More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6459 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6459  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 377 aa  780    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0253922  hitchhiker  0.000000313702 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5897  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  51.84 
 
 		 382 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.335458  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5118  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  50.53 
 
 		 382 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.808237  normal  0.197598 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4533  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  32.3 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00790465  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4435  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.25 
 
 		 377 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0118641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0897  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  31.63 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.129101  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3433  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.81 
 
 		 381 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4981  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.13 
 
 		 389 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.713473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3855  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.71 
 
 		 370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552694  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5866  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.03 
 
 		 389 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0167811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4061  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.78 
 
 		 375 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.92 
 
 		 388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0864  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.85 
 
 		 373 aa  159  7e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3195  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  31.71 
 
 		 390 aa  155  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3858  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.58 
 
 		 373 aa  155  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0581351  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0009  galactonate dehydratase  30.79 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3671  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.89 
 
 		 388 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2518  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.02 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0286824  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4861  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.16 
 
 		 388 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.580739 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2811  galactonate dehydratase  32.13 
 
 		 382 aa  152  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.275596  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5055  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.23 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.902489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5805  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.23 
 
 		 390 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.598482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3767  galactonate dehydratase  31.11 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.799766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2648  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  34.08 
 
 		 383 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278082  normal  0.0916898 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36070  hypothetical protein  31.52 
 
 		 391 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000846029 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5519  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.96 
 
 		 381 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.152569  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  32.22 
 
 		 382 aa  149  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4161  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4219  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4112  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  149  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.205397  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03575  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.923731  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03519  hypothetical protein  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.84784  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0011  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2580  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.89 
 
 		 369 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4201  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4057  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3074  hypothetical protein  30.66 
 
 		 391 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3395  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.13 
 
 		 369 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.79 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000249838  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4374  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.65 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3904  galactonate dehydratase  30.53 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2179  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.31 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0507727  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0313  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.25 
 
 		 371 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0951  galactonate dehydratase  31.27 
 
 		 382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  30.59 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1095  galactonate dehydratase  30.26 
 
 		 382 aa  146  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3211  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.65 
 
 		 390 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5071  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 		 390 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3056  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.36 
 
 		 390 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1989  galactonate dehydratase  30.97 
 
 		 401 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.217877  normal  0.0214185 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3479  galactonate dehydratase  29.82 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.412363  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3550  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  29.52 
 
 		 376 aa  145  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0951632  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3303  galactonate dehydratase  29.97 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4982  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.14 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.601828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  29.49 
 
 		 382 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0028  putative mandelate racemase/muconate lactonizing family protein  29.5 
 
 		 362 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.370595  normal  0.102793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1011  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.28 
 
 		 415 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  0.302413 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  29.83 
 
 		 382 aa  144  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0821  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  29.47 
 
 		 405 aa  144  3e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1308  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  27.08 
 
 		 384 aa  144  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.577493  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1946  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  30.99 
 
 		 378 aa  144  4e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4123  galactonate dehydratase  30.05 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0234002  normal  0.927238 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0656  galactonate dehydratase  30.11 
 
 		 382 aa  143  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.789075 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3874  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.67 
 
 		 401 aa  143  5e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0228827  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2591  galactonate dehydratase  30.17 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  30.03 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2719  galactonate dehydratase  30.17 
 
 		 382 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5994  galactonate dehydratase  30.17 
 
 		 382 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126789 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2615  galactonate dehydratase  31.84 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  29.89 
 
 		 382 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  29.89 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5451  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.09 
 
 		 403 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.911825  normal  0.0412246 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5329  galactonate dehydratase  32.59 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  29.89 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  30.36 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2836  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  27.79 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.182529  normal  0.329907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.11 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00121  galactonate dehydratase  32.29 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.220191  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3772  galactonate dehydratase  30.75 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.451307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4975  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.13 
 
 		 370 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0890752 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0254  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114802  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2464  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2694  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2383  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0218  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.93 
 
 		 381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0106637  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0740  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0239  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.08 
 
 		 372 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3962  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  26.97 
 
 		 370 aa  139  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0752  galactonate dehydratase  29.86 
 
 		 382 aa  139  6e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  29.72 
 
 		 382 aa  139  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0232  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme family protein  30.08 
 
 		 372 aa  139  7e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4358  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.17 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370383  normal  0.442664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6193  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  26.95 
 
 		 425 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.281448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4441  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.95 
 
 		 391 aa  139  8.999999999999999e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0607658  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6746  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  28.98 
 
 		 368 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0918  galactonate dehydratase  30.09 
 
 		 382 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.462959  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5182  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.81 
 
 		 403 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.028896  normal  0.168371 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0611  galactonate dehydratase  29.58 
 
 		 502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2476  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  29.13 
 
 		 378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>