More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5816 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0634  major facilitator transporter  74.1 
 
 		 461 aa  679    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2553  major facilitator family transporter  74.22 
 
 		 457 aa  690    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0427116  decreased coverage  0.00798136 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5790  major facilitator superfamily MFS_1  66.95 
 
 		 477 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.339463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4438  major facilitator transporter  72.94 
 
 		 464 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.357208  normal  0.925745 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3319  major facilitator superfamily MFS_1  76.34 
 
 		 469 aa  729    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4413  major facilitator superfamily MFS_1  74.07 
 
 		 461 aa  702    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.906196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0121  major facilitator superfamily MFS_1  76.42 
 
 		 468 aa  717    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0299314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3162  major facilitator transporter  74.44 
 
 		 457 aa  690    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.688084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5816  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 468 aa  937    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.349561 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4303  major facilitator superfamily MFS_1  74.07 
 
 		 461 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.625349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6411  major facilitator transporter  71.52 
 
 		 461 aa  691    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0190  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  70.64 
 
 		 459 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2224  major facilitator transporter  74.44 
 
 		 457 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0671964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3363  major facilitator transporter  74.44 
 
 		 457 aa  693    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.124155  normal  0.451531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4754  major facilitator transporter  73.18 
 
 		 467 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.108309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5797  major facilitator transporter  64.52 
 
 		 477 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5800  major facilitator superfamily MFS_1  65.64 
 
 		 477 aa  621  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000483558  normal  0.391929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2248  major facilitator superfamily MFS_1  67.99 
 
 		 463 aa  599  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169754  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2371  major facilitator transporter  68.33 
 
 		 406 aa  568  1e-161  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.363547  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0102  major facilitator superfamily MFS_1  53.41 
 
 		 456 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5092  major facilitator superfamily MFS_1  47.56 
 
 		 493 aa  385  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8642  major facilitator superfamily MFS_1  46.6 
 
 		 453 aa  366  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0117  major facilitator superfamily MFS_1  45.24 
 
 		 444 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2329  major facilitator superfamily MFS_1  41.81 
 
 		 452 aa  340  2.9999999999999998e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.126091  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3858  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4082  major facilitator transporter  41.36 
 
 		 439 aa  333  4e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2289  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 458 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21518  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3484  major facilitator transporter  41.72 
 
 		 468 aa  333  6e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3499  major facilitator transporter  42.13 
 
 		 442 aa  311  2e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  39.62 
 
 		 450 aa  298  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  38.8 
 
 		 446 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  37.92 
 
 		 447 aa  267  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  37.33 
 
 		 482 aa  258  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  33.72 
 
 		 430 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.39 
 
 		 447 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  36.24 
 
 		 440 aa  251  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  36.07 
 
 		 443 aa  250  5e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.73 
 
 		 437 aa  246  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  36.82 
 
 		 455 aa  246  9e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  37.26 
 
 		 466 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  39.13 
 
 		 438 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  36.67 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 		 465 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0251  shikimate transporter  37.04 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0249  shikimate transporter  37.04 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0233  shikimate transporter  37.04 
 
 		 433 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.30942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  36.77 
 
 		 433 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  32.67 
 
 		 447 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0236  shikimate transporter  36.24 
 
 		 433 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  31.29 
 
 		 470 aa  236  4e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  37.56 
 
 		 441 aa  236  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  36.03 
 
 		 447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5782  major facilitator superfamily MFS_1  38.17 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  32.96 
 
 		 457 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  36.25 
 
 		 463 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  36.25 
 
 		 463 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  36.25 
 
 		 463 aa  235  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  35.94 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  36.76 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  33.96 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  36.76 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  36.76 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  37.57 
 
 		 442 aa  233  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  37.5 
 
 		 468 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02410  Major Facilitator Superfamily transporter  32.9 
 
 		 467 aa  232  8.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.277787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  36.02 
 
 		 628 aa  232  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 437 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  31.36 
 
 		 470 aa  232  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  37.12 
 
 		 437 aa  231  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  35.33 
 
 		 456 aa  230  5e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 439 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  39.11 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  35.77 
 
 		 461 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  32.47 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  32.47 
 
 		 435 aa  228  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  37.14 
 
 		 438 aa  227  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  33.68 
 
 		 441 aa  227  4e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  32.73 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  35.57 
 
 		 461 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  32.73 
 
 		 435 aa  227  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2064  major facilitator transporter  42.11 
 
 		 436 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  35.29 
 
 		 433 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  36.05 
 
 		 439 aa  226  6e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  32.73 
 
 		 435 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  32.75 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1621  inner membrane metabolite transport protein ydfJ  34.36 
 
 		 455 aa  225  1e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00533306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4509  General substrate transporter  35.83 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  36.89 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  32.55 
 
 		 434 aa  225  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4107  major facilitator superfamily MFS_1  36.9 
 
 		 458 aa  224  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  36.24 
 
 		 452 aa  225  2e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  36.43 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 450 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1934  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  35.46 
 
 		 459 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.307592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  32.22 
 
 		 435 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1346  major facilitator superfamily MFS_1  34.41 
 
 		 472 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.63119  normal  0.345999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  36.59 
 
 		 439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  36.32 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>