 
 		 553 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0766  SMC domain protein  31.4 
 
 		 623 aa  74.7  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.000557605  normal  0.0228262 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0676  hypothetical protein  28.38 
 
 		 712 aa  73.9  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54535 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2561  ATP-dependent endonuclease  26.72 
 
 		 613 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0763392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0996  ATP-dependent OLD family endonuclease  31.19 
 
 		 637 aa  72  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2572  hypothetical protein  28.88 
 
 		 650 aa  68.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00339016  normal  0.0605496 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3272  OLD family-like ATP-dependent endonuclease  34.76 
 
 		 758 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.7 
 
 		 615 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0046  hypothetical protein  27.13 
 
 		 661 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.489022  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06203  hypothetical protein  25.43 
 
 		 669 aa  62  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2954  putative exonuclease  24.86 
 
 		 659 aa  61.2  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3955  AAA ATPase  28.26 
 
 		 642 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.262295  hitchhiker  0.00100841 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0546  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.6 
 
 		 708 aa  58.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1621  hypothetical protein  29.56 
 
 		 596 aa  57.4  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3193  plasmid-related protein  24.53 
 
 		 674 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0945381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1866  ATP-dependent OLD family endonuclease  27.46 
 
 		 595 aa  56.6  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2559  hypothetical protein  26.61 
 
 		 645 aa  55.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.251758 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1883  SMC protein-like protein  26.01 
 
 		 688 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2290  ATP-dependent OLD family endonuclease  39.05 
 
 		 669 aa  55.1  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0949  hypothetical protein  22.11 
 
 		 603 aa  54.7  0.000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3525  ATP-dependent exoDNAse beta subunit  25.71 
 
 		 657 aa  54.3  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.297188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1604  hypothetical protein  27.75 
 
 		 685 aa  54.3  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3363  hypothetical protein  23.88 
 
 		 607 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.194578  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4418  ATP-dependent OLD family endonuclease  25 
 
 		 639 aa  52  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0753  ATP-dependent OLD family endonuclease  28.11 
 
 		 594 aa  50.4  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.362493  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1049  AAA ATPase  26.35 
 
 		 537 aa  49.7  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0801  SMC domain protein  41.67 
 
 		 564 aa  49.7  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.779455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2627  hypothetical protein  54.35 
 
 		 347 aa  48.9  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3711  SMC domain protein  23.47 
 
 		 653 aa  48.9  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3175  SMC domain protein  24.42 
 
 		 634 aa  48.5  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0609812  unclonable  0.0000000000000447606 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0137  hypothetical protein  20.67 
 
 		 666 aa  48.5  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  28.4 
 
 		 565 aa  48.5  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3828  hypothetical protein  42.62 
 
 		 604 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.220846  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0640  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.24 
 
 		 601 aa  48.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1960  hypothetical protein  23.7 
 
 		 522 aa  48.1  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0883  hypothetical protein  36.73 
 
 		 79 aa  47  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.473054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0777  ATPase-like protein  37.88 
 
 		 381 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1984  hypothetical protein  27.78 
 
 		 566 aa  47.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.370866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3757  hypothetical protein  28.09 
 
 		 532 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3013  hypothetical protein  24.14 
 
 		 520 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.364148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0196  ATPase  24.86 
 
 		 666 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  34.45 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  34.45 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  34.45 
 
 		 390 aa  46.6  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1302  ATP-dependent OLD family endonuclease  19.91 
 
 		 634 aa  45.8  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0003  DNA replication and repair protein RecF  45.1 
 
 		 377 aa  45.4  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1844  ATP-dependent OLD family endonuclease  26.37 
 
 		 640 aa  45.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1107  AAA ATPase  54.55 
 
 		 571 aa  45.4  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0989005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4449  ATP-dependent endonuclease of the OLD family-like protein  26.9 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2727  ATP-dependent OLD family endonuclease  25.9 
 
 		 607 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1703  hypothetical protein  44.23 
 
 		 457 aa  44.7  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0867999  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4760  SMC domain-containing protein  27.17 
 
 		 533 aa  44.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  32.74 
 
 		 392 aa  44.3  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1497  ATP-dependent OLD family endonuclease  37.74 
 
 		 573 aa  44.3  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>