More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5743 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 461 aa  908    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  51.49 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  46.49 
 
 		 450 aa  413  1e-114  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  49.43 
 
 		 439 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  48.69 
 
 		 468 aa  402  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5847  major facilitator transporter  46.8 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7098  major facilitator transporter  47.16 
 
 		 456 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  48.74 
 
 		 442 aa  395  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  47.66 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  48.1 
 
 		 433 aa  396  1e-109  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 439 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  45.81 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.53 
 
 		 437 aa  394  1e-108  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  48.8 
 
 		 439 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  48.92 
 
 		 439 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 439 aa  388  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6236  major facilitator transporter  46.92 
 
 		 454 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.6 
 
 		 437 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  48.43 
 
 		 439 aa  386  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  45.77 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5966  major facilitator transporter  47.69 
 
 		 457 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8515  putative transport protein  47.93 
 
 		 438 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.541584  normal  0.8077 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  46.3 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4830  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 442 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00000135827  hitchhiker  0.00785352 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  45.39 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  45.48 
 
 		 431 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  43.94 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  44.6 
 
 		 430 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3902  major facilitator transporter  45.8 
 
 		 441 aa  363  4e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0325  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0335  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.280682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0314  major facilitator transporter  47.1 
 
 		 457 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2899  major facilitator superfamily transporter  45.45 
 
 		 430 aa  361  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872832  normal  0.0447216 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1613  major facilitator superfamily protein  44.75 
 
 		 482 aa  360  3e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1778  major facilitator transporter  48.62 
 
 		 452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  45 
 
 		 438 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3446  major facilitator superfamily MFS_1  44.95 
 
 		 435 aa  355  8.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.195476  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1047  major facilitator transporter  45.47 
 
 		 451 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  43.71 
 
 		 439 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 439 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 460 aa  353  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 435 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 445 aa  352  7e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  42.08 
 
 		 456 aa  352  7e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 445 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  45.12 
 
 		 460 aa  351  1e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  45.81 
 
 		 445 aa  352  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  45.35 
 
 		 445 aa  351  2e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  44.91 
 
 		 438 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  43.48 
 
 		 439 aa  350  3e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  43.25 
 
 		 439 aa  350  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  40.8 
 
 		 484 aa  348  8e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  45.81 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  43.36 
 
 		 447 aa  348  1e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  46.22 
 
 		 437 aa  346  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  42.73 
 
 		 463 aa  346  5e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4108  major facilitator family transporter  42.15 
 
 		 449 aa  344  1e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.073539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4135  general substrate transporter  42.15 
 
 		 449 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  44.39 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19080  arabinose efflux permease family protein  45.21 
 
 		 443 aa  343  4e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.297545  normal  0.79631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  42.99 
 
 		 465 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4866  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 445 aa  342  5.999999999999999e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.778964 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  42.15 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  42.15 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  42.15 
 
 		 461 aa  342  7e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  43.23 
 
 		 446 aa  341  1e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4283  major facilitator transporter  44.22 
 
 		 460 aa  341  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.445263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  47.79 
 
 		 437 aa  342  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  43.95 
 
 		 445 aa  339  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  44.16 
 
 		 430 aa  338  9.999999999999999e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38440  Major Facilitator Superfamily transporter  44.02 
 
 		 442 aa  337  3.9999999999999995e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8895  General substrate transporter  41.61 
 
 		 455 aa  336  5e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  45.18 
 
 		 441 aa  335  7e-91  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  40.44 
 
 		 458 aa  335  1e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3334  major facilitator superfamily protein  46.03 
 
 		 439 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.998489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5948  major facilitator transporter  45.01 
 
 		 442 aa  333  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5975  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  44.29 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2127  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  45.2 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3837  major facilitator superfamily MFS_1  43.89 
 
 		 437 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.550889  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3897  general substrate transporter  45.16 
 
 		 436 aa  331  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  39.1 
 
 		 450 aa  330  4e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  43.34 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2383  major facilitator transporter  42.07 
 
 		 441 aa  329  6e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  43.34 
 
 		 435 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6220  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2033  major facilitator transporter  46.06 
 
 		 434 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.880129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4210  major facilitator superfamily MFS_1  48.09 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.199459  normal  0.07307 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  42.21 
 
 		 443 aa  327  3e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4765  major facilitator transporter  42.27 
 
 		 442 aa  327  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  42.86 
 
 		 435 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 450 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  40.45 
 
 		 459 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  45.32 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  43.65 
 
 		 450 aa  325  1e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0233  major facilitator family transporter  43.36 
 
 		 433 aa  325  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0442983  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  40.7 
 
 		 459 aa  325  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.393625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>