196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_5484 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_5484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 212 aa  419  1e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.950879 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2869  YhfK-like protein  46.41 
 
 		 209 aa  191  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1498  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  46.89 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1359  hypothetical protein  46.89 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1365  hypothetical protein  46.89 
 
 		 209 aa  188  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.551315  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2114  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.86 
 
 		 209 aa  186  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.63768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0712  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.976883  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0563163 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1191  NAD-dependent epimerase/dehydratase  46.38 
 
 		 209 aa  177  9e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4301  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.6 
 
 		 209 aa  157  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.588565  normal  0.169405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.19 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1071  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.71 
 
 		 209 aa  150  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2944  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.62 
 
 		 212 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.44 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.07 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1226  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.62 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0293  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.01 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.572416  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.15 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02326  hypothetical protein  33.66 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.544292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2308  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.8 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2813  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.94 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1065  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.74 
 
 		 215 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09343  hypothetical protein  32.08 
 
 		 212 aa  100  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0414979  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32240  putative NADH-flavin reductase  32.39 
 
 		 214 aa  99.4  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.778097  normal  0.45843 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1754  hypothetical protein  32.73 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.843314  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2936  hypothetical protein  35 
 
 		 218 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2657  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.75 
 
 		 230 aa  93.2  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352219  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2180  hypothetical protein  30.91 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2218  hypothetical protein  30.91 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.864295  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5653  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.1 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.297602  normal  0.281198 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2748  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.65 
 
 		 218 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0203481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22830  putative NADH-flavin reductase  31.56 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181005  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3536  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1211  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  30.73 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.858868  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0623  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0193  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.41 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.296771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22250  putative NADH-flavin reductase  31.02 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3044  hypothetical protein  32.56 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2089  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0760206  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0585  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4475  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6100  histidine triad (HIT) protein  36.81 
 
 		 374 aa  78.6  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00945728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2676  hypothetical protein  32.43 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  31.71 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4424  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4805  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.16 
 
 		 219 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.638466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1655  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5510  hypothetical protein  30.28 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.325809  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1159  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.88 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3079  hypothetical protein  30.91 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5164  NmrA family protein  31.9 
 
 		 321 aa  72.4  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000496465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0474  hypothetical protein  29.27 
 
 		 214 aa  72  0.000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.84085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4317  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.29 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.416594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00500  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  29.28 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.39496  normal  0.546332 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49844  predicted protein  32.26 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22130  putative NADH-flavin reductase  28.42 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5087  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.72 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.81673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2558  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.77 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1275  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 		 238 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0108279  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1086  hypothetical protein  27.84 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.951647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2502  NmrA family protein  33.56 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.174939  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0675  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.24 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.523369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0300  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.51 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.594091 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4847  NmrA family protein  29.63 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00912445  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3236  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.468435  normal  0.127341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  34.23 
 
 		 328 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0208  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.1 
 
 		 232 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.17 
 
 		 213 aa  64.7  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.9 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.825731  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.77 
 
 		 225 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3033  NmrA family protein  30.61 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.439584 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1942  binding/catalytic/coenzyme-binding protein  28.37 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3700  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.13 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.942866  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03900  putative NADH-flavin reductase  26.61 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0627666 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1916  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  28.37 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3928  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.6 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.5 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3977  NmrA family protein  26.6 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000385201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3617  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase, putative  26.98 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.753976 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0258  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 233 aa  62  0.000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.984722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  28.64 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2296  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.28 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.432417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  28.64 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1151  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.64 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.166157  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2014  hypothetical protein  26.98 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.441743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1003  NmrA-like  26.26 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95557 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2797  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.72 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2360  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.236662  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0474  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.11 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000378302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2309  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 307 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.433346  normal  0.120516 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2704  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.83 
 
 		 308 aa  58.9  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.135035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2034  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.78 
 
 		 307 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.67 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47864  predicted protein  31.6 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.69 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.41 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152042  normal  0.193057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.12 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.415724  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>