More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6436 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6436  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 534 aa  1105    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000466111 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2483  FAD linked oxidase-like  80.08 
 
 		 502 aa  839    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.146767  normal  0.0195086 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5107  FAD linked oxidase-like  79.78 
 
 		 534 aa  891    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.477653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1270  FAD linked oxidase-like  50.56 
 
 		 532 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544288 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3848  FAD linked oxidase-like  49.81 
 
 		 532 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.16086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1454  FAD linked oxidase domain protein  50 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3350  FAD linked oxidase domain-containing protein  49.63 
 
 		 536 aa  472  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0117199 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1045  FAD linked oxidase domain protein  48.79 
 
 		 546 aa  474  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0325485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3120  FAD linked oxidase domain-containing protein  50 
 
 		 535 aa  473  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0913078  normal  0.485742 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13124  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase agpS  47.83 
 
 		 527 aa  458  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.209068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12280  flavoprotein  34.24 
 
 		 529 aa  278  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00816767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3761  alkylglycerone-phosphate synthase  32.8 
 
 		 527 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2238  alkylglycerone-phosphate synthase  33.94 
 
 		 532 aa  270  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.185547 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2176  oxidase, FAD-binding  29.96 
 
 		 563 aa  262  1e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000623586  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1958  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.02 
 
 		 531 aa  262  1e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.778758  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3385  alkylglycerone-phosphate synthase  35.22 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3374  alkylglycerone-phosphate synthase  35.22 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3436  alkylglycerone-phosphate synthase  35.22 
 
 		 525 aa  259  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0692131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3149  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 552 aa  253  6e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0907968  normal  0.068579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2772  alkylglycerone-phosphate synthase  33.6 
 
 		 527 aa  252  1e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1001  FAD linked oxidase domain protein  31.38 
 
 		 554 aa  252  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1798  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.62 
 
 		 528 aa  250  5e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00290405  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2774  alkylglycerone-phosphate synthase  35.5 
 
 		 521 aa  246  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.757745  hitchhiker  0.000882641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6682  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.83 
 
 		 521 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0557877  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5413  Alkylglycerone-phosphate synthase  35.94 
 
 		 550 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1669  alkylglycerone-phosphate synthase  31.45 
 
 		 556 aa  241  2.9999999999999997e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.216533  normal  0.884657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0358  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.62 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000693187  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4399  Alkylglycerone-phosphate synthase  32.44 
 
 		 540 aa  237  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5599  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.25 
 
 		 572 aa  235  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0254483  hitchhiker  0.00797673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4590  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 518 aa  234  3e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0387906  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0302  Alkylglycerone-phosphate synthase  33.6 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0179371  normal  0.709623 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0943  FAD linked oxidase-like  31.69 
 
 		 545 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0368093  normal  0.140312 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2658  FAD linked oxidase-like  30.12 
 
 		 584 aa  227  4e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128646  normal  0.201188 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4359  alkylglycerone-phosphate synthase  29.34 
 
 		 559 aa  221  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0138  alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, putative  31.49 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.568715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2132  hypothetical protein  32.02 
 
 		 531 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1346  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.04 
 
 		 534 aa  214  1.9999999999999998e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.825647  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27110  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  29.07 
 
 		 568 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1558  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.71 
 
 		 531 aa  209  7e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0927889 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0594  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.67 
 
 		 565 aa  208  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.227015 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24940  hypothetical protein  31.08 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2577  alkylglycerone-phosphate synthase  32.94 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.105062 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0015  FAD linked oxidase-like  28.17 
 
 		 583 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.344556 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19490  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  28.06 
 
 		 557 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3390  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.34 
 
 		 579 aa  187  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33270  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.51 
 
 		 534 aa  186  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.495555  normal  0.797078 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2332  FAD linked oxidase-like  28.11 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16388  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2454  Alkylglycerone-phosphate synthase  30.94 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000169679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2462  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.44 
 
 		 516 aa  169  8e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.806747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4360  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.03 
 
 		 520 aa  169  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2614  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 564 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.010282  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1372  alkylglycerone-phosphate synthase  28.63 
 
 		 465 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.782717  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8219  FAD linked oxidase domain protein  29.05 
 
 		 470 aa  166  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1119  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.98 
 
 		 516 aa  165  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4576  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.02 
 
 		 523 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.539848  normal  0.906341 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5443  putative alkylglycerone-phosphate synthase  28.06 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2080  FAD linked oxidase-like  27.31 
 
 		 520 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270192  normal  0.562813 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44190  predicted protein  27.11 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.694416  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1036  FAD linked oxidase-like  26.81 
 
 		 513 aa  148  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1876  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.51 
 
 		 510 aa  139  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.606958  normal  0.0560108 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5949  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.3 
 
 		 472 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00822967 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1347  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.78 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1226  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.78 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0612986  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0517  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.77 
 
 		 460 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0493306  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1018  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.26 
 
 		 470 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1615  glycolate oxidase, subunit GlcD  25.9 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1937  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  28.07 
 
 		 484 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00614579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1422  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.38 
 
 		 470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.524008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4018  FAD linked oxidase domain protein  28.41 
 
 		 475 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566577  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1210  glycolate oxidase subunit GlcD  23.84 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1309  glycolate oxidase subunit GlcD  23.84 
 
 		 470 aa  126  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1735  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  25.9 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.975111  normal  0.083174 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1592  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.95 
 
 		 459 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1188  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  23.84 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1386  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.84 
 
 		 470 aa  124  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1787  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.43 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0816  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  25.71 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.513401  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3515  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  26.07 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2924  FAD linked oxidase-like protein  26.35 
 
 		 495 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.469068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1873  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.43 
 
 		 497 aa  124  6e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1462  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.2 
 
 		 457 aa  123  9e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0224  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.31 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00834249  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1410  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.42 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1190  (S)-2-hydroxy-acid oxidase, subunit D  23.42 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0337  D-lactate dehydrogenase (acceptor: cytochrome)  27.31 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2439  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.25 
 
 		 464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.268315 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1377  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.31 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281382  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3364  FAD linked oxidase-like  27.91 
 
 		 475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.025129 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0651  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.89 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0625  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.43 
 
 		 469 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0419  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.31 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3996  glycolate oxidase, subunit GlcD  24.05 
 
 		 470 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.52944 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1212  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.42 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.225801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3530  glycolate oxidase, subunit GlcD, putative  25.68 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.692393  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3230  glycolate oxidase, subunit D  25.95 
 
 		 463 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64791  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0959  putative glycolate oxidase, subunit GlcD  27.31 
 
 		 477 aa  121  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1450  glycolate oxidase, subunit GlcD  23.21 
 
 		 470 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2026  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  27.59 
 
 		 475 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0174906  normal  0.155014 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1361  D-lactate dehydrogenase  27.94 
 
 		 468 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0953  FAD linked oxidase-like protein  24.06 
 
 		 474 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>