213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6382 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6382  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 596 aa  1221    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1405  glycoside hydrolase 15-related  52.13 
 
 		 623 aa  590  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.059685 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3676  glycoside hydrolase 15-related  52.12 
 
 		 600 aa  587  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1340  glycoside hydrolase 15-related  51.64 
 
 		 623 aa  585  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5665  glycoside hydrolase 15-like protein  51.69 
 
 		 609 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0954  glycoside hydrolase 15-related  51.36 
 
 		 609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2242  glycoside hydrolase 15-related  51.86 
 
 		 609 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2346  glycoside hydrolase 15-related  51.36 
 
 		 609 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171606  normal  0.0180735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1458  hypothetical protein  51.29 
 
 		 619 aa  581  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.412179 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1442  glycoside hydrolase 15-related  50.5 
 
 		 600 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.833593  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2362  glycoside hydrolase 15-related  51.53 
 
 		 611 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.897643  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2323  glycoside hydrolase 15-related  51.36 
 
 		 609 aa  578  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2418  glycoside hydrolase 15-related  50.67 
 
 		 602 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1711  glycoside hydrolase 15-related  51.19 
 
 		 609 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.45918  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1239  glycoside hydrolase 15-related  50.42 
 
 		 626 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2505  glycoside hydrolase 15-related  50.5 
 
 		 602 aa  575  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.368575  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2309  glycoside hydrolase 15-related  50.68 
 
 		 617 aa  572  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.557542 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3275  glycoside hydrolase 15-related  49.25 
 
 		 597 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4161  glycoside hydrolase 15-related  49.92 
 
 		 602 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0712093  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3307  hypothetical protein  50.08 
 
 		 626 aa  568  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2133  glycoside hydrolase 15-related protein  49.66 
 
 		 602 aa  568  1e-161  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136877  normal  0.379666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1886  glycoside hydrolase 15-like protein  49.42 
 
 		 601 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.177282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4035  glycoside hydrolase 15-related  51.43 
 
 		 611 aa  567  1e-160  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0183  glycoside hydrolase 15-related protein  50.68 
 
 		 605 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3739  glycoside hydrolase 15-related  50.33 
 
 		 613 aa  560  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.788382  normal  0.163243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6320  glycoside hydrolase family protein 15  51.1 
 
 		 603 aa  561  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.684293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1345  hypothetical protein  50.17 
 
 		 598 aa  558  1e-157  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2646  glycoside hydrolase 15-related protein  47.82 
 
 		 629 aa  555  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3480  glycoside hydrolase 15-related  49.26 
 
 		 601 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.340753 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1143  glycoside hydrolase 15-related  49.41 
 
 		 627 aa  556  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0212491 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1927  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.16927  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2986  glycoside hydrolase family protein  47.84 
 
 		 605 aa  555  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.609071 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1340  glycoside hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2873  glycoside hydrolase 15-related  48.84 
 
 		 608 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637072  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1028  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.111338  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5016  glycoside hydrolase 15-related  49.75 
 
 		 620 aa  552  1e-156  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0838  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1181  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1189  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.9496  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0311  glycosy hydrolase family protein  49.15 
 
 		 610 aa  552  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3320  glycoside hydrolase 15-related  49.15 
 
 		 610 aa  548  1e-155  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.147589 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0974  glycosy hydrolase family protein  48.81 
 
 		 665 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1406  glycoside hydrolase 15-related protein  48.83 
 
 		 601 aa  549  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.334429 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2373  glycoside hydrolase 15-related  48.58 
 
 		 596 aa  548  1e-155  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3119  glycosyl hydrolase, family 15  48.22 
 
 		 605 aa  547  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0769806  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1955  glycoside hydrolase 15-related protein  50.94 
 
 		 598 aa  545  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.172599 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1889  glycoside hydrolase 15-related  48.45 
 
 		 628 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.510271 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2221  glycoside hydrolase 15-related  48.86 
 
 		 629 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.47464  normal  0.0451069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4178  glycoside hydrolase 15-related  49.32 
 
 		 602 aa  540  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4500  glycoside hydrolase 15-related  48.2 
 
 		 619 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3220  glycoside hydrolase 15-related  50.25 
 
 		 602 aa  538  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2497  glycoside hydrolase 15-related  49.83 
 
 		 596 aa  536  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0866572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4175  glycoside hydrolase 15-related  47.67 
 
 		 593 aa  532  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0491982  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3385  glycoside hydrolase 15-related  48.52 
 
 		 614 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.371631 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3442  glycoside hydrolase 15-related protein  49.07 
 
 		 597 aa  535  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4963  glycoside hydrolase 15-related  48.03 
 
 		 619 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0703179  normal  0.140371 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1238  glycoside hydrolase 15-like protein  50.17 
 
 		 616 aa  530  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428683  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5958  glycoside hydrolase 15-related protein  48.23 
 
 		 586 aa  520  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0250312  normal  0.0449084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0096  glycoside hydrolase 15-related  48.37 
 
 		 600 aa  519  1e-146  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.258248  normal  0.0366909 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3331  glycoside hydrolase 15-related  47 
 
 		 601 aa  513  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1271  glycoside hydrolase 15-related protein  47.29 
 
 		 594 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6570  glycoside hydrolase 15-related  47.43 
 
 		 592 aa  510  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2304  glycoside hydrolase 15-related  45.21 
 
 		 629 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.275031 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6284  glycoside hydrolase 15-related  46.75 
 
 		 592 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00160036 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2309  glycoside hydrolase 15-like protein  44.39 
 
 		 627 aa  488  1e-137  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.451271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3645  glycoside hydrolase 15-related  45.66 
 
 		 598 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5504  glycoside hydrolase 15-related  46.09 
 
 		 596 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.143317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0495  glycoside hydrolase 15-related  44.27 
 
 		 850 aa  486  1e-136  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0709785  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2093  glycoside hydrolase 15-related  48.17 
 
 		 727 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0708631 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02887  glycosyl hydrolase, family 15  46.15 
 
 		 599 aa  479  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1797  glycoside hydrolase 15-related  44.12 
 
 		 598 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.572584  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4041  glycoside hydrolase 15-related  43.78 
 
 		 626 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1828  glycoside hydrolase 15-related protein  44.17 
 
 		 605 aa  449  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0799869  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2323  glycoside hydrolase 15-related  43.34 
 
 		 589 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.286494  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4302  glycoside hydrolase 15-related protein  43.05 
 
 		 593 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13050  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.1 
 
 		 604 aa  422  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0136013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20130  glycosyl hydrolase, glucoamylase  41.68 
 
 		 643 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.937874  normal  0.58704 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1950  glycoside hydrolase 15-related protein  42.59 
 
 		 629 aa  417  9.999999999999999e-116  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03970  glycosyl hydrolase, glucoamylase  39.84 
 
 		 639 aa  410  1e-113  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2053  glycoside hydrolase 15-like protein  39.64 
 
 		 612 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.440439  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2754  glycoside hydrolase 15-related  40.13 
 
 		 607 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.285635  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0375  glycoside hydrolase 15-related protein  39.1 
 
 		 636 aa  398  1e-109  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1584  glycoside hydrolase 15-related  38.04 
 
 		 632 aa  392  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.512555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0662  glycoside hydrolase 15-related  39.12 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.98691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0636  glycoside hydrolase 15-related  38.88 
 
 		 596 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.252902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2298  glycoside hydrolase family protein  38.37 
 
 		 608 aa  375  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000521372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2035  glycoside hydrolase 15-related protein  39.36 
 
 		 595 aa  373  1e-102  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00585031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1617  glycoside hydrolase  38.84 
 
 		 612 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3193  glycoside hydrolase 15-related  39.63 
 
 		 621 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3314  glycoside hydrolase 15-related  39.26 
 
 		 617 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1262  glycoside hydrolase 15-related  40.2 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.212074  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0900  glycoside hydrolase 15-related  38.35 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2493  glycosyl hydrolase, family 15  37.9 
 
 		 608 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1839  glycoside hydrolase 15-like protein  37.73 
 
 		 609 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3391  glycoside hydrolase 15-related  38.93 
 
 		 617 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17860  glycosyl hydrolase, glucoamylase  38.04 
 
 		 627 aa  363  4e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6083  glycoside hydrolase 15-related  37.39 
 
 		 619 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2631  glycoside hydrolase 15-related protein  39.64 
 
 		 610 aa  362  1e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.85517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0982  glycoside hydrolase 15-related protein  38.2 
 
 		 611 aa  362  1e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2637  glycoside hydrolase 15-related  37.09 
 
 		 612 aa  358  9.999999999999999e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.872982  normal  0.317086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>