More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5660 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5660  ferredoxin  100 
 
 		 103 aa  209  9e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.926642 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1074  ferredoxin-(2Fe-2S)-binding protein  91.09 
 
 		 120 aa  190  5e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.103168 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3640  ferredoxin  73.96 
 
 		 105 aa  159  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4923  ferredoxin  72.92 
 
 		 100 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.60613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4404  ferredoxin  72.92 
 
 		 100 aa  157  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.103484 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5307  ferredoxin  70.71 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.786726  normal  0.0713222 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3387  ferredoxin  70.71 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.864897  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4980  ferredoxin  70.71 
 
 		 100 aa  155  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.786925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0697  ferredoxin  69.7 
 
 		 100 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.812143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3428  ferredoxin  73.63 
 
 		 129 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.883916  normal  0.379266 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1820  2Fe-2S iron-sulfur  72.53 
 
 		 96 aa  140  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0888  2Fe-2S iron-sulfur  71.43 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225976  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2159  2Fe-2S iron-sulfur  71.43 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0798  iron-sulfur cluster-binding protein  71.43 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.156035  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3652  ferredoxin  56.67 
 
 		 93 aa  114  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3434  ferredoxin  61.18 
 
 		 110 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1368  ferredoxin  57 
 
 		 108 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1286  ferredoxin  60.98 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2756  ferredoxin  51.65 
 
 		 111 aa  94.7  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.108856 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1389  ferredoxin  50.54 
 
 		 97 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5112  ferredoxin  53.01 
 
 		 108 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.528807  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3824  putative ferredoxin  60.49 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.232359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2469  ferredoxin  45.88 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.165462  normal  0.348757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2234  ferredoxin  51.19 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0280079  hitchhiker  0.000426891 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2255  ferredoxin  57.14 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2765  ferredoxin  57.14 
 
 		 97 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174551  normal  0.655324 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00333  phenol hydroxylase  40.24 
 
 		 89 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002101  ferredoxin  40.24 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000061516  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0554  ferredoxin (2Fe-2S)  41.94 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.569886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0537  ferredoxin (2Fe-2S)  41.94 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4058  oxidoreductase FAD-binding subunit  45.24 
 
 		 383 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0362952  normal  0.241879 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0025  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.24 
 
 		 340 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.775073  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0981  ferredoxin (2Fe-2S)  40.23 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000166855  normal  0.987662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0754  ferredoxin (2Fe-2S)  39.77 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0890  (2Fe-2S) ferredoxin  37.63 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00054006  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1380  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  41.86 
 
 		 363 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.611376  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3306  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.24 
 
 		 353 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.592709  normal  0.864162 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3903  ferredoxin (2Fe-2S)  36.56 
 
 		 121 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.832402  normal  0.566054 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0428  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  44.05 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504585  hitchhiker  0.000000000664459 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0252  CDP-6-deoxy-L-threo-D-glycero-4-hexulose-3- dehydrase reductase, putative  44.05 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00410911  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0181  (2Fe-2S) ferredoxin  38.2 
 
 		 99 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3792  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.16 
 
 		 353 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000109386  hitchhiker  0.00301341 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3204  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  41.18 
 
 		 346 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.968562  normal  0.353056 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0512  ferredoxin (2Fe-2S)  42.68 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3299  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.63 
 
 		 360 aa  60.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.553886  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14071  ferredoxin  40.45 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.116031  normal  0.0535794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2414  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2703  ferredoxin  39.02 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000163981  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42100  Ferredoxin:Oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding  39.56 
 
 		 333 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.416324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2987  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  37.65 
 
 		 350 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.651691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4192  ferredoxin  38.57 
 
 		 98 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3550  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.89 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4626  Oxidoreductase FAD-binding domain protein  37.89 
 
 		 354 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15381  ferredoxin  40.51 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.911769  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30710  Multi-component phenol hydoxylase, reductase subunit; LapP  38.95 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.431626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2793  putative reductase component of monooxygenase  38.37 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0151  putative ferredoxin  37.18 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0245789  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1450  ferredoxin (2Fe-2S)  40.51 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.463453  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15531  ferredoxin  40.51 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.443097  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1507  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  38.37 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.338028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2722  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.48 
 
 		 354 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15131  ferredoxin  39.08 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1293  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  36.67 
 
 		 354 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5685  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  35.05 
 
 		 354 aa  57.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4353  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  42.53 
 
 		 331 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0529  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0163346  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2148  ferredoxin (2Fe-2S)  39.08 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.943243  normal  0.214433 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0599  ferredoxin  37.37 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2563  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  40.48 
 
 		 345 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14011  hypothetical protein  37.37 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.908602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5188  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  45.45 
 
 		 356 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05261  ferredoxin  37.93 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1828  putative CDP-6-deoxy-delta-3,4- glucoseen reductase  41.77 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.125347 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1194  ferredoxin  38.71 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3163  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  39.02 
 
 		 336 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.141012  normal  0.450185 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0916  ferredoxin (2Fe-2S)  41.89 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2686  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  39.02 
 
 		 336 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.831402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2280  phenol hydrolase reductase  36.08 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0924  ferredoxin (2Fe-2S), plant  41.1 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3765  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  43.94 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0568  ferredoxin (2Fe-2S)  40.26 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0229344  normal  0.149468 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2581  ferredoxin (2Fe-2S)  36.78 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0668  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.1 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17801  ferredoxin  41.1 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.198374  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4724  (2Fe-2S) ferredoxin  40.79 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1261  ferredoxin  40.48 
 
 		 356 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.842707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2192  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  34.74 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269423  normal  0.977097 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2686  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.1 
 
 		 349 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3111  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  37.89 
 
 		 351 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461281  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0435  ferredoxin  39.29 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08810  Phenol hydroxylase, Ferredoxin subunit  38.82 
 
 		 353 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1490  ferredoxin (2Fe-2S)  39.74 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.404225  normal  0.317474 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0031  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  38.95 
 
 		 342 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1127  CDP-6-deoxy-delta-3,4-glucoseen reductase  35.29 
 
 		 341 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.139409  normal  0.1084 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29191  ferredoxin, PetF like protein  36.05 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2552  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding subunit  37.8 
 
 		 336 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0654  phenylacetate-CoA oxygenase/reductase, PaaK subunit  36.49 
 
 		 351 aa  55.5  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2334  oxidoreductase FAD-binding subunit  41.77 
 
 		 669 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.896317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0756  ferredoxin (2Fe-2S)  36.59 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1499  ferredoxin (2Fe-2S)  37.5 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>