More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5636 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
317 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.330167  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  92.11 
 
 
317 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.568723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2428  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  75.71 
 
 
317 aa  494  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.443713  normal  0.627473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  70.32 
 
 
315 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338666  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4987  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.66 
 
 
319 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.98 
 
 
319 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.235146  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.03 
 
 
316 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.552575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4088  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.54 
 
 
275 aa  186  5e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2868  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.19 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3142  sugar ABC transporter  32.47 
 
 
275 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.367291  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4355  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
289 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.023138  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4735  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
289 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.820737  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4441  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.69 
 
 
289 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0617645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
286 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2116  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
306 aa  176  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0307  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.59 
 
 
274 aa  176  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.03 
 
 
273 aa  176  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.12262  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2612  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.75 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3750  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.746379  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5740  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.25 
 
 
289 aa  173  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.872391  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.1 
 
 
276 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.979947 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3058  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.53 
 
 
286 aa  171  1e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03310  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.46 
 
 
288 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0050  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
305 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27380  mannitol ABC transporter permease protein  35.69 
 
 
277 aa  170  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.58 
 
 
278 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1092  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.71 
 
 
276 aa  169  8e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0121396 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7358  ABC transporter membrane spanning protein  33.23 
 
 
306 aa  168  9e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2697  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.42 
 
 
293 aa  168  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0850  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.68 
 
 
275 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.462613  normal  0.281344 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5696  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.92 
 
 
283 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.697019  normal  0.0828938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2923  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  35.99 
 
 
277 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123543  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0635  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
273 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6390  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35 
 
 
303 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.96233  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2356  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
276 aa  166  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.74 
 
 
271 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2899  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3569  ABC transporter membrane spanning protein (sorbitol/mannitol)  34.26 
 
 
276 aa  164  3e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.550263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2638  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.23 
 
 
276 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.269935  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2438  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  35.29 
 
 
277 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179424  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2705  mannitol ABC transporter, permease protein  34.83 
 
 
277 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00559467  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
276 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.576524 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34390  putative binding-protein-dependent maltose/mannitol transport protein  34.95 
 
 
277 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.020452  normal  0.455482 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4470  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
277 aa  162  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2039  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.95 
 
 
277 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830254  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1110  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.12 
 
 
274 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.721908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0549  ABC-type sugar / sn-glycerol-3-phosphate transport system permease protein ugpE  31.58 
 
 
272 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
292 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.466995  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0489  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
274 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4709  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.02 
 
 
278 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3795  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.98 
 
 
276 aa  159  5e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.898693  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2280  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.01 
 
 
280 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.326107  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0237  sugar ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
291 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.963709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0230  sugar ABC transporter, permease protein  32.87 
 
 
291 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.28 
 
 
287 aa  158  1e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.141396  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2794  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
297 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.68138  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4865  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
296 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.174421 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
272 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.598675  normal  0.72838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2013  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.11 
 
 
285 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.81  normal  0.395958 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1049  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.04 
 
 
280 aa  156  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.622209  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3667  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
296 aa  155  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2278  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.92 
 
 
275 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2170  carbohydrate ABC transporter permease  33.92 
 
 
275 aa  155  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0148377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2084  carbohydrate ABC transporter permease  33.92 
 
 
275 aa  155  9e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.101045 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4843  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
276 aa  155  9e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.967009  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5746  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.34 
 
 
278 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.91 
 
 
255 aa  155  1e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0697  mannitol ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
285 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.53 
 
 
283 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.776263  normal  0.468478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0180177  hitchhiker  0.00198196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1713  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.57 
 
 
306 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.402827 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0722  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.81 
 
 
291 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0409325  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3852  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.6 
 
 
275 aa  153  4e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0917  putative ABC transporter, permease protein  33.57 
 
 
276 aa  152  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524726  normal  0.693648 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3244  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
291 aa  152  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.05565  normal  0.793563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5924  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  32.53 
 
 
283 aa  152  8e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.755029  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1983  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
283 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.062126  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2593  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
283 aa  152  8e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.111156  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2617  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.18 
 
 
283 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644522  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3779  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.22 
 
 
274 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.639619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1037  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  32.51 
 
 
288 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4977  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.58 
 
 
288 aa  151  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0547171 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0461  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.51 
 
 
273 aa  151  1e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.136412  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4118  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  31.6 
 
 
276 aa  151  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.402616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0081  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
288 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4179  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.26 
 
 
276 aa  151  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00520375  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0878  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
288 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0633  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
288 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416543  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2467  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
288 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.688343  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1729  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.14 
 
 
276 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.11102  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0874  putative sorbitol/mannitol ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 
288 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0093  ABC sorbitol/mannitol transporter, inner membrane subunit  34.14 
 
 
276 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.121482  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0395  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.39 
 
 
277 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.230637  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7449  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  30.9 
 
 
286 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.68 
 
 
283 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.586722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7051  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
279 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.305839  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2701  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  29.8 
 
 
275 aa  149  5e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0563997  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2509  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.16 
 
 
283 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114445  normal  0.437079 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3350  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.65 
 
 
274 aa  149  7e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.610127  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0136  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33 
 
 
276 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.350375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>