More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5741 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1595  hydroxyglutarate oxidase  81.16 
 
 		 397 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000325765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5741  hydroxyglutarate oxidase  100 
 
 		 398 aa  824    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0042  hydroxyglutarate oxidase  65.74 
 
 		 398 aa  555  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.711418  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0036  hydroxyglutarate oxidase  64.9 
 
 		 397 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.925555  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4036  hydroxyglutarate oxidase  63.64 
 
 		 403 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.534482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  62.34 
 
 		 409 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  60.41 
 
 		 399 aa  498  1e-140  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1005  hydroxyglutarate oxidase  62.09 
 
 		 410 aa  497  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.127914  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3234  FAD dependent oxidoreductase  61.54 
 
 		 400 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0947  hydroxyglutarate oxidase  61.83 
 
 		 410 aa  491  9.999999999999999e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2794  hydroxyglutarate oxidase  58.42 
 
 		 407 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.553483  normal  0.530212 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1130  hydroxyglutarate oxidase  60.2 
 
 		 403 aa  485  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  59.24 
 
 		 410 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  58.73 
 
 		 408 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2738  hydroxyglutarate oxidase  55.81 
 
 		 416 aa  467  9.999999999999999e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.368642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  58.16 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  57.65 
 
 		 416 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  57.65 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1995  hydroxyglutarate oxidase  57.65 
 
 		 425 aa  439  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2970  hydroxyglutarate oxidase  55.87 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0184807 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2903  hydroxyglutarate oxidase  55.61 
 
 		 422 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2934  hydroxyglutarate oxidase  55.36 
 
 		 422 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.23592  normal  0.213528 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3091  hydroxyglutarate oxidase  55.61 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.854212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2987  hydroxyglutarate oxidase  55.87 
 
 		 422 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0612118  normal  0.154389 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  54.34 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  54.59 
 
 		 422 aa  429  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  54.34 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  54.34 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  54.08 
 
 		 422 aa  426  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  54.34 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  54.34 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  54.34 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  54.34 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  52.03 
 
 		 396 aa  420  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  50 
 
 		 402 aa  412  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0469  hydroxyglutarate oxidase  51.02 
 
 		 406 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2121  hydroxyglutarate oxidase  51.02 
 
 		 396 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.110879  normal  0.696604 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  49.49 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  48.21 
 
 		 407 aa  393  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  47.7 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26830  hypothetical protein  75.1 
 
 		 245 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5186  hydroxyglutarate oxidase  48.72 
 
 		 404 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  47.96 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3423  FAD dependent oxidoreductase  46.29 
 
 		 400 aa  365  1e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1660  dehydrogenase  46.55 
 
 		 625 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4590  FAD dependent oxidoreductase  48.08 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  46.7 
 
 		 401 aa  352  5e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  46.43 
 
 		 403 aa  351  1e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  45.96 
 
 		 409 aa  351  2e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  43.86 
 
 		 398 aa  349  5e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2522  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  46.58 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0216497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2624  FAD dependent oxidoreductase  45.56 
 
 		 442 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3598  FAD dependent oxidoreductase  42.82 
 
 		 399 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.283414 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1187  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  46.56 
 
 		 390 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.120282 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2614  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  45.69 
 
 		 396 aa  335  1e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0119  FAD dependent oxidoreductase  46.3 
 
 		 395 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  44.88 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1888  hydroxyglutarate oxidase  41.71 
 
 		 427 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3277  FAD dependent oxidoreductase  45.71 
 
 		 396 aa  318  7e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.289099  normal  0.220627 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3531  FAD dependent oxidoreductase  44.61 
 
 		 406 aa  318  1e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1941  FAD dependent oxidoreductase  44.44 
 
 		 412 aa  317  2e-85  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8880  hypothetical protein  44.33 
 
 		 396 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0769827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2220  hydroxyglutarate oxidase  40.48 
 
 		 427 aa  306  3e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.531505  normal  0.0413594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3046  FAD dependent oxidoreductase  42.42 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.095934  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0034  hydroxyglutarate oxidase  44.71 
 
 		 408 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0204  hydroxyglutarate oxidase  42.46 
 
 		 402 aa  292  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.12826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  43.17 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2590  FAD dependent oxidoreductase  38.79 
 
 		 400 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14181  dehydrogenase  34.76 
 
 		 400 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3667  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 		 405 aa  194  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2053  FAD dependent oxidoreductase  33.83 
 
 		 406 aa  193  5e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2040  FAD-dependent oxidoreductase  32.59 
 
 		 408 aa  192  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.985814  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0069  aminobutyraldehyde dehydrogenase  32.59 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2542  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  32.43 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0189  FAD dependent oxidoreductase  33.5 
 
 		 405 aa  186  8e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2197  FAD dependent oxidoreductase  32.31 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000547368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2022  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 		 399 aa  177  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.426745  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0409  FAD dependent oxidoreductase  26.35 
 
 		 437 aa  167  2e-40  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.218758 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.09 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.09 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.09 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.09 
 
 		 373 aa  150  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 373 aa  149  8e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32.09 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.09 
 
 		 373 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  30.92 
 
 		 370 aa  147  3e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  32.36 
 
 		 368 aa  145  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  31.59 
 
 		 373 aa  144  4e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 		 364 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1090  FAD dependent oxidoreductase  29.27 
 
 		 378 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.151516  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  29.9 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  35.14 
 
 		 368 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6841  NAD binding site FAD dependent oxidoreductase  29.21 
 
 		 367 aa  137  4e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 		 369 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2496  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  30.17 
 
 		 383 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>