More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5698 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  94.22 
 
 		 415 aa  671    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 415 aa  799    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  66.34 
 
 		 418 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 422 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  42.43 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  40.48 
 
 		 408 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  40.36 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  40.36 
 
 		 408 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  40.05 
 
 		 413 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  39.21 
 
 		 399 aa  257  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  39.84 
 
 		 407 aa  250  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  40.51 
 
 		 406 aa  245  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  39.94 
 
 		 402 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  40.65 
 
 		 390 aa  226  7e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  42.51 
 
 		 394 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 401 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  35.77 
 
 		 401 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  39.33 
 
 		 403 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 403 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  38.38 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0860  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 397 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  38.79 
 
 		 379 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  41.26 
 
 		 735 aa  209  7e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  34.69 
 
 		 404 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  39.03 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  38.2 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 400 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  37.22 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  37.33 
 
 		 399 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  37.5 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  33.42 
 
 		 392 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  35.62 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 404 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 400 aa  196  5.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  36.51 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  35.44 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  36.1 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  32.53 
 
 		 412 aa  192  8e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  32.53 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  32.53 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  32.53 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  32.53 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  32.53 
 
 		 451 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  32.53 
 
 		 394 aa  191  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  33.86 
 
 		 433 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  32.7 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 403 aa  187  4e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  32.25 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0890  major facilitator transporter  35.69 
 
 		 388 aa  186  6e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0309289 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  36.46 
 
 		 410 aa  186  6e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  32.6 
 
 		 396 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 397 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  34.02 
 
 		 402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  33.5 
 
 		 397 aa  184  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  33.8 
 
 		 400 aa  184  3e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 403 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  32.32 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  34.25 
 
 		 384 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  36.34 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  34.04 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  36.11 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  35.25 
 
 		 376 aa  180  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 401 aa  180  4.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  33.24 
 
 		 398 aa  179  5.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  33.07 
 
 		 420 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  35 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  32.99 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  35 
 
 		 398 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  31.94 
 
 		 411 aa  176  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  31.77 
 
 		 398 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  35.92 
 
 		 376 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0282  inner membrane transport protein YdhP  32.48 
 
 		 391 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.873029  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  36.21 
 
 		 402 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  34.42 
 
 		 397 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0427  major facilitator superfamily MFS_1  35.69 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.064985  normal  0.054119 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0295  inner membrane transport protein YdhP  32.23 
 
 		 391 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  33.58 
 
 		 408 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0301  inner membrane transport protein YdhP  32.48 
 
 		 391 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  32.13 
 
 		 391 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  34.43 
 
 		 400 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  33.8 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  32.48 
 
 		 391 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1543  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 387 aa  159  7e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.329427  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3898  major facilitator superfamily MFS_1  32.43 
 
 		 404 aa  158  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82159  normal  0.735977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  32.78 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0906  major facilitator transporter  31.79 
 
 		 391 aa  156  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22240  arabinose efflux permease family protein  32.82 
 
 		 409 aa  155  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  31.11 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  31.11 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  31.11 
 
 		 396 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5955  sugar efflux transporter  30.27 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0541401 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  31.11 
 
 		 396 aa  154  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2718  major facilitator superfamily MFS_1  33.15 
 
 		 403 aa  154  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00439118  normal  0.195622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>