163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6298 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_5818  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  53.37 
 
 
625 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.412169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6298  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  100 
 
 
647 aa  1330    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2454  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  35.86 
 
 
595 aa  321  3e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0525399  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0930  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like  34.19 
 
 
547 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.280789  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0461  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  38.3 
 
 
550 aa  285  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3229  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.28 
 
 
588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1029  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  34.97 
 
 
594 aa  263  6.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.928665 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3241  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  33.7 
 
 
587 aa  247  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.972915  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2383  peptidase S15  32.33 
 
 
571 aa  242  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2359  X-Pro dipeptidyl-peptidase-like protein  32.14 
 
 
595 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.10843  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2493  peptidase S15  34.62 
 
 
576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194166  normal  0.10324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0815  hydrolase CocE/NonD family protein  32.86 
 
 
557 aa  223  9.999999999999999e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.560842  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5030  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  30.57 
 
 
524 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0204968  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0938  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  30.25 
 
 
611 aa  193  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.274521  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2049  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.95 
 
 
577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.641906  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4699  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.73 
 
 
542 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401259  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2381  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.98 
 
 
580 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.241656  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2887  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  29.77 
 
 
561 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000279173  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2618  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.53 
 
 
550 aa  180  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00039845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04480  putative hydrolase, CocE/NonD family  28.7 
 
 
653 aa  179  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000670988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2820  peptidase S15  27.94 
 
 
638 aa  175  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139695  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3354  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  29.27 
 
 
546 aa  174  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417425  normal  0.0112773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3231  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  28.17 
 
 
534 aa  170  6e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5310  peptidase S15  26.52 
 
 
542 aa  169  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2792  peptidase S15  25.45 
 
 
641 aa  169  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.185507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3981  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  27.85 
 
 
529 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12813  hydrolase  29.82 
 
 
549 aa  167  4e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282516  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3209  peptidase S15  29.97 
 
 
670 aa  167  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0955125  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4135  peptidase S15  26.7 
 
 
541 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.427793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4266  peptidase S15  26.95 
 
 
553 aa  167  8e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220247  normal  0.302164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4096  peptidase S15  26.7 
 
 
541 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2091  peptidase S15  29.9 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2137  peptidase S15  29.9 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0310886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2074  peptidase S15  29.9 
 
 
551 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.1612  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2610  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  28.39 
 
 
629 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.754781  normal  0.576351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0437  peptidase S15  26.89 
 
 
540 aa  165  3e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.196704 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2464  peptidase S15  28.78 
 
 
700 aa  159  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.767373  normal  0.647633 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1894  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.54 
 
 
545 aa  158  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00645212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1253  X-Pro dipeptidyl-peptidase  28.07 
 
 
663 aa  157  8e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2913  hydrolase CocE/NonD family protein  26.56 
 
 
677 aa  156  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.116315 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1482  peptidase S15  28.83 
 
 
537 aa  154  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.969537  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00338  alpha-amino acid ester hydrolase  26.32 
 
 
637 aa  153  8.999999999999999e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.015152  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08460  putative hydrolase, CocE/NonD family  28.1 
 
 
673 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.8708  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3107  peptidase S15  28.15 
 
 
641 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0827659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2367  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  27.58 
 
 
645 aa  151  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3127  peptidase S15  27.39 
 
 
571 aa  150  5e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.582625  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1582  peptidase S15  26.28 
 
 
617 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0600255 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1942  putative acyl esterase  26.95 
 
 
558 aa  150  7e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.395341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3711  peptidase S15  25.76 
 
 
625 aa  150  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1723  peptidase S15  27.83 
 
 
677 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.463427  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1942  peptidase S15  26.27 
 
 
670 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1361  hydrolase CocE/NonD family protein  27.24 
 
 
674 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.307565  normal  0.298567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1252  peptidase S15  26.57 
 
 
667 aa  146  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.680341  normal  0.327656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2322  peptidase S15  28.82 
 
 
545 aa  146  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105402  normal  0.0430991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0314  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.1 
 
 
666 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.820883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3839  peptidase S15  24.91 
 
 
670 aa  145  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1596  peptidase S15  26.25 
 
 
679 aa  145  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0594  hypothetical protein  27.23 
 
 
558 aa  144  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000382895  normal  0.552928 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0908  peptidase S15  27.21 
 
 
680 aa  143  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2184  peptidase S15  26.23 
 
 
665 aa  143  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.173724 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2785  peptidase S15  27.57 
 
 
668 aa  143  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08881  Alpha-amino acid ester hydrolase  26.07 
 
 
618 aa  142  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.244959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3451  peptidase S15  27.07 
 
 
637 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1500  peptidase S15  28.08 
 
 
678 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3228  peptidase S15  27.44 
 
 
627 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.46374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4032  peptidase S15  27.8 
 
 
544 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.410328 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0184  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.74 
 
 
568 aa  140  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.959604  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4503  peptidase S15  25.86 
 
 
667 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628764  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3814  peptidase S15  26.67 
 
 
650 aa  138  3.0000000000000003e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0281034 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0309  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  26.27 
 
 
663 aa  136  9.999999999999999e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4235  peptidase S15  26.6 
 
 
537 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.59607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2349  peptidase S15  25.65 
 
 
690 aa  135  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0343  glutaryl-7-ACA acylase precursor  25.85 
 
 
660 aa  134  3.9999999999999996e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00753978  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3450  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain-containing protein  24.88 
 
 
643 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2221  peptidase S15  26 
 
 
677 aa  134  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3347  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  26.94 
 
 
570 aa  132  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8686  peptidase S15  26.8 
 
 
529 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0391  peptidase S15  26.33 
 
 
668 aa  131  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2060  dipeptidyl-peptidase  24.56 
 
 
670 aa  131  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6422  peptidase S15  25.65 
 
 
667 aa  130  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0843885  normal  0.16357 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1900  peptidase S15  24.41 
 
 
705 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138312  hitchhiker  0.00100576 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1680  dipeptidyl-peptidase  24.31 
 
 
670 aa  128  3e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2030  peptidase S15  27.2 
 
 
547 aa  126  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.743572  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0413  peptidase S15  27.43 
 
 
690 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.928819 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1111  peptidase S15  25.39 
 
 
677 aa  123  9e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0930  peptidase S15  25.61 
 
 
714 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.674729  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0936  peptidase S15  26.44 
 
 
704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.311153  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0819  peptidase S15  25.12 
 
 
674 aa  120  7.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.156634  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1103  peptidase S15  26.63 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.734312  normal  0.309388 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1711  peptidase S15  27.04 
 
 
548 aa  118  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.483969  normal  0.79803 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2093  peptidase S15  24.69 
 
 
668 aa  118  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.418145 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4789  peptidase S15  29 
 
 
499 aa  114  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18391  acyl esterase  24.8 
 
 
547 aa  115  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1770  peptidase S15  24.41 
 
 
668 aa  114  5e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.836386 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0774  X-Pro dipeptidyl-peptidase domain protein  24.05 
 
 
576 aa  114  7.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000168063 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1945  peptidase S15  29.21 
 
 
630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18520  putative hydrolase, CocE/NonD family  22.95 
 
 
534 aa  112  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.327698  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06111  acyl esterase  22.27 
 
 
524 aa  106  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.514826  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2869  peptidase S15  24.37 
 
 
644 aa  106  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0241  peptidase S15  24.09 
 
 
673 aa  103  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>