More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6242 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  79.5 
 
 		 440 aa  665    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  79.5 
 
 		 439 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1384  major facilitator transporter  78.59 
 
 		 439 aa  653    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  79.73 
 
 		 439 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1344  major facilitator transporter  78.59 
 
 		 439 aa  653    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6242  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 439 aa  867    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  79.73 
 
 		 439 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  79.73 
 
 		 439 aa  675    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  66.9 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  49.41 
 
 		 437 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  41.33 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  41.57 
 
 		 449 aa  343  4e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  41.13 
 
 		 453 aa  342  8e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 453 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  41.13 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  41.13 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  41.13 
 
 		 453 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  41.13 
 
 		 453 aa  340  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  41.39 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  42.72 
 
 		 427 aa  332  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2852  major facilitator transporter  40.75 
 
 		 438 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437146  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2837  major facilitator family transporter  40.24 
 
 		 436 aa  316  5e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00238614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2945  major facilitator transporter  39.31 
 
 		 436 aa  316  7e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2435  major facilitator transporter  43.03 
 
 		 431 aa  314  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3154  major facilitator transporter  40 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2651  major facilitator family transporter  40.32 
 
 		 447 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2158  major facilitator transporter  40.62 
 
 		 447 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  40.28 
 
 		 432 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  41.03 
 
 		 431 aa  285  8e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0027  d-galactonate transporter  34.21 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104375  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03574  D-galactonate transporter  33.09 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0012  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3903  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03518  hypothetical protein  33.09 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4199  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 445 aa  248  1e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4055  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  36.05 
 
 		 446 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 446 aa  247  3e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1094  d-galactonate transporter  33.25 
 
 		 430 aa  247  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  36.47 
 
 		 449 aa  246  4e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  35.31 
 
 		 448 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0012  d-galactonate transporter  33.41 
 
 		 430 aa  246  8e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4160  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4218  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3988  major facilitator superfamily MFS_1  32.73 
 
 		 442 aa  244  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74321  normal  0.0290381 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4111  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.748063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4122  D-galactonate transporter  36.06 
 
 		 436 aa  240  5e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1161  major facilitator transporter  35.15 
 
 		 435 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0010  d-galactonate transporter  33.41 
 
 		 430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.661181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0045  d-galactonate transporter  33.73 
 
 		 430 aa  232  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1990  D-galactonate transporter  35.1 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0023647  normal  0.0470104 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1539  probable glucarate transporter  32.87 
 
 		 453 aa  231  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.21091  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1357  major facilitator transporter  35.84 
 
 		 436 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0684607 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0885  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  35.84 
 
 		 456 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  35.49 
 
 		 425 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5810  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.491735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3875  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4153  major facilitator transporter  36.07 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.25615  normal  0.56292 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4494  major facilitator transporter  35.99 
 
 		 436 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51310  D-galactonate transporter  34.36 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  39.76 
 
 		 416 aa  223  4.9999999999999996e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0666  d-galactonate transporter  33.49 
 
 		 447 aa  223  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2645  major facilitator transporter  32.43 
 
 		 466 aa  223  7e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3829  D-galactonate transporter  33.18 
 
 		 454 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4539  d-galactonate transporter  33.18 
 
 		 454 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.327531  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5765  d-galactonate transporter  32.94 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  35.27 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2180  MFS transporter, phthalate permease family  35.25 
 
 		 478 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.256774  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  33.09 
 
 		 419 aa  221  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6033  major facilitator transporter  35.52 
 
 		 467 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0945  major facilitator superfamily MFS_1  30.56 
 
 		 453 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.912804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1467  major facilitator superfamily MFS_1  36.32 
 
 		 443 aa  218  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1306  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 454 aa  218  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.599836 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4570  major facilitator superfamily MFS_1  35.08 
 
 		 458 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2845  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 449 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.498164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3065  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0236  major facilitator transporter  32.88 
 
 		 446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5302  major facilitator transporter  33.86 
 
 		 447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0397633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4628  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 447 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.563971  hitchhiker  0.000103132 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0829  D-galactonate transporter  31.6 
 
 		 468 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.017326  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02992  predicted (D)-galactarate transporter  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0578  d-galactonate transporter  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4439  galactarate permease GarP  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.333242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3316  galactarate permease GarP  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3605  galactarate permease GarP  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0573  d-galactonate transporter  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02943  hypothetical protein  31.96 
 
 		 444 aa  212  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4966  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 447 aa  210  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.051147 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5194  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 479 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  35.45 
 
 		 436 aa  211  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3422  galactarate permease GarP  31.96 
 
 		 444 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3336  major facilitator transporter  33.25 
 
 		 464 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5549  major facilitator transporter  34.17 
 
 		 450 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.408354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2776  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 461 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5174  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 469 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4121  major facilitator transporter  31.86 
 
 		 455 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.801811 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4121  major facilitator transporter  32.94 
 
 		 463 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503182 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>